#+title: Oncologie

* Grand concepts
Mutations /drivers/: joue un rôle dans la transformation maligne
Mutations /passenger/: reflète simplement l’instabilité tumorale
Génome tumoral = sélectionné pour échapper au système immunitaire et résister aux chimio -> hétérogénéité génétique de la tumeur

Signature tumorale = altération nucléotidique communes entre les    organes

Plusieurs étapes nécessaire : ex de l’épithélium avec perte d’APC puis hypométhylation de l’ADN ->_adénome (activation K-ras, perte 18q) perte p53 -> carcinome

Monoclonal ou polyclonal (plusieurs amas avec 1 amas à partir d’une cellule)

Sporadique : accumulation d’altérations somatiques dans 1 cellule
Hérétiaire = altération consitutionnelle (toutes les celluse) -> plusieurs altérations somatique dans une celluse

type de variantsio drivers :
- activatrice (proto-oncogène) : dominant
- inactivatrice (récessif) : suppresseur de tumeurs = gate keeeprs (point de controle du cycle cellulaire), care takers (répare ADN)

 Double hit : variation htz constit + variation somatique -> récessif dans la tumeur mais dominant dans la famille

Prédisposition au cancer :
- âge au diagnostic précoce
- multifocal, bilatéral
- cancers multiples
- apparentés atteints

Exemple indication exome constit :
- néonat ou cancer "adulte" chez l’enfant
- cancers primitifs multiples avant 31 ans
- syndromique
- tumeurs exceptionnelle de déterminisme génétique non connu
- agrégatation familiale très suspecte

On retrouve les mḙme variations en somatique et constit  + évènements supplémentaire en tumoral:
- méthylation promoteur (classique) -> inactive gène
- réarangement de grande taille avec pert htz
- chromothripsis
* Sein/ovaire
** Indications de consultation
- K sein < 41 ans
- K sein triple négatif < 51 ans
- K sein bilatérale, le premier < 51 ans
- K sein chez homme, qq soit âge au diagnostic
- K ovar haut grade
- K ovaire bas grade < 71 ans
Famille:
- > 3 sujet avec K sein/ovaire au 1er degré (2 si transmission paternelle)
- 2 K sein chez apparentés 1er degré (2e si transmission paternelle) si 1 avant 46 ans (ou 1 avant 51 et l’autre avant 71 ans)
- K sein et ovaire chez apparenté 1er degré (2e degré passant par homme)

Score d’Eisinger : possible si 3 ou 4, > 5 bonne indication
- Mutations BRCA1/2 identifiée dans la famille 5
- Cancer du sein chez une femme < 30ans 4
- Cancer du sein chez une femme entre 30 et 39 ans 3
- Cancer du sein chez une femme 40 et 49 ans 2
- Cancer du sein chez une femme 50 et 70ans 1
- Cancer du sein chez l’homme 4
- Cancer de l’ovaire 3
en additionnent les points pour chaque cas de la mḙme branche
** Génétique
15% formes familiales expliquées
BRCA1 et 2 :
- 2-4% des cancers du sein
- risque prostate et pancréas (BRCA2 surtout)
Risque relatif augmente avec l’histoire familiale
** Suivi :
Chercher la mutation chez apparenté : si porteur, IRM annuelle à partir de 30 ans, mastectomie < 40 ans, annexectomie après projet parental à 40 ans
** Traitement
inhibiteurs PARP
* Cancer colorectal
Syndrome Hereditary Non Polyposis Colorectal Cancer :
- 4% MSH2, MLH1, MSH6, PMS2, EPCAM
- colon, rectum, endomètre surtout
- intestin grḙle, tractur urinaire, estomac, ovaire

  Mutation constit d’un gène MMR  ->_inactivation 2e allèle -> instabilité microsatellite ->_inactivation somatique gènes cible -
** Suivi
colon: coloscopie tous les 2 ans à partir de 20 ans
Gynéco ? écho + biosie endomètre tous les ans à partir de 35ans +/- hysteréctomie après projet
* Modèle du rétinoblastome
Mosaïque somatique + germinale : RB uni- ou bi-latéral + récurrence
Mosaïque somatique : RB uni- ou bi-latéral
Mosaïque germinale : parents asympto mais transmission à la descendance

Tester mutation somatique puis en constit +/- ségreg si hérité