MGASR6OOXFTVDUJ73QB3VFMWK24KS5Z6W4PG2OGRYVGTE27NRH2AC
5V2VSVHZ4YLQTYHXWVZNTJUHJA75PISP4L75WX6CSPBXVQW3N7MQC
2BKKEEAI6LXWAGZNMPE4PL4GQANNUDWHH3Q5S42X5KP6N7UAIEIAC
KGVJVXKSGZWPIN5IMUBOAVDSRVIUVMTGKENESFYFKGEFDJQV5EKAC
MMI44TVZVGLUA6UJM2TFXP63JYBRL5TKMFVBMZZJOJINQ4Z6Q32QC
ORKQ5SEYZULGUEW77EL3XBLKU7VAJP7TDPULU7VKTOQFWD2YI4LQC
M4FP5S4GDAXRHFE6P4BIC47UY6MBU4WEVOE2F7UN6EJSAROBJ3VQC
BE2K3MCTTASVRK2KXWMKUA6JNI27EMX6EM3TU35FF777Z2KJCSSQC
F7ZOM4ZVXTE2TIAAYM5UVYKDVCGTAFP6ZRTUNDZYNA2UJIVKE6DQC
JGMCSDW663DQSK7XSWDBPVYQE57ZBP7ZVZLSEXUJOQVE7KY6BB4QC
NBJFXQNG6YLIEL6HK7VZDEQZTXK2QJZ43AKNLXIIBX5K3MOX6WCQC
EI4ZKZOKWBCWZGLYZRCSGFADRQ7YMTR4WC35DVN4O3OTNG7ZDU4QC
C4VEKRLSFK4SZVTN4K7OSNEC5DC73W4IQFD2YPHRIJBTX242UXPQC
5LNTATXR4XSM5LS7VVSSS7YIAWGAPIXZRTUWRS4AGEIAAYGVOINAC
6NDWGMZKNTDZ6GSJRMP3CZPL3CBFZUB6EOX26N6VFAYRWI6ZG6LAC
UCY46OGXVFKTTU3P77DSKMHWUIPLZM4E35YH7ZPKFOACFXUGQ3YQC
HZCWLS6PFEONJTLJCFL6FIJZ47B4PDBMIB2OEB3FQAHMUA6XK26QC
ICLLLNLXVJ3V5BWFUZJTGWNCEZMYA7UQHL4CXF64UTXOZJH2ZFXQC
6LZYRN2QNXK6OZGWTG7KUGBVYIAXAYCSYBHDJO7KDTIGSMD5VXMAC
CUUCQS3XSXV53MBGB4QF6NO44B65AZP76YBDW4TLMKHJT2LPTTKQC
XS2354QE7WE5TTV7ZNLFIJY7VVFAQS5AKFUCVSJAB4DIRWLDOT6AC
E74X5AW74VOVLQOVTV4423IVLXP2RRPYAGOO4VHBKNSFEY3DKQYAC
G3GDNJJXZAKIMG7FGKD3W5DQLXOKHYLKMSNGXYZJGAS3SM376A6QC
EATIHU2DS3UQF3VRYBV3AEAQC3ZWFBFN3YV5SIL35RG7DHOJIPIQC
EQTHKRH3HDFEYRRHDSK33YPKCPOMSAGD4WJROCWONA3TQTVSI3FAC
BSMHTILPNZM4GXX3GB6UIKGKY3I5LMMXZMNC2IM655CS4STENLAAC
5Z6SA3IPFTBT6THCOGDHS6HMGPZM5HGIZWSEQBXJRXLRWYMTMFPAC
LVC343SP6DE6OZFJVW26JIF6EWRPFQLLI6MXVHXVZDTEEZ7IVIOQC
E4TC2L7ZNPQX6UAYHWGM7ZWGMIUKMCFX4GBVL24DKCE44B3TMTUAC
IZTJOD2WSQ3UDD7HH4LNF4KWQKMJXFFRBMC3SEUL6CDITQS6GNSAC
ZFDXYOFRFODLAPUACKSOR2L6K2RKPFW7G3KWAM4HJHRDI3B76KBQC
CGQVZSH7DHY4VXFUR2OSKEL77ALZPEXAWHAW4JR7AL5FZLTDQDYAC
HFE3P6XQ7ISLY522AGQLU3BS43K4R45SBFKGH2552IUNQQDR4BPQC
CKI6VYEXCRVP7T6LBH3O53RFFFVFJ26PSRFK5SYZGIZAKERJXARAC
IJAMWLWDH3RVBHSRGLMQ5J6IUFMJXQHYDJM55PEOLYDDUAXJVKYAC
CFGPOVFHRP527X2S7R4ITR2G5RUA6T3264FY2L74BH6IP54VGYIAC
4MX2BNAWMUW5I4K3TB3F72AT64CR6XCU665KCDIUD6JJA6M7HROAC
UU3KFLBF573IFUAPYJZR4Y2KHR7MANS47HE6ZV5O6BHP6MXNQMVQC
H6V2E7XKCDRY755BCPLOI7HMKUNUUPVFRVB7O3IJNKKCXW3PCWPAC
6CWU2W2TOA362XUREQAF2XO3Z3ZC6BNI7W44WMHP37HMSDDVOGFAC
CNU4TN3SMRXGU2HMCNCYR475RVFPLQW4OKYN2DOVABWBCROT534QC
#biochimie
## Naissance
2 sources
- synthèse à partir des rayonnements UV sur la peau et d'un stéroïde
- alimentation (vitamine D2 \[végétal\] et D3 \[animal\])
## Vie
1. Accumulation dans le foie
2. première hydroxylation conduit à 25-OH-vitamine D (calcidiol).
3. Transport via le sang dans le rein puis une seconde hydroxylation
rein conduit à 1,25-dihydroxy vitamine D (calcitriol = forme active
