CXW37WKZDOFBTPGZQGQVWDWGA7YWGGJ47SSD4KYEXD6MPERELGGAC GZ27E2IGB3Y7IBND22QKIHXDOFOHQBAEVJEF52PJHAJOPHQECY6QC JGMCSDW663DQSK7XSWDBPVYQE57ZBP7ZVZLSEXUJOQVE7KY6BB4QC N6WY6C3RAYTXRJKB27TZ6BKFKY4DIRFD5GJBPMFK52A6J3HVDG6QC FGRZYV3XLUW7UNJCWE7LTW4PRHIJVG5RUMQUZH5GZ3ZKMV3UQTYQC OL44QLYDBZJDJSINLHYMB75CYN3JUBUSCPZT27XBEX3KGUJ6LKWQC BJCE3NM42AY2TTGHGAGS5ZNST6FFGLLHJJRYC4TCG2FWRXEI24DQC QZKA34UJ3QEUIXABRXMCUZ5OZ6GJ27KO6GNQRUHDPYF7YNFRVYAAC 4NPBMOPUNAULYXCBI2DW7VXR345MO3PPNXQY37NPZCAI452V5FWAC 4FI5AYOD7ZDQLMENT2DD2P7DUP3GPFPYJPB276233YBVICFEKGDAC FX5RRUKFFIBSG7CKK5X3SN6TNSHBUTSNNQGE7NCBC4MT457IXYPAC S4E5NTHNZE5RQ5FHL2HYYKVYSU6MOQVT2Y7JQ6TDSFSKWE76Z4JQC ZYO7QUT2SICIRJFKNXU2GIMZOI44BOLWWZG5WMQJNMVM3UTNEVWQC 3BKDQXSGAE5VZDOT3IUGWAN5PJS5FURHFCD2XJGDOXULOORYHEGAC BWUGCH26UJOIJS5G46HI6BV2KGP3NZWOK43LTB4A7ESQ6QI7QIWAC 3ICTNFNJQ3UM5X3XVBWGW727D432627HU7FIFIFK6ND5UA6ZYCWQC 6LZYRN2QNXK6OZGWTG7KUGBVYIAXAYCSYBHDJO7KDTIGSMD5VXMAC 664GEPJAHPR65B3OTA7JBSQX7I5S5LGWSTD2RM7DNTP6AFRCQKPQC XFJI3DNWKUTPSXTWQMQ2P73Z3AURCRKZW7YSNZYP5EMB7YABXWIAC RHWQQAAHNHFO3FLCGVB3SIDKNOUFJGZTDNN57IQVBMXXCWX74MKAC 5DKQ37JFTSHBVZ3R2R4H5R7NNQH6AWTNQCUC4CX7JB7COM3UEISQC #+title: Gtd* Japonais:PROPERTIES::CATEGORY: japonais:END:** Miura :miura:*** TODO Leçon 1**** DONE Lire**** DONE Anki*** TODO Leçon 2**** DONE Lire**** TODO Anki***** TODO Grammaire*** TODO Leçon 3**** DONE Lire**** TODO Anki***** TODO Grammaire*** TODO Leçon 4**** DONE Lire**** TODO Anki***** TODO Grammaire*** TODO Leçon 5**** DONE Lire**** TODO Anki***** TODO Grammaire*** TODO Leçon 6**** DONE Lire**** TODO Anki***** TODO Grammaire*** TODO Leçon 7**** TODO Lire**** TODO Anki***** TODO Grammaire*** Lire** Leçon Aya:PROPERTIES::CATEGORY: aya:END:*** TODO Lire dialogue fin leçon 10SCHEDULED: <2022-04-03 Sun>* Internat:PROPERTIES::CATEGORY: internat:END:** DONE Mail Dijon pour expliquer que c’est décalé :interchu:** Thèse :these:*** TODO Voir avec Julien Thevenon pour sujet de thèse*** TODO Voir avec Jean-Paul pour sujet de thèse** Droit au remords*** WAIT Envoi scolarité*** TODO Négocier avec Xavier Bertrand pour stage de cliniqueDEADLINE: <2022-07-17 Sun>* Ledger:PROPERTIES::CATEGORY: compta:END:** TODO janvier 2022** TODO février 2022** TODO Mars 2022SCHEDULED: <2022-06-12 Sun>** TODO Avril 2022** TODO Mail 2022* Projet:PROPERTIES::CATEGORY: projets:END:** Assistant:PROPERTIES::CATEGORY: assistant:END:*** DONE Regarder ce qu'Yvain a fait** CentoX*** Extraction de données**** TexteTrop compliqué de travailles sur la structure du pdf- pdftotext : bon résultats sur page 1. Sur les ségrégations, il n’y a pas de retour à la ligne avant l’indication- pdfminer donne des résultats légèrement supérieurs, beaucoup d’espaces sur les ségrégations- pypdf2 : trop de retours à la lignes intempestifs dans le texteLa structure du tableau est perdue dans tous les cas**** ParserListe de parser : https://tomassetti.me/parsing-in-python/* Machine learning:PROPERTIES::CATEGORY: machine learning:END:[[https://www.reddit.com/r/MachineLearning/comments/5z8110/d_a_super_harsh_guide_to_machine_learning/][Source: reddit]]** TODO [[file:books.org::*The elements of statistical learning (217)][The elements of statistical learning (217)]] :*** TODO Chap 1-4*** TODO Chap 7-8** TODO [[https://www.coursera.org/learn/machine-learning/home/info][Andrew NG coursera]]** TODO The Deep Learning Book: https://www.deeplearningbook.org/front_matter.pdf** TODO Put tensor flow or torch on a linux box and run examples: http://cs231n.github.io/aws-tutorial/* Recherche:PROPERTIES::CATEGORY: recherche:END:** WDR45:PROPERTIES::CATEGORY: wdr45:END:SCHEDULED: <2022-07-21 Thu>*** TODO Donner la réponse à Chloé + Patricia Fergelot*** TODO Démarrer appel à collaboration avec ChloéSCHEDULED: <2022-10-01 Sat>** NF1 :nf1:*** Biblio**** TODO article T. Hirsch**** TODO Autre case report ?