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Deux électrodes sont plongées dans la solution pour laquelle la
concentration est recherchée. Une électrode est saturée et sert de
référence. La seconde est à membrane de verre et va permettre le passage
des ions en solution. Ce déplacement va induire une différence de
potentiel par rapport à l'électrode de référence. Cette différence
permet de calculer la concentration avec la loi de Nernst:
Deux électrodes sont plongées dans la solution pour laquelle la concentration est recherchée. Une électrode est saturée et sert de référence. La seconde est à membrane de verre et va permettre le passage des ions en solution. Ce déplacement va induire une différence de potentiel par rapport à l'électrode de référence. Cette différence permet de calculer la concentration avec la loi de Nernst:
La potentiométrie **directe** va mesurer directement dans le volume de
la solution. La potentiométrie **indirecte** va s\'effecture sur volume
plasmatique, qui va être dilué à 1/10e.
La potentiométrie **directe** va mesurer directement dans le volume de la solution. La potentiométrie **indirecte** va s\'effecture sur volume plasmatique, qui va être dilué à 1/10e.
Pour la potentiométrie indirecte, il y a un risque de
pseudo-hyponatrémie en cas d\'hyperprotidémie ou hyperlipidémie. En
effet, le volume plasmatique contient alors moins d\'eau et plus de
lipides/protéines. La concentration est mesurée sur le volume
plasmatique mais rendue sur l\'eau plasmatique. Le volume d\'eau
plasmatique étant diminué, la concentration sera donc sous-estimée.
Pour la potentiométrie indirecte, il y a un risque de pseudo-hyponatrémie en cas d\'hyperprotidémie ou hyperlipidémie. En effet, le volume plasmatique contient alors moins d\'eau et plus de lipides/protéines. La concentration est mesurée sur le volume plasmatique mais rendue sur l\'eau plasmatique. Le volume d\'eau plasmatique étant diminué, la concentration sera donc sous-estimée.
Très répandues dans les tissus.
Ces enzymes permettent le passage des métabolites à travers les membranes cellulaires. Cela se fait via une catalyse de l\'hydrolyse d\'esters monophosphorique à pH alcalin, qui va libérer du phosphate.
Les isoenzymes ont la même activité et ont une spécificité plus ou moins variables.
# Production
## Effet
Adulte Âge Garçons Filles
-------- ----------- ------------------- ------------- -------------
Hommes 40-129U/L 0 -- 14 jours 83‑248 U/L 83‑248 U/L
Femmes 35-104U/L 15 jours \< 1 an 122‑469 U/L 122‑469 U/L
1 -- \< 10 ans 142‑335 U/L 142‑335 U/L
10 -- \< 13 ans 129‑417 U/L 129‑417 U/L
13 -- \< 15 ans 116‑468 U/L 57‑254 U/L
15 -- \< 17 ans 82‑331 U/L 50‑117 U/L
17 -- \< 19 ans 55‑149 U/L 45‑87 U/L
# Principales interactions analytiques
- gammapathie de type IgM
- hémolyse si \> 200mg/dL
## Dosage
- physiologiques : augmentation à partir de la 20e smaine de
grossesses, **augmenté chez enfants/adolescents** (activité des
ostéoblastes en croissance osseuse)
- iatrogènes : augmentation pour anticoagulants oraux,
antiépileptiques, hypogylcémiants oraux, érythromycine,
ciclosporine, phénothiazine; diminution pour hypolipémiant,
corticoïdes, oestrogène
- patholoqiques :
- obésité ou malnutrition
- maladies hépato-biliaires cholestatiques
- maladies osseuse avec régénération ostéoblastique
- cholestase gravidique
- maladies intestinales (certaines)
- suivi de tumeurs des os et cancers du foie (primitifs ou
secondaires),
Les glucides provenant de l'alimentation sont transformées en glucose
pour être transporté dans le sang (avec conversion fructose et galactose
-\> glucose dans le foie). Celui-ci va être transporté au travers de la
membrane des différentes cellules du corps. Le glucose y sera utilisé
pour pour générer de l'énergie (glycose) ou y être stocké sous forme de
glycogène (foie surtout, muscle).
Les glucides provenant de l'alimentation sont transformées en glucose pour être transporté dans le sang (avec conversion fructose et galactose -\> glucose dans le foie). Celui-ci va être transporté au travers de la membrane des différentes cellules du corps. Le glucose y sera utilisé pour pour générer de l'énergie (glycose) ou y être stocké sous forme de glycogène (foie surtout, muscle).