de la vitamine D)
Le calcidiol est peu controlé mais la seconde est régulée par la PTH et
phosphatémie :
- augmenté par PTH, hypophosphatémie, hypocalcémie (via PTH)
- inhibé par hyperphosphatémie, hypercalcémie
![](../images/biochimie/vitaminD.png "vitamine D"){#vitamine D}
## Mort
Dégradation par oxidation/hydroxylation et excrétion dans les
urines/selles
## Effet
Calcitriol:
- stimule l\'absorbtion intestinale du calcium et phosphose
- os: favorise la minéralisation (en augmentant la calcémie)
- rein : stimule la réabsorption tubulaire du phosphore et calcium
- diminue PTH
## Indication
- 25-hydroxy-D = forme circulante prépondérante. Reflète les réserve
-\> dosé si possibilité de carenc
- 1,25-dihydroxy-vitamine D (calcitriol) = ne reflète **pas** les
stock : réservé à une anomalie de 1-α hydroxylation
## Dosage
#biochimie
## Intérêt (Guyton)
Régulation fine calcémie
- contraction musculaire (squelettique, cardiaque, muscle lisse)
- coagulation
- transmission nerveuse
Hypocalcémie= hyperexcitation (tétanie, épilepsie) car augmentation la
perméabilité membrane neuronale au sodium Hypercalcémie= hypoexcitation,
## Calcium
### Métabolisme calcium
99% squelette
Calcémie totale =
- no diffusible (40%) liée aux protéines (surtout albumine)
- diffusible = calcium ionisé (50%) \[=biologiquement active\] +
calcium complexé (10%) \[sels de phosphate, oxalate, citatre,
bicarbonate\]
*NB: calcémie diminue avec le pH* Rénal: Ca^2+^ et calciul soluble no
ionié est filtré mais la quasi-totalité est réabsorbé
![](../images/biochimie/calcium.png "calcium"){#calcium}
### Régulation
PTH = hypercalcémiant
- stimulée par le phosphate
- inhibée par le calcitriol
![](../images/biochimie/pth.png) Vitamine D = hypercalcémiant
- absorption intestinale
- résorption osseuses
- rétroncontrôle négatif PTH
![](../images/biochimie/vitaminD.png "vitamine D"){#vitamine D}
calcitonine = effet opposé PTH mais moindre
### Résumé
1. Os = 1ere ligne de défense via des sels de calcium dans les os
(0.5-1%)
- hypercalcémie -\> dépôts de ces sels
- hypocalcémie -\> asbsorption 50% de l'excès de calcium peut être
absorbé en 70%
Mitochondriea (foie, intestant) = tampon additional
2. Hormonal : diminution PTH dans 3min après hypercalcémie,
augmentation calcitonine
## Phosphore
### Métabolisme
85% os Le phosphore sanguin = 90 hématies. Dans le plasma :
- organique (15%) = phospholipides
- minérale = ions de l'acide orthophosphorique
Élimination selles et surtout dans les urines (réabsorbtion partielle
dans le tubule proximal) Régulation = équilibre absorption intestninale,
