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:CATEGORY: genetique
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* Ledger
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** TODO janvier 2022
** TODO février 2022
** TODO Mars 2022
SCHEDULED: <2022-06-12 Sun>
** TODO Avril 2022
** TODO Mail 2022
* Projet
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:CATEGORY: projets
:END:
** DONE Liste des videos tricks
DEADLINE: <2022-04-27 Wed>
** Assistant
:PROPERTIES:
:CATEGORY: assistant
:END:
*** DONE Regarder ce qu'Yvain a fait
Liste de parser : https://tomassetti.me/parsing-in-python/
* Machine learning
[[https://www.reddit.com/r/MachineLearning/comments/5z8110/d_a_super_harsh_guide_to_machine_learning/][Source: reddit]]
** TODO [[file:books.org::*The elements of statistical learning (217)][The elements of statistical learning (217)]] :
*** TODO Chap 1-4
*** TODO Chap 7-8
** TODO [[https://www.coursera.org/learn/machine-learning/home/info][Andrew NG coursera]]
** TODO The Deep Learning Book: https://www.deeplearningbook.org/front_matter.pdf
** TODO Put tensor flow or torch on a linux box and run examples: http://cs231n.github.io/aws-tutorial/
* WDR45
:PROPERTIES:
:CATEGORY: WDR45
:END:
** TODO Mail Dr Adang pour détails collaboration
SCHEDULED: <2022-07-21 Thu>
** TODO Donner la réponse à Chloé + Patricia Fergelot
** TODO Démarrer appel à collaboration avec Chloé
SCHEDULED: <2022-10-01 Sat>
** CentoX
*** Extraction de données
**** Texte
Trop compliqué de travailles sur la structure du pdf
- pdftotext : bon résultats sur page 1. Sur les ségrégations, il n’y a pas de retour à la ligne avant l’indication
- pdfminer donne des résultats légèrement supérieurs, beaucoup d’espaces sur les ségrégations
- pypdf2 : trop de retours à la lignes intempestifs dans le texte
La structure du tableau est perdue dans tous les cas
**** Parser
* Internat
** Interchu
*** TODO Mail Dijon pour expliquer que c’est décalé
** Thèse
*** TODO Voir avec Julien Thevenon pour sujet de thèse
*** TODO Voir avec Jean-Paul pour sujet de thèse
* Droit au remords
** WAIT Envoi scolarité
** TODO Négocier avec Xavier Bertrand pour stage de clinique
DEADLINE: <2022-07-17 Sun>
*** TODO Lire dialogue fin leçon 10
SCHEDULED: <2022-04-03 Sun>
:CATEGORY: aya
** TODO DES
**** DONE Introduction à la dysmorphologie
**** TODO Diagnostic prénatal
**** DONE Grandes technologies et bioinformatique
**** TODO Mucoviscidose
**** TODO Bases sur le conseil génétique
**** TODO SEPI et TD
**** TODO maladies du tissu conjonctif
*** TODO Presentiel session 2 [0/5]
**** TODO Déficience intellectuelle
**** TODO Génétique clinique et formelle
**** TODO Pathologies fréquentes en génétique clinique
**** TODO Génome humain : normal et pathologique
**** TODO Maladies métaboliques
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**** TODO Cancer du colon: Maladie de Lynch et CMMRD
**** TODO Déficience intellectuelle
**** TODO Pathologies neuromusculaires
:PROPERTIES:
:CATEGORY: dysmorpho
:END:
*** Relire + ficher :anki:
**** TODO Intro dysmorpho - Verloes
**** TODO Empreinte génomique
**** TODO Beckwith, Silver Russel
**** TODO Scoliose
**** TODO Syndromes cytogénétique - Salanville
**** TODO Dysostose mandibulo faciale
**** TODO Williams dup 7p11.2
**** TODO Pathologie génétique de la reproduction
**** TODO Malformations oculaires
**** TODO Comprendre les test génétiques
**** TODO Fente
**** TODO Gonosome
**** TODO Smith-Mangenis
**** TODO 22q11
**** TODO Dysmorpho nouveau-né
**** TODO Autopsie foetale
**** TODO Dysmorphologie - généralités (A Verloes)
**** TODO Dysmorphologie du nouveau né (M Vincent)
**** TODO Registre des malformations (N Lelong)
**** TODO Comprendre les tests génétiques - Mutations - NGS (Y Vial)
**** TODO Cytogénétique (C Missirian)
**** TODO NGS et syndromologie (F Tran-Mau-Them)
**** TODO Empreinte génomique (F Brioudé) (seq 15 Beckwith Wiedemann