#+title: Antibiotiques
​#+filetags: :bactério:

* Cibles
- inhibition synthèse de la paroi bactérienne = β-lactamine, glycopeptides, fosfomycine
- synthèse ADN bactérien : quinolone, sulfamide
- synthène ARN : rifampicine
- synthèse protéines bactérienne : aminoside, macrolides, cyclines

[[./images/microbiologie/antibio-action.png]]

* Mécanisme de résistance
- enzymatique
- modification de la cible
- impermeabilité
- efflux

[[./images/microbiologie/antibio-resistance.png]]
Résistance naturelle
- colistine: bactérie gram+
- vancomycine : bactérie gram -
- aminoside: anaérobie

** Synthèse paroi
1. β-lactamase
   - Les β-lactamine inhibent la synthèse de la paroi bactérienne (peptidoglycane)
     - se fixent sur les PLP (protéine de liaison des pénicillines)
     - mécanisme de compétition
   - toutes les β-lactamines ont un cycle commun (β-lactame)
   - les β-lactamase vont hydrolyse ce cycle et désactiver les
     β-lactamines

2. Modification de cible : PLP

   - S. aureus : mutation dans le gène mecA : la PLP mutée (=PLP2a) ne
     permet plus aux β-lactamine de s'y fixer
   - Idem pour les PLP mosaïques des pneumocoque
   - Idem pour les entérocoque (PLP5)

** Synthèse protéine bactérienne
[[./images/microbiologie/antibio-ribosome.png]]

- aminoside: mauvaise reconnaissance de l'ARN messager (modification de
  la cible)
- linezolide : mauvaise position de l'ARNt (apporte les acides aminés)
  (modification de la cible)
- macrolides : bloque la formation du peptide ("tunnel") (enzyme)

** Synthèse acide nucléique
- ADN gyrase va "détordre" la double hélice pour la transcription et
  traduction
- quinolones vont empêcher cette action (modification de la cible)

** Notes
- β-lactamine inefficaces sur les mycoplasme car pas de paroi !
- glycopeptides inefficaces sur bactérie Gram négatif car elles ont une membrane externe qui ne laisse pas passer les grosses molécules
- synergie β-lactamine - aminoside sur strepto et entérocoque : destruction de la paroi par les β-lactamine pour que l'aminoside accède au ribosome
- seules les antibio pénétrant dans les cellules (macrolides, fluoroquinolones, rifampicine, cycline ) sont actives contre les bactéries "intracellulaires " (Chlamydia, Coxiella burnetti,
  Rickettsia, Legionella pneumophilia, Brucella meltiensi, Bartonella )

** Résumé
|                    | Péni G/V                   | Péni A                                     | Peni A + inhib βlactamase       | Peni M              |
|--------------------+----------------------------+--------------------------------------------+---------------------------------+---------------------|
| Utile              | Streptocoque               | idem + pneumocoque péniS                   | idem + Staphylocoque metiS      | Staphylocoque metiS |
|                    | Corynebacterium            | E. faecalis, Listeria monocytogenes        | H. influenza + pénicillinase    |                     |
|                    | Diphteria                  | Neisseria menigitidis                      | Enterobactéries + pénicillinase |                     |
|                    |                            | Entérobactéries groupe 1                   | BNG anaérobies                  |                     |
|--------------------+----------------------------+--------------------------------------------+---------------------------------+---------------------|
| Résistance nat     | BGN                        | Entérobactéries groupe 2, 3; P. aeruginosa |                                 | BGN                 |
|--------------------+----------------------------+--------------------------------------------+---------------------------------+---------------------|
| Résistance acquise | Staphylocoque, pneumocoque | Staphylocoque +/- pneumocoque              |                                 | Staphylocoque metiR |
|                    |                            | H. influenza, N. gonorrhea                 |                                 |                     |
|                    |                            | N. mengitidis                              |                                 |                     |

PéniM = oxacilline, cloxacilline PéniA = amox

|            | C2G                              | C3G orale (1)      | C3G injectable                  |
|------------+----------------------------------+--------------------+---------------------------------|
| Utile      | Streptocoque, Staphylocoque metS | Streptocoque       | Streptocoque (dont pneumocoque) |
|            | Entérobactérie groupe 1          | entérobactérie 1,2 | Neisseria spp, entérobactérie   |
|            |                                  |                    | Haemophilus                     |
|------------+----------------------------------+--------------------+---------------------------------|
| Résistance | Listeria, entérocoque            | idem               | idem                            |
|            | Staphylocoque metiR              |                    |                                 |
|            | P. aeruginosa, intracellaire     |                    |                                 |

(1) limité car mauvais biodisponibilité

|                      | Carbapénème                              | FQ                        | Aminoside (2)                      |
|----------------------+------------------------------------------+---------------------------+------------------------------------|
| Utile                | Entérobactérie, P. aeruginosa            | Entérobactérie            | Staphylocoque metiS                |
|                      | Entérocoque, Staphylocoque metiS         | Intracellulaire           | Listeria monocytogenes             |
|                      | Anaérobie                                | Staphylocoque metiS       | BGN                                |
|                      |                                          | P. aeruginosa : ciproflox | Streptocoque, pneumocoque          |
|----------------------+------------------------------------------+---------------------------+------------------------------------|
| Résistance naturelle | P. aeruginosa, entérocoque: ertapénème ! | entérocoque, L. monocyt   | strepto, pneumo: *bithérapie amox* |
|                      |                                          | anaérobie                 | anaérobie stricte                  |
|----------------------+------------------------------------------+---------------------------+------------------------------------|
| Résistance acquise   | carbapénémase                            | SAMR, gonocoque (1)       |                                    |