réabsorbtion rénale, échange os \<-\> extracellulaire
- FGF-23 = augmente excrétunio urinaire
- diminue réabsorbtion rénale
- synthèse calcitriol
- stimule inactivation calcitriol, 25-OH-D
## Magnésium
nécessaire à la sécrétion de PTH par parathyroïde
## Dosage
référence = calcium ionisé mais augmenté si acidose, diminué si
hypophosphatémie
- Hypo/hypercalciméie : dosier calcémie, et phosphate
- fragilité osseuse/lithiases rénale/néphrocalcinose : calcémie,
phosphatémie, créatininémie, PTH, 25OH vitamine D, calciurie 24h
### Calcémie
- à jeun
- très sensible à l'albumine : plusieurs formules (imparfaites)
- corrigé = total + 0.02 × (4\*-albuminémie) si albuminémie \<
40g/L
- liaison Ca^2+^ - albumine fortement dépendant du pH
(proportionnel)
### Calciurie
- à adapter selon le poids, apport (alimentaire + médicament)
- plus élevée chez femmes ménoposée
### Calcium/créat urinaire
= dégradationosseuse
### Phosphate
0.80-1.45mmol/L chez l'adulte hémolyse = augmentation phosphotaes (GR
riches en phosphase)
Capacité du rein à réabsorber le phosphate
- Taux de réabsorption du phosphate = 1 -
`\frac{phosphaturie \times créatininémie}{phosphatémie \times créatininurie}`{=latex})
- TmP/DFG = seuil maximum de rabosorption du phosphate -\> calculé à
partir du TRP, phosphatémie et abaque
### PTH
immunoenzymatique. ne dose pas la PTHrp
### Vitamine D
- 25OHD =routine
- 1,2)OH~2~ D = difficulie, 2e indication
## Pathologies
### Parathyroïde
1. Hyperparathyroïdie primaire
- Production inappropriée PTH.
- Fréquent, surtout féminin, asymptomatique/aspécifique
- Étiologies : adénome(s) parathyroïdes, hyperplasie autonomisée
des 4 glandes parathyroïde, carcinome parathyroïdien (rare), NEM
(1 surtout, 2)
- Diagnostic = biologique +/- scinti/échographie
- hypercalcémie, hypercalciuire
- +/- hypophosphatémie
- 1,25(OH)2 D + marqueur remodelage ossex
- attention: PTH peut être normale haute. On peur avoir une HPP
normocalcémique
- Diagnostic différentiel = hypercalcémie-hypocalciurie familiale
bénignie (*CaSR*, *AP2S1*, *GNA11*) : hypocalciurie relative
- Traitement : chirurgical mais non systémiatique
2. (Pseudo)Hypoparathyroïdie
- Hypoparathyroïdie = défaut synthèse PTH avec hypocalcémie, PTH
basse/normale basse, phosphatémie haute/normale haut, calciurie
le plus souven normale
- Pseudo-hypoparathyroïdie = résistance = hypocalcémie,
hyperphospatméie mais PTH élevée
- microdel chr22 (di george), chirirguie, hypomangésémie
chronique
### AVitamine D
Surcharge
- intox vitamine D = très rares mais sévère. Génère hypercalcémie, que
le rein essaye de compenser en augmentant la calciurie.
