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:ROAM_REFS: @kong2008detection
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#+title: Augustine Kong and Gisli Masson and Michael L Frigge and Arnaldur Gylfason and Pasha Zusmanovich and Gudmar Thorleifsson and Pall I Olason and Andres Ingason and Stacy Steinberg and Thorunn Rafnar and Patrick Sulem and Magali Mouy and Frosti Jonsson and Unnur Thorsteinsdottir and Daniel F Gudbjartsson and Hreinn Stefansson and Kari Stefansson :: Detection of sharing by descent, long-range phasing and haplotype imputation

Pour les familles séquencées avec SNP-array haut dentisé, cet article montre qu'il est intéressant d'utiliser des individus assez éloginées (3-20) méoides

2 individus qui sont cousins au degré n: 2(n+1) méoides donc la probab de prartage un locus IBD est 2^{-2n}

Ici, on utiliser pour phaser les haplotype  (il suffit d'avoir une région IBD)
Pour un SNP hétérozygote, il suffit de trouver un apparenté homozygote

données islandaise (35k) : un indivus partage avec 17-18 autre un IBD
Pas lu plus en détail