#+title:      An Inference Attack on Genomic Data Using Kinship, Complex Correlations, and Phenotype Information
#+date:       [2024-07-17 Wed 14:39]
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#+identifier: 20240717T143901
#+reference:  deznabi2018inference


Méthode très proche d'[cite:@humbert2013addressing]

Attaquer a accès à
- données génomiques partielle individus (publiques)
- phénotypes
- données de santé (publique)
- généalogique
* Objectif
retrouver les partie manquant du génome
* Méthode
Exploite généalogique, probab phénotype-génotyque, relaction maladies-génomique et corrélation génome avec modèle de recombinator
Utilise un algorithme de belief propagation
* Métrique
Idem [cite:@humbert2013addressing]
- incertitude (entropie sur SNP ) mais il faut les vrais positifs
- incorrectness
* Données
CEPPH/UTAH
- SNP au format VCF
- 11 individus ici
- 100 SNP proches, sur chr22
- MAF
- corrélation (1000 genomes projects)
Manuel corpas

* Résultats
CEPH
- 0.15 et 0.2 incertitude
- erreur 0.11 et 022
MC
- incertitude entre 0.1 - 0.3 selon indivift
- erreur 0.28 et 0.3