L'hypercalcémie apparaït qand le rein est débordé 25OHd \> 150ng/mL
- granulomatose (sarcoïdose): les cellulels du granulome (=
macrophages + descendants) peuvent hydroxyler la 25OHD circulante et
relarger la 1,25OH2D
- hypercalcémie, PTH basse, hypercalciurie, 25OHD normale et
1,25OHd élevé, enzyme de conversion angiotensine élevée
- hypersensibilité vitamine D : récessive, *CYP24A1*
Carence = rachitismie, ostémalacie
- défaut d'absorption calcium, phosphore -\> hypercalcémie avec
augmentation PTH -\> calcium normal mais tensadance à
hypophosphatémie -\> défaut de minéralisation avec élévation PAL
Également, stimulation production éranle de 1,25OHD2, mais s'arrête
quand il n'y a plus de 25OHD -\> grave !
- alimntation très riche en fibres /phytate (inhibe absorption
intestinale calcium !!)
- situation de résisstance : type 1, 2, 3
### Hyperparathyroïde secondaier IRC
- PTH élevée, hyperphosatémie, hypocalcémie, déficit calcitriol
- Mécanisme : IRC -\>
- diminution synthèse rénale calcitriol
- dimination absorption intestinale phosphate + calcium
- rétentation phosphates -\> aumentation FGGH23 -\> augmente
excrétion urinaire phosphate + diminution synthèse réranle
calcitriol (cf supra)
### trouble réabsorbtion rénale duphosphate : diabète phosphaté
hypophosphatémie, calcémie normale
- rachitisme héréditaire hypophoshatémique = fuite rénale de phosphate
(Tmp/DFG bas) avec PTH normale / légèmenet élevée. Déficite relative
en calcitriol qui aggrave hypophosahtémie
- ostémolacalie tumorale hypophosathméique = production FGh23 par
dtumeux mésenchymateusebénignise : cf supra pour la biologie avec
1,25OH2D normale/basse donc inadaptée
### tumorale
sécrétion d'une substance analogue PTH = pepite apparénté PTH -\> se
fixe sur les récepteur PTHR1 et induit effet biochimique PTH -\>
diminution PTH
#biochimie
## Naissance
Très répandues dans les tissus.
## Vie
Libérées dans le sang lors de l\'altération de la membrane cellulaire
## Mort
## Effet
Permet le passage de métabolite à travers les membranes cellulaires
(catalyse l\'hydrolyse d\'esters monophosphorique en libérant du
phosphate)
## Indication
- Maladies hépato-biliaire cholestatiques
- Malades osseuses avec régénération ostéoblastiques
- Grossesse avec cholestase gravidique
- Certaines pathologise intestinales, suivi de certains cancers
## Dosage
#biochimie
## Effet
- libéraction de calcium à partir de l'os (ostéoclastes)
- réabsorbtion rénale calcium
- via la vitamine D : absorption intestinale
#biochimie
Osmolalité = \$2 × \[*N**A*^+^\] + \[Gly\] ≈ 285 \$ mOsm/kg d'eau
On veut éviter que le sang ne soit trop dilué, ou on contraire pas assez
dilué.
Or les mouvements d\'eau (entre le secteur intra- et extracellulaire) vont dépendre des concentrations ! Par exemple, il y a surtout du sodium en extra-cellulaire. Donc s\'il y est très concentré, l\'eau va sortir des cellules pour équilibrer tout ça.
Comme c\'est compliqué de calculer la quantité de sodium, on va regarder
sa concentration, la natrémie.