La formation de glucose peut se faire à partir d'acide aminés et le
glycérol des acides gras , principalement dans le foie par
néoglucogenèse. Le glucose peut également être généré à partir du
glycogène par glycogénolyse. Pour fournir de l'énergie, la glycolyse
convertit le glucose en pyruvate puis en acetyl coenzyme A. L'Acetol
-CoA va servir 1. à synthétiser des triglycérides et 2. à générer de
l'hydrogène et du CO~2~ (cycle de Krebs). L'oxidation de l'hydrogène
fournira alors de l'énergie. À noter que la glycolyse peut être
anaérobie avec une efficacité fortement diminuée et conversion du
pyruvate en acide lactique. Une voie alternative de dégradation du
glucoe peut se faire via la voie du pentose phosphate (30% des réactions
dans le foie et important dans les cellules adipeuse).
La formation de glucose peut se faire à partir d'acide aminés et le glycérol des acides gras , principalement dans le foie par néoglucogenèse. Le glucose peut également être généré à partir du glycogène par glycogénolyse. Pour fournir de l'énergie, la glycolyse convertit le glucose en pyruvate puis en acetyl coenzyme A. L'Acetol -CoA va servir 1. à synthétiser des triglycérides et 2. à générer de l'hydrogène et du CO~2~ (cycle de Krebs). L'oxidation de l'hydrogène fournira alors de l'énergie. À noter que la glycolyse peut être anaérobie avec une efficacité fortement diminuée et conversion du pyruvate en acide lactique. Une voie alternative de dégradation du glucoe peut se faire via la voie du pentose phosphate (30% des réactions dans le foie et important dans les cellules adipeuse).
## pO2
Dans les poumons, l'oxygène diffuse au niveau des alvéoles via le sang.
Il y est combiné à l'hémoglobine des globules rouges et transporté vers
les cellules dans les artères. Il est ensuite libéré dans les tissus.
L'oxygène est consommé pour la respiration cellulaires par les
mitochondries afin de générer de l'énergie sous forme d'ATP
Valeurs de référence (adulte)
- pO2 artériel : 70 - 100 mmHg (9.5 - 13.3 kPa)
La γ-glutamyltranspeptidase est impliquée dans le transfert des acides
aminés au travers de la membrane cellulaire et dans le métablosme du
glutathione. Elle se trouve dans le foie, pancréas, reins, rate,
poumons, prostate.
La γ-glutamyltranspeptidase est impliquée dans le transfert des acides aminés au travers de la membrane cellulaire et dans le métablosme du glutathione. Elle se trouve dans le foie, pancréas, reins, rate, poumons, prostate.
L\'aspartate transférase est une enzyme transaminase qui va transférer
un groupement amine depuis un acide aminé (aspartate) vers un acide
cétonique (acide α-cétoglutarique) selon la réaction
L\'aspartate transférase est une enzyme transaminase qui va transférer un groupement amine depuis un acide aminé (aspartate) vers un acide cétonique (acide α-cétoglutarique) selon la réaction
L\'ASAT est le point de départ de nombreuses réactions métaboliques (ex:
pyrimidine) et le glutamate est impliqué dans le cycle glucose-alanine.
L\'ASAT est le point de départ de nombreuses réactions métaboliques (ex: pyrimidine) et le glutamate est impliqué dans le cycle glucose-alanine.
Elle se trouve principalement dans les cellules hépatiques et
cardiaques, et dans une moindre mesure dans les muscles squelettiques,
reins, pancréas, globules rouges et cerveau.
Elle se trouve principalement dans les cellules hépatiques et cardiaques, et dans une moindre mesure dans les muscles squelettiques, reins, pancréas, globules rouges et cerveau.