(1) Pas de monothérpaie pour P. aeruginosa et Staphylocoque aureus (risque mutants)
(2) amikacine, gentamicine

|                     | Macrolides (1)                | Lincosamide (2)  | Métronidazole                           | Glycopeptide (3)           |
|---------------------+-------------------------------+------------------+-----------------------------------------+----------------------------|
| Utile               | Intracellulaire, streptocoque | Strepocoque      | Anaérobie (sauf Acineto, cutibacterium) | Streptocoque, pneumocoque  |
|                     | Staphylocoque metiS           | Staphylocoque    | Parasite                                | Entérocoque, staphylocoque |
|                     |                               |                  |                                         | metiS/metiR                |
|                     |                               |                  |                                         | Clostri                    |
|---------------------+-------------------------------+------------------+-----------------------------------------+----------------------------|
| Résistace naturelle | entérobactérie, P. aeruginosa | BGN, E. faecalis | Autres                                  | BGN                        |
|---------------------+-------------------------------+------------------+-----------------------------------------+----------------------------|
| résistance acquise  | staph, pneumocoque, strepo A  | staph, strepto   |                                         |                            |

(1) erythro, azithromycine, clarithromycine
(2) clindamycine
(3) vancomycine

** Interprétation
Entérobactéries

- Groupe 1: TRI = résistance amox/ticar/pipe + inhibiteur β-lactamase
- *Céphalosporinase* = *inhibée oxacilline*
- *BLSE* = inhibée par acide clavulanique => *"bouchon de champagne"*
  - synergie C3G/C4G - ticar + acide clavulanique
  - ne touche pas les carbapénèmes
  - cefoxitine non touchée => permet de différencer d'une
    céphalosporinase déréprimée (voir tableau)

|               | Pénicillinase | Pénicillinase déréprimée | Céphalo sporinase | Céphalo. déréprimée | BLSE    | Carba pénémase |
|---------------+---------------+--------------------------+-------------------+---------------------+---------+----------------|
| amoxicilline  | R             | R                        | R                 | R                   | R       | R              |
| ticarcilline  | R             | R                        |                   | R                   | R       | R              |
| piperacilline | I/R           | R                        |                   | R                   | R       | R              |
| amox+inhib β  |               | I/R                      | R                 | R                   | *S/I/R* | R              |
| pipe/ticar    |               | I/R                      |                   | I/R                 | *S/I/R* | R              |
| + inhib β     |               |                          |                   |                     |         |                |
| C1G           |               | I/R                      | R                 | I/R                 | R       | R              |
| C2G           |               |                          | I/R               | I/R                 |         | I/R            |
| C3G           |               |                          | I/R               | I/R                 | I/R     | S (OXA-48)/I/R |
| C4G           |               |                          |                   |                     | I/R     | S (OXA-48)/I/R |
| carbapénème   |               |                          |                   |                     |         | I/R            |

- AMX = amoxicilline
- TIC = ticarcilline
- PIP = piperacilline
- AMC = amox - acide clavulanique
- C1G = céfalotine (CF)
- C2G = céfoxitine (FOX)
- C3G = céfixime (CFM), céfotaxime (CTX), ceftazidime (CAZ)
- C4G = céfépime (FEP)

*** MSLB
Résistance à l'érythromicine
- sensible pristinamycine : regarder si induction ("interaction"), si oui, MSLB inductible donc possible sélection de mutant.
- résistant pristinamycine : MSLB constitutif

** Piège
- SAUR sensible oxa mais résistance peni G => pénicillinase -> résistance à toute les pénicillines
- SARM = résistance à toutes les βlactamanes dont imipénème
- Aminoside
  - résistance gentamicine => forcément résistant tobramycine, amikacine, kanamycine
  - résistance amikacine => forcément résistant kanamycine
- FQ : résistance à ofloxacine => forcément toutes les quinolones

** Aminosides
Action = bactéricide, concentration dépendant.
Perturbe la synthèse des protéine (fixation sous unité 30s des ribosomes)

*** Résistances
- naturelle: anaérobie strictes et préférentielle (streptocoques,
  entérocoques) par défaut de pénnétration car le système de transport
  nécessite la force produite par les chaînes respiratoire aérobies /NB:
  penicilline + amoniside passe car agit sur la paroi bactérienne/

** Sulfamide
Bactériostatique (inhibe croissance) mais en synérgie devient
bactéricide Ex: sulfamethoxazole + trimethoprime (Bactrmie)

Mécanisme : inhibe synthèse microbionne d'acide folique

** Fluoroquinolone
- 4 générations: initialement répartition extra-cellulaire -> large et homogène (intracellulaire) avec les dernières générations
- Élimination rénale et bile
- Effets indésriable nombreux : digestif, phototoxique, trouble nerveux, inhibe cytochrme P450 (! interactions)
- Contre-indication : déficit G6PD, grossesse
- Action : inhibe réplication et transcription ADN
- Bactéricide, concentration dépendantes
- Indication :
  - quinolones = cystite aigùe simple non compliquée, récidivantes chez l'adulte
  - 2e génération : infections sévères à bacille Gram négatif
  - 3e et 4e génération : sinusite aigüe bactériennes, exacerbation pneumopathie communutaire, infection compliquée peau + tissus mous

    Résistante : en augmentation chez entérobactéries (E. coli, Klebsiella)

** Métronidazole
Pour anaérobie strictes

** Infection ostéo-articulaires
- Rifampicine, quinolone pour diffusion
- dapto : activité antibiofilm