## Déshydratation extracellulaire = perte de sodium
Pure si iso-osmolaire (l'eau \"suit\")
Étiologie :
- perte extrarénale : bonne réponse du rein donc oligurie, natriurièse
effondrée, urines concentrées
- perte rénale : pas de réponse du rein donc diurièse normale,
natriurièse élevée, urines non concentrées
## Hyperhydratation extracellulaire = excès de sodium
Iso-osmolaire (l'eau \"suit\")
Étiologies : insuffisance cardiaque, cirrhose ascitique, syndrome
néphrotique surtout
## Déshydratation intracellulaire = perte d'eau
Donc hyperosmolalité plasmatique avec appel d'eau intra-cellulaire
Étiologie :
- hypernatrémie =
- déficit en eau seul (DIC) =
- perte extra-rénale en eau =
- perte rénale en eau = diabète insipide
- déficit en eau \> déficit en sodium (DIC + DEC) =
- natriurèse adaptée (basse): sueurs, pertes digestives
- natriurèse inadaptée (normale): diurèse osmotique
- gain eau \> gain sodium = apport excessif NaCl
- natrémie normale mais soluté osmotiquement actif : mannitole,
éthylène glycol... -\> \"trou anionique\" entre osmolalité mesurée
et calculée
## Hyperhydratation intracellulaire = excès d'eau
1. Éliminer ****fausse**** hyponatrémie
- hyperprotidémie et hyperlipidémie (dilution)
- hypertonique : hyperglycémie important, méthanol, éthanol
2. Hypoosmolaire = hyponatrémie vraie
- osmolalité urinaire diminué : apport augmenté (polydipsie,
apport faible en solutié)
- osmolalité urinaire augmenté : extracellulaire
- diminué : déficit sodium \> déficit eau
- natriurièse adaptée (diminuée) : perte cutanées,
digestive, 3e secteur
- natriurièse inadaptée (augmentée) : perte rénale :
diurétique, insuffisance surrénale..
- normal : excès d'eau : SIADH++, hypothyroïdie,
hypocortisolisme
- augmenté : excès d'eau \> excès sodium : insuffisance
cardiaque, cirrhose hépatique, syndrome néphrotique,
insuffisance rénale
Une natrémie basse = augmentation du volume plasmatique ? Pas toujours...
- si la glycémie est très haute, cela va forcer un déplacement d\'eau
en dehors des cellules. Donc le sodium sera dilué mais ce sera
simplement un **transfert** !
- s\'il y a trop de protéines, la machine qui mesure la natrémie va
les compter aussi dans le volume. Donc **fausse dilution**
Sinon oui ! (**vraie hyponatrémie**) Dans ce cas, on réfléchit sur la
diminution de la concentration du sodium = quantité de sodium / volume.
On a 3 situations
1. Augmentation du volume seule : c\'est la version facile. Ça peut
être du à :
- trop de boisson !
- l\'hormonone anti-diurétique qui est sécrétée en excès
- autres
2. Le sodium et le volume diminuent mais le sodium diminue nettement
plus : on a donc des **pertes de sel**
- soit par le rein (diurétique...)
- soit ailleurs (vomissement, diarrhés...)
3. Le sodium et le volume augmentent mais le volume augmenet nettement
plus : pour simplifier, il faut imaginer qu\'il y a des oedèmes.
L\'eau s\'accumule en interstitiel, donc la pression artérielle
diminue. En réaction, l\'hormnone antidiurétiqe est stimullée pour
corriger tout ça. D\'où **réabsorption de sodium et d\'eau** !