Syndrome et SRussel S)
**** TODO Autopsie foetale (F Guimiot)
**** TODO Tumeur et développement (H Cave)
**** TODO Dysmorphologie foetale (MH Saint Frison)
**** TODO Pathologie génétique de la reproduction (F Vialard)
**** TODO Le dysmorphologiste en prénatal (N Gruchy)
**** TODO Régulation génique et anomalies du développement (F Petit)
**** TODO Echographie fœtale et dysmorphologie (C Rozel)
**** TODO Déficience intellectuelle (A Curie)
**** TODO Autisme et génétique (A Maruani)
**** TODO Tests neuropsy
**** TODO XLID(A Toutain)
**** TODO Anomalies du développement embryonnaire précoce (C Quelin)
**** TODO Anomalies de fermeture du tube neural (C Quelin)
**** TODO FAS (D Germanaud)
**** TODO Médicaments et grossesse (C Vauzelle)
**** TODO Syndromes avec fentes oro-faciales- (J Van-Gils)
**** TODO Syndromes avec craniosténose (C Collet)
**** TODO Dents & syndromes (I Bailleul)
**** TODO Dysostoses Mandibulo faciales (J Amiel)
**** TODO Avances staturales (A Putoux)
**** TODO Retards staturaux syndromiques (A Putoux)
**** TODO Syndromes avec obésité (G Diene)
**** TODO Spliceosomopathies (P Edery)
**** TODO Microcéphalies (S Passemard)
**** TODO Anomalies du cervelet : Joubert, NPH ... (L Burglen)
**** TODO Epilepsie et syndromes (C Mignot)
**** TODO Holoprosencéphalie (S Odent)
**** TODO Hydrocephalie (S Odent)
**** TODO Anomalies de migration (S Passemard)
**** TODO Chondrodysplasies (G Baujat)
**** TODO Anomalies de segmentation et scoliose (J Thévenon)
**** TODO Génétique du développement des membres et principaux syndromes (F Petit)
**** TODO Classification des malformations des membres (F Petit)
**** TODO Prise en charge des anomalies des membres (N Quintero)
**** TODO Syndromes avec anomalies uro-néphrologiques pré- et postnatal (G Morin)
**** TODO Syndromes avec anomalies génitales et DSD (B Leheup)
**** TODO Du coeur au syndrome (D Genevieve)
**** TODO Malformation cardiaque en anténatal (D Genevieve)
**** TODO Base génétique du déterminisme du sexe (C Colson)
**** TODO Surdités syndromiques (S Marlin)
**** TODO Malformations oculaires (N Chassaing)
**** TODO Dermatologie et développement (P Vabres)
**** TODO Dysmorphologie et métabolisme (M Barth)
**** TODO Maladies de surcharge (D Germain)
**** TODO Trisomie 21 (R Touraine)
**** TODO S. Williams - duplication 7q11.2 (M Rossi)
**** TODO Délétion 22q11.2 (L Perrin)
**** TODO Syndromes cytogénétiques (D Sanlaville)
**** TODO Gonosomes (J Leger)
**** TODO Parcours de soin des patients avec anomalies du développement (N Jean-Marçais)
**** TODO Prise en charge médicosociale du handicap (D Juzeau)
**** TODO Fanconi (T Leblanc)
**** TODO Ehlers-Danlos (D Germain)
**** TODO Chromatinopathies: TAD - Kabuki, Rubinstein-Taybi, Wiedemann-Steiner, SBYSS... (D Genevieve)
**** TODO Marfan et syndromes apparentés (G Jondeau)
**** TODO RASopathies (Y Capri)
**** TODO Syndromes de Pitt Hopkins, Angelman, Rett et Rett-like (N Bahi-Buisson)
**** TODO Filaminopathies A (C Goizet)
**** TODO Achondroplasie (G Baujat)
**** TODO OI (G Baujat)
**** TODO Ciliopathies: approche globale (T Attie-Bitach)
**** TODO Smith-Magenis (L Perrin)
**** TODO Cohésinopathies : Cornelia de Lange, Coffin-Siris/NB, CHOPS... (A Goldenberg)
**** TODO Albinisme et syndromes apparentés (B Arveiler)
**** TODO Beckwith Wiedemann Syndrome & Silver Russel Syndrome (F Brioude)
**** TODO Neurofibromatoses - STB (C Goizet)
**** TODO Cowden, Gorlin (P Goizet)
**** TODO Syndrome de Kleefstra (L Perrin)
**** TODO Téloméropathies (T Leblanc)
*** DONE QROC 3
*DEADLINE: <2022-06-18 Sat>
*** DONE QROC S2
*CLOSED: [2022-04-16 Sat 23:42] DEADLINE: <2022-04-16 Sat 23:59>
*** DONE Mémoire
* Inbox
** TODO Mariage Joris :joris:
*** TODO cadeau
** TODO Mariage Florian :florian:
*** TODO Cadeau
** TODO Copier photos famille depuis drive yvain sur drive famille
SCHEDULED: <2022-05-21 Sat>
* Japonais
