#+title:      Detection of sharing by descent, long-range phasing and haplotype imputation
#+date:       [2024-07-17 Wed 14:42]
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#+identifier: 20240717T144244
#+reference:  kong2008detection


Pour les familles séquencées avec SNP-array haut dentisé, cet article montre qu'il est intéressant d'utiliser des individus assez éloginées (3-20) méoides

2 individus qui sont cousins au degré n: 2(n+1) méoides donc la probab de prartage un locus IBD est 2^{-2n}

Ici, on utiliser pour phaser les haplotype  (il suffit d'avoir une région IBD)
Pour un SNP hétérozygote, il suffit de trouver un apparenté homozygote

données islandaise (35k) : un indivus partage avec 17-18 autre un IBD
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