- insuffisance cardiaque
- insuffisance hépatocellulaire
- insuffisance rénale (mécanisme différent)
## Traitement
- HEC: gain de sodium (isoosmolaire) -\> éliminer le sel (apport ou
diurétique)
- DEC: perte de sodium (et d'eau car isomolaire) -\> apport sel (oral
ou IV isotonique)
- DIC : perte en eau
- pure -\> apport oral d'oeau (pas d'IV)
- global (perte en perte et sodium) -\> soluté hypoosmolaire
- avec HIC (perte en eau et gain sodium) -\> hypotonique +
diurétique
- HIC : excès d'eau -\> restriction hydrique et
- si DEC (excès d'eau, perte de sodium) -\> soluté isoosmolaire
- si HIC (excès d'eau et sodium) -\> restriction sodée
#biochimie
Valeur normales :
- triglycéride \< 1.5g/L (ou 1.7 mmol/L)
- LDL (calculé mais valable si TG \< 3.4 g/L ou 3.9mmol/L): selon les
facteur de risque : \< 2.20g/L (5.7 mmol/L si 0)
- HDL : protecteur si \> 0.60g/L
#biochimie
## Protéines
source <https://www.memobio.fr/html/immu/im_el_pr.html> DIMINUTIONS
PROTEINES TOTALES
- Défaut d'apport alimentaire : malnutrition, kwashiorkor
- Défaut d'absorption : insuffisance pancréatique
- Défaut de synthèse hépatique : insuffisance hépato-cellulaire,
inflammation aiguë sévère, subaiguë ou chronique
- Fuite de protéines : hémorragie, fuite urinaire, fuite digestive
(entérocolite, maladie de Crohn), fuite cutanée (brûlure)
AUGMENTATIONS
- Déshydratation extracellulaire : cf hydro-électrolytique
```{=html}
<!-- -->
```
- Hypergammaglobulinémie
- polyclonale : parasitose, maladies auto-immunes (LES, hépatite
auto-immune), sarcoïdose, purpura hypergammaglobulinémique
- m
## Kaliémie
### Hyperkaliémie
- excès d'apport (rare)
- transfert IC -\> EC :
- acidoe métabolique à trou anionique normale
- hyperosmolarité
- destruction tissulaire aigùe massive
- exercice physique
- β-bloquant, digitalique, again α-adrénergique
- diminution excrétion rénale
### Hypo
- carence apport (exceptionnelle)
- transfert EC -\> IC
- alcalose métabolique/respiratoire (entrée K+ en échange de
proton reglaré par les tampons)
- insuline
- β-adrénergique : stress, sablutamole
- stimulation hématopo̤è,se : vitamine B~12~, acide folique, anémie
mégaloblastique
- perte :
- rénale (fuite urinaire K\^+):
- HTA : hyperaldstéronésmie (activation SRAA, adénome
surrénale), hyperminéralocorticisme (Cushing)
- HTA normale
- acidose tubulaire rénale, acidocétose métabolique
- alcalose métaboli: diurétique thiazidique/anse
(chlorurie élevée), vomissement abondant (chlorurie
basse)
- digestives (kaliurèse adaptée = diminuées) : diarrhée
aigüe/chroniqu
## Ferritine
- HFE
- Syndrome métabolique
- cytolyse hépatique (hépatite aigïue) : augmentation CST
- syndrome inflammation (fe sérique et CST diminué)
- alcoolisme chronique
- surchrage fer
- cytolyse msculaire (cardiqaue/périph)
## Liquide d'ascite
Si inflammation, protéines passent la membrane -\> doit diminuer avec la
diminution de l'inflammation TG: suivi post-op pour chylotorax
(accumulation de lymphe) afin de suivre également le réatbilssement
#biochimie
[Ammoniaque](Ammoniaque.md)
## Ammionaque : Clinique
Cycle de l\'Urée = fondamental pour garder ammoniémie basse
Détoxication impactée si cirrhose, IRA, shunt portal... -\> accumulation
toxique -\> encéphalopathie hépatique (trouble neuropsy + coma)
symptômes non spécifiques en période néonatale : mauvaise alimentation,
vomissements, somnolence, irritabilité, tachypnée
Partiel : mmois ou des années après la naissance et est souvent
déclenchée par une maladie ou un stress catabolique.