*** Trouver autres cas*** TODO Appel ANDDI rares*** TODO Appel ITACA*** DONE Domiinque VIAUDMail envoyé par Juliette*** DONE Observatoire TEDNon*** TODO Contact Hirisch pour clinique** Mustard :mustard:*** Données**** DONE Import Labkey**** TODO Clinique et nettoyage données labkey**** HOLD Dxcare***** DONE Demande Dijon***** HOLD Demande DPO Besançon**** KILL donnée pierre**CLOSED: [2022-05-05 jeu. 17:53]**** Importer donnée Paul sur le S*** Stockage**** DONE Accès scality au travail**** WAIT VPN pour Jehanne* Banque :banque:** TODO Compte et CB société générale :banque:*** DONE SouscriptionCLOSED: [2022-04-23 Sat 17:13]*** DONE Carte bancaireDEADLINE: <2022-05-21 Sat>*** DONE Envoyer fiche de salaire*** KILL Envoyer relevé*** TODO Transfert compte bancaireSCHEDULED: <2022-07-21 Thu>* FreeBSD :freebsd:** TODO ormolu 0.5.0.0SCHEDULED: <2022-05-20 Fri>** TODO kitty ne compile plusSCHEDULED: <2022-07-17 Sun>* Génétique** [[file:books.org::*Biologie chimie Dunod][Biologie chimie Dunod]]** [[file:books.org::*Biologie cellulaire Dunod][Biologie cellulaire Dunod]]** Notes génétique :anki::PROPERTIES::CATEGORY: genetique:END:** TODO [[file:books.org::*Collège][Collège]]** TODO DES*** TODO Presentiel session 1 [5/9]**** DONE Introduction à la dysmorphologie**** DONE Structuration du génome et mécanismes mutationnels**** DONE Oncogénétique: introduction**** TODO Diagnostic prénatal**** DONE Grandes technologies et bioinformatique**** DONE Aspects réglementaires et éthiques**** TODO Mucoviscidose**** TODO Bases sur le conseil génétique**** TODO SEPI et TD*** TODO E-learning session 1 [4/6]**** DONE maladies endocriniennes et métabolisme**** DONE anomalies de la croissance**** TODO hématologie**** TODO maladies du tissu conjonctif**** DONE Oncogénétique**** DONE dermatogénétique*** TODO Presentiel session 2 [0/5]**** TODO Déficience intellectuelle**** TODO Génétique clinique et formelle**** TODO Pathologies fréquentes en génétique clinique**** TODO Génome humain : normal et pathologique**** TODO Maladies métaboliques*** TODO E-learning session 2 [1/5]**** DONE Syndromes microdélétionnels**** TODO Dysgonosomies**** TODO Cancer du colon: Maladie de Lynch et CMMRD**** TODO Déficience intellectuelle**** TODO Pathologies neuromusculaires** DIU dysmorpho:PROPERTIES::CATEGORY: dysmorpho:END:*** Relire + ficher :anki:**** TODO Intro dysmorpho - Verloes**** TODO Empreinte génomique**** TODO Beckwith, Silver Russel**** TODO Scoliose**** TODO Syndromes cytogénétique - Salanville**** TODO Dysostose mandibulo faciale**** TODO Williams dup 7p11.2**** TODO Pathologie génétique de la reproduction**** TODO Malformations oculaires**** TODO Comprendre les test génétiques**** TODO Fente**** TODO Gonosome**** TODO Smith-Mangenis**** TODO 22q11**** TODO Dysmorpho nouveau-né**** TODO Autopsie foetale**** TODO Dysmorphologie - généralités (A Verloes)**** TODO Dysmorphologie du nouveau né (M Vincent)**** TODO Registre des malformations (N Lelong)**** TODO Comprendre les tests génétiques - Mutations - NGS (Y Vial)**** TODO Cytogénétique (C Missirian)**** TODO NGS et syndromologie (F Tran-Mau-Them)**** TODO Empreinte génomique (F Brioudé) (seq 15 Beckwith Wiedemann Syndrome et SRussel S)**** TODO Autopsie foetale (F Guimiot)**** TODO Tumeur et développement (H Cave)**** TODO Dysmorphologie foetale (MH Saint Frison)**** TODO Pathologie génétique de la reproduction (F Vialard)**** TODO Le dysmorphologiste en prénatal (N Gruchy)**** TODO Régulation génique et anomalies du développement (F Petit)**** TODO Echographie fœtale et dysmorphologie (C Rozel)**** TODO Déficience intellectuelle (A Curie)**** TODO Autisme et génétique (A Maruani)**** TODO Tests neuropsy**** TODO XLID(A Toutain)**** TODO Anomalies du développement embryonnaire précoce (C Quelin)**** TODO Anomalies de fermeture du tube neural (C Quelin)**** TODO FAS (D Germanaud)**** TODO Médicaments et grossesse (C Vauzelle)**** TODO Syndromes avec fentes oro-faciales- (J Van-Gils)**** TODO Syndromes avec craniosténose (C Collet)**** TODO Dents & syndromes (I Bailleul)**** TODO Dysostoses Mandibulo faciales (J Amiel)**** TODO Avances staturales (A Putoux)**** TODO Retards staturaux syndromiques (A Putoux)**** TODO Syndromes avec obésité (G Diene)**** TODO Spliceosomopathies (P Edery)**** TODO Microcéphalies (S Passemard)**** TODO