** Miura :miura:
*** TODO Leçon 1
**** DONE Lire
**** DONE Anki
*** TODO Leçon 2
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 3
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 4
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 5
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 6
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 7
**** TODO Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** Lire
** Leçon Aya
** WAIT Réclamer pour majoration pour taxe foncière :maison:
Mail envoyé<2022-07-16 Sat>
** TODO
** DIU dysmorpho
*** TODO E-learning session 2 [1/5]
**** DONE Syndromes microdélétionnels
**** DONE Oncogénétique
**** DONE dermatogénétique
**** DONE maladies endocriniennes et métabolisme
**** DONE anomalies de la croissance
**** TODO hématologie
*** TODO E-learning session 1 [4/6]
**** DONE Aspects réglementaires et éthiques
**** DONE Structuration du génome et mécanismes mutationnels
**** DONE Oncogénétique: introduction
*** TODO Presentiel session 1 [5/9]
** TODO [[file:books.org::*Collège][Collège]]
** Notes génétique :anki:
* Génétique
** [[file:books.org::*Biologie chimie Dunod][Biologie chimie Dunod]]
** [[file:books.org::*Biologie cellulaire Dunod][Biologie cellulaire Dunod]]
* FreeBSD :freebsd:
** TODO ormolu 0.5.0.0
SCHEDULED: <2022-05-20 Fri>
** TODO kitty ne compile plus
SCHEDULED: <2022-07-17 Sun>
* Banque :banque:
** TODO Compte et CB société générale :banque:
*** DONE Souscription
CLOSED: [2022-04-23 Sat 17:13]
*** TODO Carte bancaire
*** TODO Transfert compte bancaire ?
DEADLINE: <2022-05-21 Sat>
*** DONE Envoyer fiche de salaire
*** KILL Envoyer relevé
#+title: Someday
* Projets
#+title: Inbox
* DONE Réclamer pour majoration pour taxe foncière :maison:
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:ARCHIVE_TIME: 2022-07-21 Thu 22:45
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Mail envoyé<2022-07-16 Sat>
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** KILL Mysql
*** DONE Biblio
*** DONE Conception papier
*** DONE Prototype
*** DONE import tsv labkey
*** KILL ajout pièces jointes
*** KILL Demande hébergement
*** DONE Point avec Pierre
**On essaye avec excel ?
**Trop ambitieux (long, compliqué et problèmes de droits)
** KILL Site
*** KILL Prototype django/flask
#+title: Gtd
* Japonais
:PROPERTIES:
:CATEGORY: japonais
:END:
** Miura :miura:
*** TODO Leçon 1
**** DONE Lire
**** DONE Anki
*** TODO Leçon 2
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 3
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 4
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 5
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 6
**** DONE Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** TODO Leçon 7
**** TODO Lire
**** TODO Anki
***** TODO Grammaire
*** Lire
** Leçon Aya
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:CATEGORY: aya
:END:
*** TODO Lire dialogue fin leçon 10
SCHEDULED: <2022-04-03 Sun>
* Internat
:PROPERTIES:
:CATEGORY: internat
:END:
** DONE Mail Dijon pour expliquer que c’est décalé :interchu:
** Thèse :these:
*** TODO Voir avec Julien Thevenon pour sujet de thèse
*** TODO Voir avec Jean-Paul pour sujet de thèse
** Droit au remords
*** WAIT Envoi scolarité
*** TODO Négocier avec Xavier Bertrand pour stage de clinique
DEADLINE: <2022-07-17 Sun>
* Ledger
:PROPERTIES:
:CATEGORY: compta
:END:
** TODO janvier 2022
** TODO février 2022
** TODO Mars 2022
SCHEDULED: <2022-06-12 Sun>
** TODO Avril 2022
** TODO Mail 2022
* Projet
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:END:
** Assistant
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*** DONE Regarder ce qu'Yvain a fait
** CentoX
*** Extraction de données
**** Texte
Trop compliqué de travailles sur la structure du pdf
- pdftotext : bon résultats sur page 1. Sur les ségrégations, il n’y a pas de retour à la ligne avant l’indication
- pdfminer donne des résultats légèrement supérieurs, beaucoup d’espaces sur les ségrégations