- perte d\'appétit, des vomissements cycliques, une léthargie ou des
anomalies comportementales
- tendance à éviter spontanément les protéines, en particulier les
femmes présentant un déficit en ornithine transcarbamylase (OTC)
(Scaglia et al 2002). Le r
2 premières année de vie : si prolongée, dommages irréversibles
(atrophie cérébrale, dilatation ventriculation, démyélination,
hypondensité) -\> épilepsize, troubles cognitifs important,
## Toxicité cérébrale
- entrée dans les cellules de l\'amonniac -\> modification du tampon
potassium (homéostasie électrolytique)
- Protection contre hyperammoniémie : détoxication par conversion en
glutamine
- stress osmotique -\> gonflement des astrocytes (mais n\'explique
pas tout)
- mitochondrie astrocytes : glutamine -\>~glutamate~ + ammoniac
-\> modification du pH, potentiel de mmebrane, ... modification
de nombreux transportseux production de radicaux libre etc =\>
avec modification du ca2+, effondrement du potentiel de membrane
intérieure , diminution synthèse ATP -\> perte des
mitochondrie + morts cellulaire
- cascade inflammation
- modification métabolisme mitochondrial
- perturbation du cycle de Krebs
- stimulation de glycose + inhibiton oxidation du pyrhuvate -\>
produciton de lactate dans le c-eraux
- Neurotransmission altérée :glutamine -\> désaminé en glutamate qui
va activer récepteur NMDA. Excès de glutamate -\> aptoptose
neuronale.
- modification neurotransimssion GACAergique
## Maladies congénitales : cycle de l\'urée
Une des 6 enzyme ou 2 transporteux défectueux -\> accumulation
Néonataal : pas d\'activité enzymatique (ou très faible)
- symptômes à 24h de vie
- impact cognitif, comportemental important
Plus tardif : activité résiduelle
- déclenché par catabolisme protéqiue, IR, augmentation d\'ammoniac
(sport, maladie, sepsis...)
taux de mortalité importante par encéphaloapathie
### Déficit CPS1
AR, 1/1 300 000 Non traité : encéphalopathie, épilepsie, coma, décès Bio
: hyperammoniémie + glutamine, diminution citruliline + arginine
(logique)
### Déficit NAAGS
AR \> 1/3 500 000 Seul à être traité Bio : hyperammoniémie + glutamine +
glutamate, diminution citrulline (logique) Non traité : détérioration
neuro heures/mois
### Déficit OTC
Le plus fréquent 1/56 500 transmission liée à l\'X !! oedème cérébrale,
épilespsie, coma Plus grave chez homme (variable chez femme) Bio :
hyperammoniémie + glutamine + alanine, diminution citrulline (logique)
troubles cogniif
### Déficit ASS1
clinique variable (parfois asymptomatique force tardive) Arginine
diminuée, citrulline augmentée plasma et urine et acide orotique dans
les urines (diminution activité onithine transcarbamylase ?)
### Déficit transport citrin
AR 3 formes
1. néonatale : cholestase intrahépatique,
2. Adulte : hyperamméniomé récurrente (début brutal adulte)
3. enfant : dyslipidémie, troubles croissance Bio : hyperammoniémie et
citrulline
Clinique : neuropsy, délire, coma
### ASL
après 24h forme néonat : létharie, convulsion, coma, mort 2e plus
fréquent toruble de l\'urée : 1/70 0000.AR Acide argininosuccinique
élevé dans les urine + ammoniaque et citrulline augmenté
### Arginase 1
1/950 0000 Arginine augmentée, psasticité, régression mentale + moteur,
épilepsie
Si hyperammoniméie : atxaie
### ORNT1
Triple H (hyperonirthinémie-hyperammonémie-homocitrullinurie)
accumulation cytoplastimce ornithine + lysine Bio : hyperammoniméie
+ronthinie + homocitrulline dans les urine
## Maladie congénitale : acidurie organique
\> 65 maladies, AR 1/3 000
Néonat: décompensation métabolique = grave+++ vomissement, convulsion,
léthargie, hypotonie, acidose métabolique, lactate, kétonurie,
hypoglycémie
Bloc métabloique -\> accumulation d\'acide organieque dans les
tissus/fluides. Ex
- acide propionique
- acide méthylmalonique
- acide isovalérique
Hyperammonémie = souvent dans les fornme classique. Lié à une
modification des cycles de krbes et de l\'urée ? Déficit en carnitine
qui accompagne ces maladies ?
