#+title:      Pipeline
#+date:       [2024-07-24 Wed 09:54]
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#+identifier: 20240724T095437

[[https://auragen.atlassian.net/wiki/spaces/~7120201ca2598be5ef4936a1110033f28f4fed/pages/1532198915/Vue+d+ensemble+du+pipeline][Image]]

Description:
- [[denote:20240719T113354][Controle qualité]] et [[denote:20240719T113108][Avertissement]]
- [[denote:20240725T092233][Appel de variants]]

- Cas particuliers : [[id:30db1b6c-6f95-40db-a363-202b20412d4f][Outils pour la détection de variants]] , [[id:92f64d28-a582-484b-8181-ea04c13d850d][ROH]]
- [[denote:20240725T095212][Outils pour la détection des variants]]
- [[denote:20240725T094853][Annotations]]

  TODO
- [[id:fb97e927-2a25-4733-95a2-c4f520c3c711][Sélection des variants]]
- [[id:d82ebf38-feca-4409-950f-b208f67fae0d][Priorisation]]
- [[id:6698b607-38bb-47de-a729-e2e5ad69b94f][Reportmonster]]
- [[id:4b189666-2c75-4a9b-b95a-00343cb223d0][Aurapport]]

[[id:280a19e2-c571-41dd-b339-5fe9723cefbe][Notations]]

Technique
- [[id:82df331a-bf10-4099-aa1b-24b4dd637a74][Mises à jour]]
- [[id:587dc7c4-1dd5-4068-8d24-6e3825f01e66][Validation]]

Limites et améliorations
[[id:cef32d57-e0a3-4b76-afd2-326830576462][Problèmes connus]]
[[id:8a2278b0-14de-4b46-8770-5f1f9015032f][Améliorations pipeline]]