@article{thomas2005consensus,
title={Consensus of DGKL and VDGH for interim reference intervals on enzymes in serum Konsensus von DGKL und VDGH zu vorl{\"a}ufigen Referenzbereichen f{\"u}r Serumenzyme},
author={Thomas, Lothar and M{\"u}ller, Matthias and Schumann, Gerhard and Weidemann, Gerhard and Klein, Gerhard and Lunau, Stephan and Pick, Karl-Heinz and Sonntag, Oswald},
journal={LaboratoriumsMedizin},
volume={29},
number={5},
pages={301--308},
year={2005},
publisher={De Gruyter}
}
@book{bonnefont2019explorations,
title={Explorations en biochimie m{\'e}dicale: interpr{\'e}tations et orientations diagnostiques},
author={Bonnefont-Rousselot, Dominique and Beaudeux, Jean-Louis and Charpiot, Philippe},
year={2019},
publisher={Lavoisier m{\'e}decine sciences}
}
@article{abicht2001multicenter,
title={Multicenter evaluation of new GGT and ALP reagents with new reference standardization and determination of 37 C reference intervals},
author={Abicht, K and El-Samalouti, V and Junge, W and Kroll, M and Luthe, H and Treskes, M and Klein, G},
journal={Clin Chem Lab Med},
volume={39},
pages={346},
year={2001}
}
@article{biomnis,
title={Pr{\'e}cis de Biopathologie - Analyses m{\'e}dicales sp{\'e}cialis{\'e}es},
author={Biomnis},
year={2012}
}
@book{thomas2008labor,
title={Labor und Diagnose: Indikation und Bewertung von Laborbefunden f{\"u}r die medizinische Diagnostik},
author={Thomas, Lothar},
year={2008},
publisher={TH-Books-Verlag-Ges.}
}
@article{lohr2009reference,
title={Reference range study for various parameters on Roche clinical chemistry analyzers.},
author={L{\"o}hr, B and El-Samalouti, V and Junge, W and Maatouk, H and Halabi, A and Fahle, A and Bossert-Reuther, S and Jung, M and Berding, C and Domke, I},
journal={Clinical laboratory},
volume={55},
number={11-12},
pages={465--471},
year={2009}
}
@article{american2004management,
title={Management of hyperbilirubinemia in the newborn infant 35 or more weeks of gestation},
author={American Academy of Pediatrics Subcommittee on Hyperbilirubinemia and others},
journal={Pediatrics},
volume={114},
number={1},
pages={297--316},
year={2004}
}
@book{mcpherson2007,
title={Henry's clinical diagnosis and management by laboratory methods},
author={McPherson, Richard A and Pincus, Matthew R},
year={2007},
publisher={Elsevier Health Sciences}
}
@book{soldin2005pediatric,
title={Pediatric reference ranges},
author={Soldin, Steven J and Brugnara, Carlo and Wong, Edward C},
year={2005},
publisher={Amer. Assoc. for Clinical Chemistry}
}
@article{junge2001development,
title={Development and evaluation of assays for the determination of total and pancreatic amylase at 37 C according to the principle recommended by the IFCC},
author={Junge, Wolfgang and Wortmann, Werner and Wilke, B{\"a}rbel and Waldenstr{\"o}m, Johann and Kurrle-Weittenhiller, Angelika and Finke, J{\"u}rgen and Klein, Gerhard},
journal={Clinical biochemistry},
volume={34},
number={8},
pages={607--615},
year={2001},
publisher={Elsevier}
}
@inproceedings{junge1999evaluation,
title={Evaluation of the colorimetric liquid assay for pancreatic lipase on Hitachi analyzers in 7 clinical centers in Europe, Japan and USA.},
author={Junge, M and Abicht, K and Goldman, J and Luthe, H and Niederau, C and Parker, J and Watanabe, S and Klein, G and Prinzing, U},
booktitle={CLINICAL CHEMISTRY},
volume={45},
number={6},
pages={A51--A51},
year={1999},
organization={AMER ASSOC CLINICAL CHEMISTRY 2101 L STREET NW, SUITE 202, WASHINGTON, DC~…}
}
}
@book{van2019davis,
title={Davis's comprehensive manual of laboratory and diagnostic tests with nursing implications},
author={Van Leeuwen, Anne M and Bladh, Mickey L},
year={2019},
publisher={FA Davis}
}
@article{estey2013clsi,
title={CLSI-based transference of the CALIPER database of pediatric reference intervals from Abbott to Beckman, Ortho, Roche and Siemens Clinical Chemistry Assays: direct validation using reference samples from the CALIPER cohort},
author={Estey, Mathew P and Cohen, Ashley H and Colantonio, David A and Chan, Man Khun and Marvasti, Tina Binesh and Randell, Edward and Delvin, Edgard and Cousineau, Jocelyne and Grey, Vijaylaxmi and Greenway, Donald and others},
journal={Clinical biochemistry},
volume={46},
number={13-14},
pages={1197--1219},
year={2013},
publisher={Elsevier}
# -*- mode: org; -*-
#+latex_class: fiche
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#+latex_header: \usepackage{enumitem}
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- Physiologie: impliqué dans le transfer des acides aminés au travers
de la membrane cellulaire et dans le métablosme du glutathione.
