#+title:      Avertissement
#+date:       [2024-07-19 Fri 11:31]
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#+identifier: 20240719T113108

Dossier livré si QC "modérément atypique"
- distribution atypique des profondeur
- couverture faible mais "modéré" (détail du défaut de couverture dans les QC)
- QC non conforme mais urgent
- librairie modérément atypique  (les faux positifs de CNVnator sont nettoyés)
- absence de parent: les[[denote:20240719T113251][Délétion et duplications 50bp - 21kb]] sont impactées car manta génère trop de variant -> on filtre les variation introniques et intergéniques
- contamination < 10%
- aneuploïdie du cas index
- aneuploïdie des apparentés
- faux positifs de CNVnator (par comparaison avec ploïdies)
- librairie non conforme attendu
- prélèvement non exploitable: greffe moelle osseuse par exemple
- présence de jumeaux monozygotes


Voir [[denote:20240719T113354][Controle qualité]]  et not. [[denote:20240719T113454][Contamination]]