:PROPERTIES:
:ID:       ae2809c4-75c3-4c3d-be5f-adcd81900c9f
:END:
#+title: Vue d'ensemble du pipeline
#+filetags: auragen pipeline

[[https://auragen.atlassian.net/wiki/spaces/~7120201ca2598be5ef4936a1110033f28f4fed/pages/1532198915/Vue+d+ensemble+du+pipeline][Image]]

Description:
- [[id:cc54e449-12a7-41d6-832b-33937255be92][Contrôle qualité]] et [[id:117f7970-2579-48e1-b7b0-026b4c9fd0a6][Avertissement]]
- [[id:ee261ae7-3511-46e0-8c9a-ad4318850104][Appel de variant]]
- Cas particuliers : [[id:30db1b6c-6f95-40db-a363-202b20412d4f][Outils pour la détection de variants]] , [[id:92f64d28-a582-484b-8181-ea04c13d850d][ROH]]
- [[id:0b163c10-63c2-44e0-b694-f3749139a3d5][Annotations]]
- [[id:fb97e927-2a25-4733-95a2-c4f520c3c711][Sélection des variants]]
- [[id:d82ebf38-feca-4409-950f-b208f67fae0d][Priorisation]]
- [[id:6698b607-38bb-47de-a729-e2e5ad69b94f][Reportmonster]]
- [[id:4b189666-2c75-4a9b-b95a-00343cb223d0][Aurapport]]

[[id:280a19e2-c571-41dd-b339-5fe9723cefbe][Notations]]

Technique
- [[id:82df331a-bf10-4099-aa1b-24b4dd637a74][Mises à jour]]
- [[id:587dc7c4-1dd5-4068-8d24-6e3825f01e66][Validation]]

Limites et améliorations
[[id:cef32d57-e0a3-4b76-afd2-326830576462][Problèmes connus]]
[[id:8a2278b0-14de-4b46-8770-5f1f9015032f][Améliorations pipeline]]