- pypdf2 : trop de retours à la lignes intempestifs dans le texte
La structure du tableau est perdue dans tous les cas
**** Parser
Liste de parser : https://tomassetti.me/parsing-in-python/
* Machine learning
:PROPERTIES:
:CATEGORY: machine learning
:END:
[[https://www.reddit.com/r/MachineLearning/comments/5z8110/d_a_super_harsh_guide_to_machine_learning/][Source: reddit]]
** TODO [[file:books.org::*The elements of statistical learning (217)][The elements of statistical learning (217)]] :
*** TODO Chap 1-4
*** TODO Chap 7-8
** TODO [[https://www.coursera.org/learn/machine-learning/home/info][Andrew NG coursera]]
** TODO The Deep Learning Book: https://www.deeplearningbook.org/front_matter.pdf
** TODO Put tensor flow or torch on a linux box and run examples: http://cs231n.github.io/aws-tutorial/
* Recherche
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** WDR45
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*** TODO Mail Dr Adang pour détails collaboration
SCHEDULED: <2022-07-21 Thu>
*** TODO Donner la réponse à Chloé + Patricia Fergelot
*** TODO Démarrer appel à collaboration avec Chloé
SCHEDULED: <2022-10-01 Sat>
** NF1 :nf1:
*** Biblio
**** TODO article T. Hirsch
**** TODO Autre case report ?
*** Trouver autres cas
*** TODO Appel ANDDI rares
*** TODO Appel ITACA
*** DONE Domiinque VIAUD
Mail envoyé par Juliette
*** DONE Observatoire TED
Non
*** TODO Contact Hirisch pour clinique
** Mustard :mustard:
*** Données
**** DONE Import Labkey
**** TODO Clinique et nettoyage données labkey
**** HOLD Dxcare
***** DONE Demande Dijon
***** HOLD Demande DPO Besançon
**** KILL donnée pierre
**CLOSED: [2022-05-05 jeu. 17:53]
**** Importer donnée Paul sur le S
*** Stockage
**** DONE Accès scality au travail
**** WAIT VPN pour Jehanne
* Banque :banque:
** TODO Compte et CB société générale :banque:
*** DONE Souscription
CLOSED: [2022-04-23 Sat 17:13]
*** DONE Carte bancaire
DEADLINE: <2022-05-21 Sat>
*** DONE Envoyer fiche de salaire
*** KILL Envoyer relevé
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SCHEDULED: <2022-07-21 Thu>
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SCHEDULED: <2022-07-17 Sun>
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** [[file:books.org::*Biologie cellulaire Dunod][Biologie cellulaire Dunod]]
** Notes génétique :anki:
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** TODO [[file:books.org::*Collège][Collège]]
** TODO DES
*** TODO Presentiel session 1 [5/9]
**** DONE Introduction à la dysmorphologie
**** DONE Structuration du génome et mécanismes mutationnels
**** DONE Oncogénétique: introduction
**** TODO Diagnostic prénatal
**** DONE Grandes technologies et bioinformatique
**** DONE Aspects réglementaires et éthiques
**** TODO Mucoviscidose
**** TODO Bases sur le conseil génétique
**** TODO SEPI et TD
*** TODO E-learning session 1 [4/6]
**** DONE maladies endocriniennes et métabolisme
**** DONE anomalies de la croissance
**** TODO hématologie
**** TODO maladies du tissu conjonctif
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*** TODO Presentiel session 2 [0/5]
**** TODO Déficience intellectuelle
**** TODO Génétique clinique et formelle
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*** TODO E-learning session 2 [1/5]
**** DONE Syndromes microdélétionnels
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**** TODO Cancer du colon: Maladie de Lynch et CMMRD
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*** Relire + ficher :anki:
**** TODO Intro dysmorpho - Verloes
**** TODO Empreinte génomique
**** TODO Beckwith, Silver Russel
**** TODO Scoliose
**** TODO Syndromes cytogénétique - Salanville
**** TODO Dysostose mandibulo faciale
**** TODO Williams dup 7p11.2
**** TODO Pathologie génétique de la reproduction
**** TODO Malformations oculaires
**** TODO Comprendre les test génétiques
**** TODO Fente
**** TODO Gonosome
**** TODO Smith-Mangenis
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**** TODO Dysmorpho nouveau-né
