#+title:      Evolutionary and expression signatures of pseudogenes in Arabidopsis and rice
#+date:       [2024-07-16 mar. 17:08]
#+filetags:   :article:bib:
#+identifier: 20240716T170819
#+reference:  zou2009evolutionary

Idem [[denote:20240716T170853][PseudoPipe: an automated pseudogene identification pipeline]] sur principe
[[https://github.com/ShiuLab/PseudogenePipeline][Code sur github]]

Riz et plante (arabidopsis)
Méthode d'identification : basé sur [cite:@zhang2006pseudopipe]
1. identification région intergénique similaire à des protéines connues
2. régions répétées masqué
3. pseudoexons fusionnées en contigs
4. fitre sur qualité
5. identification des caractérisitque coupant les séqunece proétique
6. différence ci rétro- et non-rétro

et stats