Anomalies du cervelet : Joubert, NPH ... (L Burglen)**** TODO Epilepsie et syndromes (C Mignot)**** TODO Holoprosencéphalie (S Odent)**** TODO Hydrocephalie (S Odent)**** TODO Anomalies de migration (S Passemard)**** TODO Chondrodysplasies (G Baujat)**** TODO Anomalies de segmentation et scoliose (J Thévenon)**** TODO Génétique du développement des membres et principaux syndromes (F Petit)**** TODO Classification des malformations des membres (F Petit)**** TODO Prise en charge des anomalies des membres (N Quintero)**** TODO Syndromes avec anomalies uro-néphrologiques pré- et postnatal (G Morin)**** TODO Syndromes avec anomalies génitales et DSD (B Leheup)**** TODO Du coeur au syndrome (D Genevieve)**** TODO Malformation cardiaque en anténatal (D Genevieve)**** TODO Base génétique du déterminisme du sexe (C Colson)**** TODO Surdités syndromiques (S Marlin)**** TODO Malformations oculaires (N Chassaing)**** TODO Dermatologie et développement (P Vabres)**** TODO Dysmorphologie et métabolisme (M Barth)**** TODO Maladies de surcharge (D Germain)**** TODO Trisomie 21 (R Touraine)**** TODO S. Williams - duplication 7q11.2 (M Rossi)**** TODO Délétion 22q11.2 (L Perrin)**** TODO Syndromes cytogénétiques (D Sanlaville)**** TODO Gonosomes (J Leger)**** TODO Parcours de soin des patients avec anomalies du développement (N Jean-Marçais)**** TODO Prise en charge médicosociale du handicap (D Juzeau)**** TODO Fanconi (T Leblanc)**** TODO Ehlers-Danlos (D Germain)**** TODO Chromatinopathies: TAD - Kabuki, Rubinstein-Taybi, Wiedemann-Steiner, SBYSS... (D Genevieve)**** TODO Marfan et syndromes apparentés (G Jondeau)**** TODO RASopathies (Y Capri)**** TODO Syndromes de Pitt Hopkins, Angelman, Rett et Rett-like (N Bahi-Buisson)**** TODO Filaminopathies A (C Goizet)**** TODO Achondroplasie (G Baujat)**** TODO OI (G Baujat)**** TODO Ciliopathies: approche globale (T Attie-Bitach)**** TODO Smith-Magenis (L Perrin)**** TODO Cohésinopathies : Cornelia de Lange, Coffin-Siris/NB, CHOPS... (A Goldenberg)**** TODO Albinisme et syndromes apparentés (B Arveiler)**** TODO Beckwith Wiedemann Syndrome & Silver Russel Syndrome (F Brioude)**** TODO Neurofibromatoses - STB (C Goizet)**** TODO Cowden, Gorlin (P Goizet)**** TODO Syndrome de Kleefstra (L Perrin)**** TODO Téloméropathies (T Leblanc)*** DONE QROC 3*DEADLINE: <2022-06-18 Sat>*** DONE QROC S2*CLOSED: [2022-04-16 Sat 23:42] DEADLINE: <2022-04-16 Sat 23:59>*** DONE Mémoire* Divers** TODO Cadeau mariage :joris:SCHEDULED: <2022-08-04 Thu>** TODO Cadeaux mariage :florian:SCHEDULED: <2022-08-04 Thu>** TODO Copier photos famille depuis drive yvain sur drive familleSCHEDULED: <2022-05-21 Sat>Envoyé <2022-07-22 Fri>*** WAIT Mail Dr Adang pour détails collaboration
* KILL Vc-darcs:PROPERTIES::CUSTOM_ID: vc-darcs:ARCHIVE_TIME: 2022-07-23 Sat 00:14:ARCHIVE_FILE: /usr/home/alex/org/projects.org:ARCHIVE_OLPATH: Projets personnels:ARCHIVE_CATEGORY: projects:ARCHIVE_TODO: KILL:END:- ☐ Corriger record- Ajouter support pour push* KILL org-nutrition Tracker de calories (lisp):PROPERTIES::CUSTOM_ID: org-nutrition-tracker-de-calories-lisp:ARCHIVE_TIME: 2022-07-23 Sat 00:14:ARCHIVE_FILE: /usr/home/alex/org/projects.org:ARCHIVE_OLPATH: Projets personnels:ARCHIVE_CATEGORY: projects:ARCHIVE_TODO: KILL:END:*** Offline ?:PROPERTIES::CUSTOM_ID: offline:END:1. Data [[https://fdc.nal.usda.gov/download-datasets.html]] Notamment :full[[https://fdc.nal.usda.gov/fdc-datasets/FoodData_Central_csv_2021-04-28.zip]]CSV [[https://github.com/mrc/el-csv]] SQL[[https://github.com/skeeto/emacsql]]*** KILL REST ?:PROPERTIES::CUSTOM_ID: kill-rest:END:[[https://tkf.github.io/emacs-request/]][[https://fdc.nal.usda.gov/api-guide.html]]*** KILL Comparer REST et offline en performances:PROPERTIES::CUSTOM_ID: kill-comparer-rest-et-offline-en-performances:END:REST: search renvoie vraiment trop de résultats... Plus logique de lefaire avec le CSV mais les données sont éparpillées*** KILL comprendr les données:PROPERTIES::CUSTOM_ID: comprendr-les-données:END:1. ExplorationDoc: [[https://fdc.nal.usda.gov/portal-data/external/dataDictionary]]food.csv: contient l'identifiant (fdc_{id}) et le nom (description)ex:"fdc_{id}","data_{type}","description","food_{categoryid}","publication_{date}"food_{nutrient}.csv contient l'information intéressante pour l'ID(fdc_{id})"id","fdc_{id}","nutrient_{id}","amount","data_{points}","derivation_{id}","min","max","median","footnote","min_{yearacquired}"Exemple : huile WESSON (fdc_{id} = 1105904) : foods.csv:"1105904","branded_{food}","WESSON Vegetable Oil 1GAL","","2020-11-13"A beaucoup de nutrients : food_{nutrients}.csv:"1009437","1105904","","","Ingredients","3""13706913","1105904","203","0","","71","","","","","""13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706915","1105904","205","0","","75","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","","""13706917","1105904","269","0","","71","","","","","""13706918","1105904","291","0","","75","","","","","""13706919","1105904","301","0","","75","","","","","""13706920","1105904","303","0","","75","","","","","""13706921","1105904","306","0","","75","","","","","""13706922","1105904","307","0","","75","","","","","""13706923","1105904","318","0","","75","","","","","""13706924","1105904","324","0","","75","","","","","""13706925","1105904","401","0","","75","","","","","""13706926","1105904","601","0","","75","","","","","""13706927","1105904","605","0","","71","","","","","""13706928","1105904","606","13.33","","71","","","","","""13706929","1105904","645","20","","71","","","","","""13706930","1105904","646","53.33","","71","","","","",""En enlevant ceux qui sont nul (amount = 0)"1009437","1105904","","","Ingredients","3""13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","","""13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","",""En enlevant ceux qui sont redondant, on retrouve 5 (différents des 3mentionnés ??) food_{nutrients}.csv"13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","","""13706928","1105904","606","13.33","","71","","","","","""13706929","1105904","645","20","","71","","","","","""13706930","1105904","646","53.33","","71","","","","",""Les codes ne correspondent pas à nutrient.csv ounutrient_{incomingname}. mais d'après le site[[https://fdc.nal.usda.gov/fdc-app.html#/food-details/1455596/nutrients]](au passage, l'ID est encore différent) :- 204 = lipid- 208 = énergie- 606 = fat total saturated- 645 = fat total monounsaturated- 646 = fat total polyunsaturatedEn fait, le code est donné par nutrient_{nbr} dans nutrients.csv (!)2. En résuméRequirements : food.csv, nutrient.csv, food_{nutrients}.csv1. Chercher l'ID dans food.csv (nom = description, id = fdc_{id})2. Pour fdc_{id}, obtenir la liste des nutriments (nutrient_{id})avec leurs valeurs (amonut) dans food_{nutrients}.csv3. Convertir l'Id nutrient (nutrient_{nbr} = nutrient_{id}) en sonnom (nutrient_{nbr})avec nutrient.csv
* org-nutrition Tracker de calories (lisp):PROPERTIES::CUSTOM_ID: org-nutrition-tracker-de-calories-lisp:END:*** Offline ?:PROPERTIES::CUSTOM_ID: offline:END:1. Data [[https://fdc.nal.usda.gov/download-datasets.html]] Notamment :full[[https://fdc.nal.usda.gov/fdc-datasets/FoodData_Central_csv_2021-04-28.zip]]CSV [[https://github.com/mrc/el-csv]] SQL[[https://github.com/skeeto/emacsql]]*** KILL REST ?:PROPERTIES::CUSTOM_ID: kill-rest:END:[[https://tkf.github.io/emacs-request/]][[https://fdc.nal.usda.gov/api-guide.html]]*** KILL Comparer REST et offline en performances:PROPERTIES::CUSTOM_ID: kill-comparer-rest-et-offline-en-performances:END:REST: search renvoie vraiment trop de résultats... Plus logique de lefaire avec le CSV mais les données sont éparpillées*** TODO comprendr les données:PROPERTIES::CUSTOM_ID: comprendr-les-données:END:1. ExplorationDoc: [[https://fdc.nal.usda.gov/portal-data/external/dataDictionary]]food.csv: contient l'identifiant (fdc_{id}) et le nom (description)ex:"fdc_{id}","data_{type}","description","food_{categoryid}","publication_{date}"food_{nutrient}.csv contient l'information intéressante pour l'ID(fdc_{id})"id","fdc_{id}","nutrient_{id}","amount","data_{points}","derivation_{id}","min","max","median","footnote","min_{yearacquired}"Exemple : huile WESSON (fdc_{id} = 1105904) : foods.csv:"1105904","branded_{food}","WESSON Vegetable Oil 1GAL","","2020-11-13"A beaucoup de nutrients : food_{nutrients}.csv:"1009437","1105904","","","Ingredients","3""13706913","1105904","203","0","","71","","","","","""13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706915","1105904","205","0","","75","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","","""13706917","1105904","269","0","","71","","","","","""13706918","1105904","291","0","","75","","","","","""13706919","1105904","301","0","","75","","","","","""13706920","1105904","303","0","","75","","","","","""13706921","1105904","306","0","","75","","","","","""13706922","1105904","307","0","","75","","","","","""13706923","1105904","318","0","","75","","","","","""13706924","1105904","324","0","","75","","","","","""13706925","1105904","401","0","","75","","","","","""13706926","1105904","601","0","","75","","","","","""13706927","1105904","605","0","","71","","","","","""13706928","1105904","606","13.33","","71","","","","","""13706929","1105904","645","20","","71","","","","","""13706930","1105904","646","53.33","","71","","","","",""En enlevant ceux qui sont nul (amount = 0)"1009437","1105904","","","Ingredients","3""13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","","""13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","",""En enlevant ceux qui sont redondant, on retrouve 5 (différents des 3mentionnés ??) food_{nutrients}.csv"13706914","1105904","204","93.33","","71","","","","","""13706916","1105904","208","867","","71","","","","","""13706928","1105904","606","13.33","","71","","","","","""13706929","1105904","645","20","","71","","","","","""13706930","1105904","646","53.33","","71","","","","",""Les codes ne correspondent pas à nutrient.csv ounutrient_{incomingname}. mais d'après le site[[https://fdc.nal.usda.gov/fdc-app.html#/food-details/1455596/nutrients]](au passage, l'ID est encore différent) :- 204 = lipid- 208 = énergie- 606 = fat total saturated- 645 = fat total monounsaturated- 646 = fat total polyunsaturatedEn fait, le code est donné par nutrient_{nbr} dans nutrients.csv (!)2. En résuméRequirements : food.csv, nutrient.csv, food_{nutrients}.csv
* Projets personnels** Assistant:PROPERTIES::CATEGORY: assistant:END:*** DONE Regarder ce qu'Yvain a fait** CentoX***** Notes*** Extraction de données- Trop compliqué de travailles sur la structure du pdf- Extraire le tableau avec python ?- Comparaison- pdftotext : bon résultats sur page 1. Sur les ségrégations, il n’y a pas de retour à la ligne avant l’indication- pdfminer donne des résultats légèrement supérieurs, beaucoup d’espaces sur les ségrégations- pypdf2 : trop de retours à la lignes intempestifs dans le texteLa structure du tableau est perdue dans tous les cas
1. Chercher l'ID dans food.csv (nom = description, id = fdc_{id})2. Pour fdc_{id}, obtenir la liste des nutriments (nutrient_{id})avec leurs valeurs (amonut) dans food_{nutrients}.csv3. Convertir l'Id nutrient (nutrient_{nbr} = nutrient_{id}) en sonnom (nutrient_{nbr})avec nutrient.csv
**** ParserListe de parser : https://tomassetti.me/parsing-in-python/* Langues** Japonais:PROPERTIES::CATEGORY: japonais:END:*** Miura [1/7]**** DONE Leçon 1 [/]***** DONE Lire***** DONE Anki**** TODO Leçon 2 [/]***** DONE Lire***** TODO Anki****** TODO Grammaire**** TODO Leçon 3***** DONE Lire***** TODO Anki****** TODO Grammaire**** TODO Leçon 4***** DONE Lire***** TODO Anki****** TODO Grammaire**** TODO Leçon 5***** DONE Lire***** TODO Anki****** TODO Grammaire**** TODO Leçon 6***** DONE Lire***** TODO Anki****** TODO Grammaire**** TODO Leçon 7***** TODO Lire***** TODO Anki****** TODO Grammaire**** Lire*** Leçon Aya:PROPERTIES::CATEGORY: aya:END:**** TODO Lire dialogue fin leçon 10SCHEDULED: <2022-04-03 Sun>* Internat:PROPERTIES::CATEGORY: internat:END:** DONE Mail Dijon pour expliquer que c’est décalé :interchu:** Thèse :these:*** Trouver un sujet- Julien Thevenon ?- Jean-Paul ?- Didier ?