**** TODO Autopsie foetale
**** TODO Dysmorphologie - généralités (A Verloes)
**** TODO Dysmorphologie du nouveau né (M Vincent)
**** TODO Registre des malformations (N Lelong)
**** TODO Comprendre les tests génétiques - Mutations - NGS (Y Vial)
**** TODO Cytogénétique (C Missirian)
**** TODO NGS et syndromologie (F Tran-Mau-Them)
**** TODO Empreinte génomique (F Brioudé) (seq 15 Beckwith Wiedemann Syndrome et SRussel S)
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**** TODO Tumeur et développement (H Cave)
**** TODO Dysmorphologie foetale (MH Saint Frison)
**** TODO Pathologie génétique de la reproduction (F Vialard)
**** TODO Le dysmorphologiste en prénatal (N Gruchy)
**** TODO Régulation génique et anomalies du développement (F Petit)
**** TODO Echographie fœtale et dysmorphologie (C Rozel)
**** TODO Déficience intellectuelle (A Curie)
**** TODO Autisme et génétique (A Maruani)
**** TODO Tests neuropsy
**** TODO XLID(A Toutain)
**** TODO Anomalies du développement embryonnaire précoce (C Quelin)
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**** TODO Syndromes avec fentes oro-faciales- (J Van-Gils)
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**** TODO Dents & syndromes (I Bailleul)
**** TODO Dysostoses Mandibulo faciales (J Amiel)
**** TODO Avances staturales (A Putoux)
**** TODO Retards staturaux syndromiques (A Putoux)
**** TODO Syndromes avec obésité (G Diene)
**** TODO Spliceosomopathies (P Edery)
**** TODO Microcéphalies (S Passemard)
**** TODO Anomalies du cervelet : Joubert, NPH ... (L Burglen)
**** TODO Epilepsie et syndromes (C Mignot)
**** TODO Holoprosencéphalie (S Odent)
**** TODO Hydrocephalie (S Odent)
**** TODO Anomalies de migration (S Passemard)
**** TODO Chondrodysplasies (G Baujat)
**** TODO Anomalies de segmentation et scoliose (J Thévenon)
**** TODO Génétique du développement des membres et principaux syndromes (F Petit)
**** TODO Classification des malformations des membres (F Petit)
**** TODO Prise en charge des anomalies des membres (N Quintero)
**** TODO Syndromes avec anomalies uro-néphrologiques pré- et postnatal (G Morin)
**** TODO Syndromes avec anomalies génitales et DSD (B Leheup)
**** TODO Du coeur au syndrome (D Genevieve)
**** TODO Malformation cardiaque en anténatal (D Genevieve)
**** TODO Base génétique du déterminisme du sexe (C Colson)
**** TODO Surdités syndromiques (S Marlin)
**** TODO Malformations oculaires (N Chassaing)
**** TODO Dermatologie et développement (P Vabres)
**** TODO Dysmorphologie et métabolisme (M Barth)
**** TODO Maladies de surcharge (D Germain)
**** TODO Trisomie 21 (R Touraine)
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**** TODO Parcours de soin des patients avec anomalies du développement (N Jean-Marçais)
**** TODO Prise en charge médicosociale du handicap (D Juzeau)
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**** TODO Ehlers-Danlos (D Germain)
**** TODO Chromatinopathies: TAD - Kabuki, Rubinstein-Taybi, Wiedemann-Steiner, SBYSS... (D Genevieve)
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**** TODO RASopathies (Y Capri)
**** TODO Syndromes de Pitt Hopkins, Angelman, Rett et Rett-like (N Bahi-Buisson)
**** TODO Filaminopathies A (C Goizet)
**** TODO Achondroplasie (G Baujat)
**** TODO OI (G Baujat)
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**** TODO Cohésinopathies : Cornelia de Lange, Coffin-Siris/NB, CHOPS... (A Goldenberg)
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*** DONE QROC 3
*DEADLINE: <2022-06-18 Sat>
*** DONE QROC S2
*CLOSED: [2022-04-16 Sat 23:42] DEADLINE: <2022-04-16 Sat 23:59>
*** DONE Mémoire
* Divers
** TODO Cadeau mariage :joris:
SCHEDULED: <2022-08-04 Thu>
** TODO Cadeaux mariage :florian:
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SCHEDULED: <2022-05-21 Sat>