# Motivation
Extraire les données des comptes-rendus
- EScudié et al, 2017 : 79% des comorbidites trouvées seulement dans le texte pour 740 patients
- Necker : 640 000 patients, 5M comptes-rendus
Non testé !
Source: Garselon et al, 2018 Journal of Biomedical Informatics
# Trouver des patients
# Fouille de données : phénotypage
# Fouille de données : phénotypage
Note du phénotype pour 6 malaides par un humain
Sets RETT DOCK8 deficiency LOWE SILVER RUSSELL BARDET BIEDL APDS 1 and 2
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Average Precision, ranked by TF-IDF 0.91 0.84 0.90 0.49 0.52 0.83
Couvrture orphanet 0.71 0.70 0.66 1.00 0.82 –
activated phosphoinositide 3-kinase-δ (PI3Kδ) syndrome (APDS)
Source: Garselon et al, 2018 Orphanet Journal of Rare Diseases
# Recherche: patients avec phénotype similaire (errance diagnostic)
Algorithme de similarité : Garselon et al, 2017 (Journal of Biomedical Informatics)
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Démo possible