** Droit au remords*** WAIT Envoi scolarité*** TODO Négocier avec Xavier Bertrand pour stage de cliniqueSCHEDULED: <2022-07-28 Thu>Revient de vacances à ce moment environ* Comptabilité avec ledger:PROPERTIES::CATEGORY: compta:END:** TODO janvier 2022** TODO février 2022** TODO Mars 2022SCHEDULED: <2022-06-12 Sun>** TODO Avril 2022** TODO Mail 2022* Apprendre le machine learning:PROPERTIES::CATEGORY: machine learning:END:[[https://www.reddit.com/r/MachineLearning/comments/5z8110/d_a_super_harsh_guide_to_machine_learning/][Source: reddit]]** TODO [[file:books.org::*The elements of statistical learning (217)][The elements of statistical learning (217)]] :*** TODO Chap 1-4*** TODO Chap 7-8** TODO [[https://www.coursera.org/learn/machine-learning/home/info][Andrew NG coursera]]** TODO The Deep Learning Book: https://www.deeplearningbook.org/front_matter.pdf** TODO Put tensor flow or torch on a linux box and run examples: http://cs231n.github.io/aws-tutorial/* Recherche:PROPERTIES::CATEGORY: recherche:END:** WDR45:PROPERTIES::CATEGORY: wdr45:END:*** WAIT Mail Dr Adang pour détails collaborationSCHEDULED: <2022-07-21 Thu>Envoyé <2022-07-22 Fri>
* Vc-darcs:PROPERTIES::CUSTOM_ID: vc-darcs:END:
*** TODO Donner la réponse à Chloé + Patricia Fergelot*** TODO Démarrer appel à collaboration avec ChloéSCHEDULED: <2022-10-01 Sat>** NF1 :nf1:*** Biblio**** TODO article T. Hirsch**** TODO Autre case report ?*** Trouver autres cas**** TODO Appel ANDDI rares**** TODO Appel ITACA*** DONE Accord Domiinque VIAUDMail envoyé par Juliette*** DONE Observatoire TEDNon*** TODO Contact Hirisch pour clinique de ses patients** Mustard :mustard:*** Données**** DONE Import Labkey**** TODO Clinique et nettoyage données labkey**** KILL Dxcare***** DONE Demande Dijon***** KILL Demande DPO Besançon**** KILL donnée pierre**CLOSED: [2022-05-05 jeu. 17:53]****** TODO Format de données finalVoir avec Paul**** TODO Fusionner avec donnée Paul*** Stockage**** DONE Accès scality au travail**** WAIT VPN pour Jehanne***** Banque :banque:** TODO Compte et CB société générale :banque:*** DONE SouscriptionCLOSED: [2022-04-23 Sat 17:13]*** DONE Carte bancaireDEADLINE: <2022-05-21 Sat>*** DONE Envoyer fiche de salaire*** KILL Envoyer relevé*** TODO Transfert compte bancaireSCHEDULED: <2022-07-21 Thu>**** TODO Attestation BoursoramaSCHEDULED: <2022-07-24 Sun>**** TODO Virement pour éviter les défauts de rélèvements* FreeBSD :freebsd:** TODO ormolu 0.5.0.0SCHEDULED: <2022-05-20 Fri>
- ☐ Corriger record- Ajouter support pour push
** Kitty*** KILL ne compile plusSCHEDULED: <2022-07-17 Sun>Non reproductible*** DONE v25.2Soumis* Génétique** TODO [[file:books.org::*Biologie chimie Dunod][Biologie chimie Dunod]]** TODO [[file:books.org::*Biologie cellulaire Dunod][Biologie cellulaire Dunod]]** TODO [[file:books.org::*Collège][Collège]]** TODO DES*** TODO Presentiel session 1 [5/9]**** DONE Introduction à la dysmorphologie**** DONE Structuration du génome et mécanismes mutationnels**** DONE Oncogénétique: introduction**** TODO Diagnostic prénatal**** DONE Grandes technologies et bioinformatique**** DONE Aspects réglementaires et éthiques**** TODO Mucoviscidose**** TODO Bases sur le conseil génétique**** TODO SEPI et TD*** TODO E-learning session 1 [4/6]**** DONE maladies endocriniennes et métabolisme**** DONE anomalies de la croissance**** TODO hématologie**** TODO maladies du tissu conjonctif**** DONE Oncogénétique**** DONE dermatogénétique*** TODO Presentiel session 2 [0/5]**** TODO Déficience intellectuelle**** TODO Génétique clinique et formelle**** TODO Pathologies fréquentes en génétique clinique**** TODO Génome humain : normal et pathologique**** TODO Maladies métaboliques*** TODO E-learning session 2 [1/5]**** DONE Syndromes microdélétionnels**** TODO Dysgonosomies**** TODO Cancer du colon: Maladie de Lynch et CMMRD**** TODO Déficience intellectuelle**** TODO Pathologies neuromusculaires** TODO DIU dysmorpho:PROPERTIES::CATEGORY: dysmorpho:END:*** Relire + ficher :anki:**** TODO Intro dysmorpho - Verloes**** TODO Empreinte génomique**** TODO Beckwith, Silver