- Tissus: foie, pancréase, reins, rate, poumons, prostate. La version
circulante est surtout d'origine hépatique
- Principe analytique: Test colorimétrique enzymatique
- mesure par photométrie à 415nm (absorbance) de la quantité
d'amino-5 nitro-2 benzoate, qui est proportionnelle à l'activité
de la γGT
- Intérêt: marqueur sensible pour affection hépatique ou biliaire (peu
spécifique)
- Valeurs de référence (consensus IFCC 2005)
- homme \< 60U/L
- femme \< 40U/L
- Causes d'augmentation
- alcool
- médicaments (tricycilque, contraceptifs oraux, phénobarbital)
- affection hépatobiliaire
- population africaine
- Domaine de mesure: 3-1200U/L
- Volume échantillon (normal): 2.3μL
- Type échantillon : sérum, plasma (héparinate de lithium, EDTA)
- Limites:
- interférence : hémolyse \>200mg/dL (H3 sur Abott), bilirubine
conjuguée \> 50mg/dL (\> H4), bilirubine non conjugée \> 20,
lipémie \> 1500 (mg/dL)
- faux si gammapathie IgM (très rare)
- Temps commun à tous les marqueurs: 10min
# ASAT (aspartat aminotransférase)
- Principe : voir ALAT
- Intérêt : souffrance cellulaire du foie, du coeur, des muscles, du
rein. Similaire à ALAT mais moins spécifique du foie :
- embolie pulmonaire, pancréatite, aigüe, écrasement musculaire,
maladie hémolytique
- Valeurs de références : [^1]
- hommes \< 50U/L
- femmes \< 35U/L
- Volume échantillon: 4.5μL
- Domaine de mesure : 5-700U/L
- Type échantillon : sérum, plasma (héparinate de lithium, EDTA)
- Limite:
- interférence : **hémolyse \> 50mg/dL** (entre H1 et H2)
\[augmentation\], ictère \> 60mg/DL (\>H4), lipémie \> 500 (\>
H4)
- gammapathie IgM (très rare)
# PAL
- Principe : mesure par photométrie à 450 nm de la quantité de
p-nitrophénol, qui est proportionnelle à l'activité catalytique de
la phosphatase alcaline
- Intérêt : cholestase mais aussi pathologies osseuses, cancers
- Valeurs de références :[^2]
- hommes 40-129U/L
- femmes 35-104U/L
- enfants : voir fiche technique
- Volume échantillon: 2.1μL
- Type échantillon : sérum, plasma (héparinate de lithium)
- Domaine de mesure :5-1200U/L
- Limite:
- interférence : hémolyse si \> 200mg/dL (H3) ictère si \> 60mg/DL
(\> H4), lipémie si \> 2000
- **augmenté chez enfants/adolescents** (activité des ostéoblastes
en croissance osseuse)
# Lipase
# Footnotes
[^1]: Thomas L, Muller M, Schumann G, et al. Consensus of DGKL and VDGH
for interim reference intervals on enzymes in serum. J Lab Med
2005;29(5):301-308.
[^2]: Thomas L, Muller M, Schumann G, et al. Consensus of DGKL and VDGH
for interim reference intervals on enzymes in serum. J Lab Med
2005;29(5):301-308.
```{=org}
#+setupfile: ./fiche.setup
```
# Localisation, physiologie [@biomnis]
Ces enzymes permettent le passage des métabolites à travers les
membranes cellulaires. Cela se fait via une catalyse de l\'hydrolyse
d\'esters monophosphorique à pH alcalin, qui va libérer du phosphate.
Les isoenzymes ont la même activité et ont une spécificité plus ou moins
variables.
# Production
L\'altération de la membrane cellulaire va libérer les enzymes. Leur
répartition est variable : placenta, intestin, cellules rénales,
ostéoblastes, cellules hépatiques.
