#+title:      Processed pseudogenes acquired somatically during cancer development
#+date:       [2024-07-17 Wed 17:35]
#+filetags:   :bib:pseudogène:
#+identifier: 20240717T173522
#+reference:  cooke2014processed

Utilisé en cancer mais le principe a été vu auilleurs
- reads qui sont exactement sur des sites canoniques d'épissage qui sont aligné sur des exons mais avec une taille d'insert trop grand
- ou reads qui sont entre nu pseudogene et son side d'insertion
- candidat : >= 3 exons d'un gène dans l'ADN de la tumeur avec >= 2 site canonique d'épissage
- élimintation germiline