#+title:      Overcoming challenges and dogmas to understand the functions of pseudogenes
#+date:       [2024-07-17 Wed 14:38]
#+filetags:   :bib:pseudogène:
#+identifier: 20240717T143843
#+reference:  cheetham2019


- pas d'info sur la partie pipeline
- attention à la définition d'un pseudogène (privilégie rétrotransposition et gène duplication ?)
- on découvre de plus en plus de fonction de pseudogène (intérête de l'article)

* Notes
Définition: régions semblable à un autre gène et défectueuse.
Classification par mécanisme
- "processed" : transcription inverse et intégration de l'ARNm
- "unprocessed" : à partir de [[id:c88ff729-d478-4e8d-82b9-bd6cc186b489][Duplication segmentaire]]
- unitary = inactivation d'un gène à partir de mutations
- (rare) mutation inactivatrice dans le génome de référence mais intact chez certains individus

GENCODE: ~10k pseudo gènes, soit 72%
Processed pseudogene = important dans l'évolution -> au mçoins 48 "processed" pseudogene polymorphique