# Principe analytique de mesure
Test colorimétrique. Mesure par photométrie à 450 nm de la quantité de
p-nitrophénol, qui est proportionnelle à l'activité catalytique de la
phosphatase alcaline
# Valeurs de référence [@abicht2001multicenter] [@estey2013clsi]
Adulte Âge Garçons Filles
-------- ----------- ------------------- ------------- -------------
Hommes 40-129U/L 0 -- 14 jours 83‑248 U/L 83‑248 U/L
Femmes 35-104U/L 15 jours \< 1 an 122‑469 U/L 122‑469 U/L
1 -- \< 10 ans 142‑335 U/L 142‑335 U/L
10 -- \< 13 ans 129‑417 U/L 129‑417 U/L
13 -- \< 15 ans 116‑468 U/L 57‑254 U/L
15 -- \< 17 ans 82‑331 U/L 50‑117 U/L
17 -- \< 19 ans 55‑149 U/L 45‑87 U/L
# Principales interactions analytiques
- gammapathie de type IgM
- hémolyse si \> 200mg/dL
# Vigilance pré-analytiques et analytiques
- tube héparinate de lithium
# Variations [@bonnefont2019explorations]
- physiologiques : augmentation à partir de la 20e smaine de
grossesses, **augmenté chez enfants/adolescents** (activité des
ostéoblastes en croissance osseuse)
- iatrogènes : augmentation pour anticoagulants oraux,
antiépileptiques, hypogylcémiants oraux, érythromycine,
ciclosporine, phénothiazine; diminution pour hypolipémiant,
corticoïdes, oestrogène
- patholoqiques :
- obésité ou malnutrition
- maladies hépato-biliaires cholestatiques
- maladies osseuse avec régénération ostéoblastique
- cholestase gravidique
- maladies intestinales (certaines)
- suivi de tumeurs des os et cancers du foie (primitifs ou
secondaires),
import Development.Shake
import Development.Shake.Command
import Development.Shake.FilePath
import Development.Shake.Util
gds = [ "bicarbonates"
, "calcium"
, "chlore"
, "glucose"
, "pco2"
, "ph"
, "po2"
]
main :: IO ()
main = shakeArgs shakeOptions{shakeFiles="_build"} $ do
phony "clean" $ do
putInfo "Cleaning files in _build"
removeFilesAfter "_build" ["//*"]
"_build//*.docx" %> \out -> do
let c = "parametres" </> dropDirectory1 out -<.> "org"
need [c]
cmd_ "pandoc" [c] "-o" [out]
phony "docx" $ do
org <- getDirectoryFiles "" ["parametres//*.org"]
need [ "_build" </> dropDirectory1 (c -<.> "docx") | c <- org ]
want [ "_build" </> x <.> "docx" | x <- gds ]
```{=org}
#+setupfile: ./fiche.setup
```
# Localisation, rôle physiologique
L'oxygène est prépondérant pour les cellules dans les différents tissus
du corps.
# Tissus/organes de production et d\'élimination
Dans les poumons, l'oxygène diffuse au niveau des alvéoles via le sang.
Il y est combiné à l'hémoglobine des globules rouges et transporté vers
les cellules dans les artères. Il est ensuite libéré dans les tissus.
L'oxygène est consommé pour la respiration cellulaires par les
mitochondries afin de générer de l'énergie sous forme d'ATP
# Valeurs de référence (adulte)
pO2 artériel : 70 - 100 mmHg (9.5 - 13.3 kPa)
# Principe analytique de mesure
Ampérométrie par mesure du courant généré entre 2 électrodes suite à la
réaction de réduction de l'oxygène
# Principales interactions analytiques
- Dilution si prélèvement sur cathéter
- Tube EDTA, citrate, fluorure **proscrits**
# Vigilance pré-analytiques et analytiques
- Vérifier que la température est renseignée
- Absence de caillot ou de bulle
- Seringue/capillaire hépariné
- 1mL minimum pour une seringue (si \< 0.5, choisir une analyse),
100μL pour un capillaire
- Acheminement rapide : consommation d'oxygène par l'échantillon
- Consommation d'oxygène impacté par les globules rouges, blancs et la
température
# Augmentation et diminution
- Une hypoxémie correspond à une diminution de la PaO2 (note: à
différencier de l'hypoxie qui est une insuffisance d'oxygénation
tissulaire. Il peut y avoir une hypoxémie sans hypoxie !)