Russel**** TODO Scoliose**** TODO Syndromes cytogénétique - Salanville**** TODO Dysostose mandibulo faciale**** TODO Williams dup 7p11.2**** TODO Pathologie génétique de la reproduction**** TODO Malformations oculaires**** TODO Comprendre les test génétiques**** TODO Fente**** TODO Gonosome**** TODO Smith-Mangenis**** TODO 22q11**** TODO Dysmorpho nouveau-né**** TODO Autopsie foetale**** TODO Dysmorphologie - généralités (A Verloes)**** TODO Dysmorphologie du nouveau né (M Vincent)**** TODO Registre des malformations (N Lelong)**** TODO Comprendre les tests génétiques - Mutations - NGS (Y Vial)**** TODO Cytogénétique (C Missirian)**** TODO NGS et syndromologie (F Tran-Mau-Them)**** TODO Empreinte génomique (F Brioudé) (seq 15 Beckwith Wiedemann Syndrome et SRussel S)**** TODO Autopsie foetale (F Guimiot)**** TODO Tumeur et développement (H Cave)**** TODO Dysmorphologie foetale (MH Saint Frison)**** TODO Pathologie génétique de la reproduction (F Vialard)**** TODO Le dysmorphologiste en prénatal (N Gruchy)**** TODO Régulation génique et anomalies du développement (F Petit)**** TODO Echographie fœtale et dysmorphologie (C Rozel)**** TODO Déficience intellectuelle (A Curie)**** TODO Autisme et génétique (A Maruani)**** TODO Tests neuropsy**** TODO XLID(A Toutain)**** TODO Anomalies du développement embryonnaire précoce (C Quelin)**** TODO Anomalies de fermeture du tube neural (C Quelin)**** TODO FAS (D Germanaud)**** TODO Médicaments et grossesse (C Vauzelle)**** TODO Syndromes avec fentes oro-faciales- (J Van-Gils)**** TODO Syndromes avec craniosténose (C Collet)**** TODO Dents & syndromes (I Bailleul)**** TODO Dysostoses Mandibulo faciales (J Amiel)**** TODO Avances staturales (A Putoux)**** TODO Retards staturaux syndromiques (A Putoux)**** TODO Syndromes avec obésité (G Diene)**** TODO Spliceosomopathies (P Edery)**** TODO Microcéphalies (S Passemard)**** TODO Anomalies du cervelet : Joubert, NPH ... (L Burglen)**** TODO Epilepsie et syndromes (C Mignot)**** TODO Holoprosencéphalie (S Odent)**** TODO Hydrocephalie (S Odent)**** TODO Anomalies de migration (S Passemard)**** TODO Chondrodysplasies (G Baujat)**** TODO Anomalies de segmentation et scoliose (J Thévenon)**** TODO Génétique du développement des membres et principaux syndromes (F Petit)**** TODO Classification des malformations des membres (F Petit)**** TODO Prise en charge des anomalies des membres (N Quintero)**** TODO Syndromes avec anomalies uro-néphrologiques pré- et postnatal (G Morin)**** TODO Syndromes avec anomalies génitales et DSD (B Leheup)**** TODO Du coeur au syndrome (D Genevieve)**** TODO Malformation cardiaque en anténatal (D Genevieve)**** TODO Base génétique du déterminisme du sexe (C Colson)**** TODO Surdités syndromiques (S Marlin)**** TODO Malformations oculaires (N Chassaing)**** TODO Dermatologie et développement (P Vabres)**** TODO Dysmorphologie et métabolisme (M Barth)**** TODO Maladies de surcharge (D Germain)**** TODO Trisomie 21 (R Touraine)**** TODO S. Williams - duplication 7q11.2 (M Rossi)**** TODO Délétion 22q11.2 (L Perrin)**** TODO Syndromes cytogénétiques (D Sanlaville)**** TODO Gonosomes (J Leger)**** TODO Parcours de soin des patients avec anomalies du développement (N Jean-Marçais)**** TODO Prise en charge médicosociale du handicap (D Juzeau)**** TODO Fanconi (T Leblanc)**** TODO Ehlers-Danlos (D Germain)**** TODO Chromatinopathies: TAD - Kabuki, Rubinstein-Taybi, Wiedemann-Steiner, SBYSS... (D Genevieve)**** TODO Marfan et syndromes apparentés (G Jondeau)**** TODO RASopathies (Y Capri)**** TODO Syndromes de Pitt Hopkins, Angelman, Rett et Rett-like (N Bahi-Buisson)**** TODO Filaminopathies A (C Goizet)**** TODO Achondroplasie (G Baujat)**** TODO OI (G Baujat)**** TODO Ciliopathies: approche globale (T Attie-Bitach)**** TODO Smith-Magenis (L Perrin)**** TODO Cohésinopathies : Cornelia de Lange, Coffin-Siris/NB, CHOPS... (A Goldenberg)**** TODO Albinisme et syndromes apparentés (B Arveiler)**** TODO Beckwith Wiedemann Syndrome & Silver Russel Syndrome (F Brioude)**** TODO Neurofibromatoses - STB (C Goizet)**** TODO Cowden, Gorlin (P Goizet)**** TODO Syndrome de Kleefstra (L Perrin)**** TODO Téloméropathies (T Leblanc)*** DONE QROC 3*DEADLINE: <2022-06-18 Sat>*** DONE QROC S2*CLOSED: [2022-04-16 Sat 23:42] DEADLINE: <2022-04-16 Sat 23:59>*** DONE Mémoire* Divers** TODO Cadeau mariage :joris:SCHEDULED: <2022-08-04 Thu>** TODO Cadeaux mariage :florian:SCHEDULED: <2022-08-04 Thu>** TODO Copier photos famille depuis drive yvain sur drive familleSCHEDULED: <2022-05-21 Sat>
** Forcer le téléchargement de la release sur github:PROPERTIES::CUSTOM_ID: forcer-le-téléchargement-de-la-release-sur-github:END:Par défaut USE_github n'utilise pas la version officielle, voirhttps://bugs.freebsd.org/bugzilla/show_bug.cgi?id=261732 pour unediscussion.1. Enlever DISTVERSIONPREFIX= v2. +MASTER_SITES=https://github.com/${GH_ACCOUNT}/${PORTNAME}/releases/download/v${DISTVERSION}/3. Enlever -USE_GITHUB= yes4. USES=tar:xz On vérifiee dans distinfo le résultat** Vérifier avec portlint, formatter avec portfmt:PROPERTIES::CUSTOM_ID: vérifier-avec-portlint-formatter-avec-portfmt:END:** PR:PROPERTIES::CUSTOM_ID: pr:END:- Mettre le changlog dans URL- Ne pas utiliser PORTREVISION si DISTVERSION est incrémenté (car sertaux patches freebsd)- Cocher "maintainer approval" dans le patch (et pas maintainer-feedback!)** Haskell:PROPERTIES::CUSTOM_ID: haskell:END:- Tutorial:[[https://docs.freebsd.org/en/books/porters-handbook/special/#using-cabal]]- "when updating from something like 1.5.0.0 to 1.5.0.1 it is usuallysufficient to just bump the PORTVERSION. No need to refresh the wholeUSE_{CABAL} in this case."- 11.4 and 12.2 are enough (no need for aarch64)1. Git-annex "When updating such ports I do this:- Run make config and turn all options OFF.- Regenerate common USE_{CABAL}.- See if things build.- Then start enabling options one by one and adjust optionalizeddependencies until it builds.So yes, hs-git-annex is quite cumbersome port in this regard."** Python:PROPERTIES::CUSTOM_ID: python:END:Plusieurs versions de python Using "DEFAULT_VERSIONS=python=3.10" in"/usr/local/etc/poudriere.d/py310-make.conf" and adding "-z py310" to"poudriere testport"#+BEGIN_EXAMPLEdoas poudriere testport -z python38 -j 130Ramd64 -o deskutils/taskwarrior-tui^C#+END_EXAMPLE
** Forcer le téléchargement de la release sur github:PROPERTIES::CUSTOM_ID: forcer-le-téléchargement-de-la-release-sur-github:END:Par défaut USE_github n'utilise pas la version officielle, voirhttps://bugs.freebsd.org/bugzilla/show_bug.cgi?id=261732 pour unediscussion.1. Enlever DISTVERSIONPREFIX= v2. +MASTER_SITES=https://github.com/${GH_ACCOUNT}/${PORTNAME}/releases/download/v${DISTVERSION}/3. Enlever -USE_GITHUB= yes4. USES=tar:xz On vérifiee dans distinfo le résultat
- titre: x11/kitty: Update to XX- remplir URL du changelog- cocher "maintainer approval"
** Vérifier avec portlint, formatter avec portfmt** PR bugzilla- titre: x11/kitty: Update to XX- Mettre le changlog dans URL- Ne pas utiliser PORTREVISION si DISTVERSION est incrémenté (car sertaux patches freebsd)- Cocher "maintainer approval" dans le patch (et pas maintainer-feedback!)** Haskell:PROPERTIES::CUSTOM_ID: haskell:END:- Tutorial:[[https://docs.freebsd.org/en/books/porters-handbook/special/#using-cabal]]- "when updating from something like 1.5.0.0 to 1.5.0.1 it is usuallysufficient to just bump the PORTVERSION. No need to refresh the wholeUSE_{CABAL} in this case."- 11.4 and 12.2 are enough (no need for aarch64)1. Git-annex "When updating such ports I do this:
- Run make config and turn all options OFF.- Regenerate common USE_{CABAL}.- See if things build.- Then start enabling options one by one and adjust optionalizeddependencies until it builds.So yes, hs-git-annex is quite cumbersome port in this regard."** Python:PROPERTIES::CUSTOM_ID: python:END:Plusieurs versions de python Using "DEFAULT_VERSIONS=python=3.10" in"/usr/local/etc/poudriere.d/py310-make.conf" and adding "-z py310" to"poudriere testport"#+BEGIN_EXAMPLEdoas poudriere testport -z python38 -j 130Ramd64 -o deskutils/taskwarrior-tui^C#+END_EXAMPLE