#+title:      Gastro-entérites
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Principale complication = déshydratation

* Virale
- Transmission : féco-orale direct (interhumaine) ou indirecte
  (aliments, eaux, environnement)
- Faible nombre de particules ingéres pour entraîner une GEA
- Virus non enveloppé résistant à l'acadidé gastrique
- toutes tranches d'aĝe mais le plus souvent enfant en bas âge
- multiplication dans les entérocytes de l'intesting grêle
- infections le plus souvent courte avec diarrhé, douleur abdo, vomissement
- greffés/transplanté: peut devenir presistant/chronique
- incubation courte, excrétion virale prolongee
- Immonoenzymatique, trousses commerciales (ELISA, tests unitaire), PCR temps réel
  - immunoenzymatique: très spécifique, sensible pour rota, adéno et
    astrovirus mais pas pour la détection des norovirus -> technique
    plus sensible

** Rotavirus

- Réservoir humain (animaux pour rotavirus spécifiques)
- Transmission : féco-orale, interhumaine, par les mains ou objets
  contaminés par des feces/vomissure. NB: perte de son infectiosité
  en milieu humide
- Structure: Capside icosahédrique, non enveloppé, ARN double brin

*** Épidémiologie
- groupe A:
  - France, enfant < 5 ans 140 000 consultations, 18 000 hospitalisaiton, décès exceptionnel
  - *1ere cause de diarrhée aigùe de l'enfant < 5 ans*
- 1ere cause d'infection nosocomiale en pédiatrie, 27-32% nosocomiales selon les pays
  - monde = 29-45% hospitalisation pour diarrhées sévères, 600 000 morts/an (pays bas/moyens revenus)
- adulte/enfant plus gế : réincfetion commune mais clinique très modérée. Surtout un vecteur de transmission

*** Physiopathologie
 Lésions des entérocytes matures de l'intesting grêle (multiplication du virus) : dérégulation puis destruction.

 Mécanismes :
 1. sécrétion eau, électrolytique -> diarhée sécrétoire
 2. lyse cellulaire , perturbation des fonctions enzymatique -> diarrhée de malabsorption et osmotique (résidus glucidique dans l'intestin)

*** Clinique
- variable : asymptomatique - diarrhées malabsorption/sécrétoire
- incubation < 48h
- symptomes de 1 à 4 jours. NB: excrétion du virus peut précèder de quelques jours et persister 8-10 jours
  - infections asymptomatique habituelle de 1 à 3 mois (immunité maternelle) (NB : immunité secondaire chez adulte)
- diarrhée
  - aqueuse non glairo-sanglante (parfois explosive), vomissement, douleur abdo, hyperthermie modérée 38°
  - intensité = variable
  - consistance variable (molle - liquide)

*** Diagnostic
- Test immo-chromatographique
- Test immuno-enzymatique (ELISA) = détection antigène dans les selles (anticorps monoclonaux)
- RT-PCR, RT-qPCR

** Norovirus
- Structure:  Capside, non enveloppé, *simple brin* (≈ ARN messager)s
*** Transmission
- Féco-orale, vomissure, persone-personne (EHPAD+++), souillures, projection, aérosol (eau++)
- Très infectieux
- Contagion possible par sujet asymptomatique.

*** Épidémiologie
- Souvent sous forme d'épidémie.
- Surtout en hiver
- *> 85% des épidémies de GEA non bactériennes quelque soit l'âge*
- Problème de santé publique : infections nosocomiale, EHPAD
- *Le virus le plus fréquemment responsable de TIAC* (eau souillée, personne porteuse) : 10-26% des cas

  Attention: persistance excrétion virale semaine après la guérison

*** Physiopathologie
- Probablement réplication jejunum : atrophie villositaire -> malabsorption transitoire (altération système enzymatique des entérocyte)
- invasion épithélium par lymphocytes T CD8+

*** Clinique
  - Bénin chez adulte/enfant bonne santé (très rarement déshydratation)
  - Plus problématiques dans certains pays (= aussi sévère que rotavirus)
  - Incubation 4-77heures
  - Nausée, vomissement, diarrhée, fièvre modérée douleur abdominale
  - Diarrée liquide sans mucus/sang/leucocyte
  - mortel chez les personnes fragiles (nouveau-né, greffé, immunodéprimé)
  - Infections chroniques parfois sévère chez l'immundodéprimé (perte de poids, déshydrataition+++)

*** Diagnostic
 - test immuno-chromatographique: spécifique, peu sensible
 - standard = RT-PCR, RT-PCR en temps réels

*** Traitement, vaccination
- Pas de traitement antiviral
- Prévention = lavage des mains, désinfection surface, hygiène du
  voyage, hôpital = idem
- Pas de vaccin

** Adénovirus
  - Transmission féco-orale, *respiratoire*
  - Plutôt communautés, possiblement nosocomiale
  - Endémie avec pics (hivers, printemps)

  - Structure: capside, non enveloppé, double brin

*** Épidémio
- toute l'année (épidémique ou sporadique)
- *3-6% GEA infectieuses du nourrisson*

*** Physiopatho
- Largement répandu dans la population mais pas d'immunité
- Lyse cellule

*** Clinique
- Immunocompétent : *oculaire* (conjonctivite, kérato-conjoctivite), *respiratoire* (ppharyngite, bronchite, pneumotahie), *digestif* (gastro)
- Immunodéprimé : dissiméniation (pneumonie, méningoencéphalite, héptatie) ! potentiellement mortel !

*** Diagnostic
- Formes graves chez l'immunocompétent, dépistage chez immunodéprimé
- PCR quantitative/qualitative, test rapide antigénique

*** Traitement
- Cifodovir si immunodéprimé = IV, nombreux effets indésirable
- Prévention (décontamination. Attention alcool inefficace !)

** Astrovirus

*** Épidémio
  - épidémies en hiver, surtout nourrisson
  - 1-4% GEA enfant et adulte

*** Physiopatho
   Entérocytes matures , sommets des villosités

*** Diagnostic
- ELISA RT-qPCR

- Modalités du diagnostic virologique des GEA virales
  - forme sévère de l'enfant: recherche rotavirus
  - porteur asymptomatique en pédiatrie
  - enfant/personne âgée avec symptômes en hospitalisation + symptôme
     (prévenir infection nosocomiale)

- Stratégie des examens microbiologiques face à des cas groupés de GEA
  - immunodétection ou PCR temps réel -> noro, rota, adéno, sapovirus, adénovirus
  - Origine alimentaire/hydrique = norovirus le plus souvent -> recherche norovirus
** Principales mesures d'hygiène permettant de lutter contre une épidémie de GEA
  - Port de gant, lavage des mains, décontamination des surface
  - Désinfection des surfaces contaminées (rotavirus)
  - norovirus :
    - règle d'hygiène en voyage
    - lavage main savon + hydroalcoolique, nettoyage des locaus,
      prélèvement régulé, isolement des patients à risque