* Réarrangements génomiques
Duplication, deletion, insertion, inversion, translocation
micro si < 5Mb
2 types
- Récurrents = taille et position identiques chez patients avec même syndromes
- Non-récurrents = variable mais région commune entre tous les remaniements
Dans les cellules germinales (méiose) -> constit
Dans les cellules somatique (mitose/mosaïque) -> cancer
** Mécanismes principaux
*** NAHR (recombinaison homologue non alléliques)
- Principale mécanisme pour réarragement récurrents
- Recombinaison homologue = physiologique, sert à réparer les cassures doubles brins de l’ADN
appariement strict
- Si mauvaise matrice de réparation, se fait alors de manière non allélique
- Pendant méiose ou mitoses
**** Favorisé par
- structures qui génères spontanément des cassures (palindromes)
- surtout les LCR (low copy repeat)  = 1-400kb avec forte homologie (>90%)
  - forte concentration dans péricentromère, subtélomère
  - 20% géne
**** Peut arriver
- entre 2 chromomosem
- sur un même chromosome : entre les 2 bras ou sur le même bras
[[file:img/nahr.png]]
  (chromatide soeur)
**** Sens
Si LCR même sense : Deletion/dup
Sinon : inversion (180% et s’insère à la même place): souvent bénin mais facteur favorisant pour microdel/dup dans la descendance (ex: sd de Willams-Burren)
**** Hotspot
péricentromérique de centairs chromosomes
*** NHEJ (raccordemente d’extrémités non homologues)
- Réparer cassures doubles brins, prédominant chez les mammifères
- Ici actif tout au long du cycle cellulaire
- Pas d’homologie nécessaire ici ! mécanisme biochimique
- Réarrangement non récurrents
  Impliqué dans les recombinaisons physiologique (immunité)
  Patho: cancer
*** État final :
- réparation
- ou séquence "cicatrice" suite modification oligonucléotide
  - délétion
  - insertion
  - MMEJ (microhomology-mediated end joining)
(Erreurs d’autant plus fréquentes qu’il y a des micro-homologie)
*** Réplication
- FoSTeS (fork stalling and template switching) ou MMBBIR (microhomology-mediated break-induced replication)
- Non lié à la réparation !
- Réarrangement non récurrent complexes
- Impliqué : sd de Pelizaeus-Merzbacher
*** Fostes
Fourche de répilcation parfois arrêtés par des structures particulières (ex: lésions sur ADN, collision avec complexe de transcription)
-> si passe outre, cassure brin
Normalement corrigé par NH mais peut être perturbé par micro-homologie -> nouvelle fourche de réplication
*** MMBIR
Idem mais déclenché par cassure double brin sur la fource, (du à une cassure simple )
** favorisé par
- structures secondaires augmentant la fréquence des cassures adn
- Séquences avec forte homologies (LCR, Alu)
- Stress cellulaire
 position dans le noyau (territoire chromosomique)