## Oxidation des acides gras
a lieu dans les mitochondries, essential pour fournir de l\'énergie
quand il n\'y a pas de glucose AR 1/9000 Clinique variable, SNC souvent
affecté (hypoglycémie/hyperammoniémie)
Acide gras insuffisament utilisés Hypermamménion = très souvent
retrouvé, not. chez patients avec hypoglycémie, encéphaloathie,
insuffisance hépatique
## Dosage
Photométrie Interférence : hémolyse, pyruvate Pré-analytique : tube
vert, glace
## Traitement
- dialyse
- si rein rormal : \"scavenger\" (sodium benzoate, sodium
phenylacetate...) SP = augmente crxtrétuion rénale de glutamine
- supplémentation selon cause : arginine (CPS1, ...), citrulline
#biochimie
## Calprotectine fécale
- Présence : polynucléaire neutrophique, macrophages, certaines
cellules épithéliales des muqueuses
- Proportionnel à l'\*inflammation de la muqueuse\*
Algorithme :
- \< 50μg/g : pas d'inflammation, trouble fonctionnel
- 50-150μg/g : zone grise
- \> 150μg/g : inflammation
## Tests respiratoire
- Mesure hydrogène/méthanase après une fermentation anaérobie
intestinale
- Contexte :
- intolérance aux glucides : non absorbé dans le grêle donc
fermentation (retardée)
- pullulation microbienne : fermentation précoce
## Stéatorrhée, élastate, acitivté chymotrypsique fécale
Stéatorrhée : \> 7g/27
- défaut d'absorption (coeliaque, MICI) -\> acides gras à la
microscopie
- défaut de digestion (insuffisance pancréatique exocrine...) -\>
triglycéride à chaînes longues
Élastase fécale : témoin de l'insuffisance pancréatique : sévère si
\< 50μg/g
## Ionogramme fécal
- augmentation débit Na^+^ ou K^+^: diarrhée hydroélectrolytique
- trou osmolaire
- \< 50mOsmol/L : diarrhée sécrétoire (colite microsocpie,
viopem...)
- \> 125 50mOsmol/L : diarrhée osmotique (laxatif...) ou
malabsorption glucidique (déficit en lactase...)
- normal : diarrhée motrice, pathologie mixte
## Clairance fécale de l'αantitrypsine
- Fuite intestinale physiolique de protéine. Si augmenté: entéropathie
exusidatione, souvent associée à des maladies érosive (MICI), non
érosive (coeliaque), (hypo)
- αantitrypsine: inhibe l'activité catalytique de sérines protéases.
Marqueur de fuite protéique intestinale
- Interprétation :
- oedème ou hypoprotidémie avec hypoalbuminémie et
hypogammaglobulinémie non explique par
dénutrition/protéinurie/syndrome inflammatoire -\> la clairance
de
l'*α**x* − *a**n**t**i**t**r**y**p**s**i**n**e**d**i**a**g**n**o**s**t**i**q**u**e**u**n**e**g**a**s**t**r**o**e**n**t**é**r**o**p**a**t**h**i**e**e**x**s**u**d**a**t**i**v**e*
#biochimie
## Physiologie
Énergie:
- stocke glucose
- libère le glucose stocké, le produit par néoglucogenèse
- synthèse des corps cétonique: oxydé pour être utilisé comme énergie
par muscle squelettique, cardaque, cortex rénal
Synthèse majeure partie des protéines sauf immunoglobulines
- albumine
- transport (transferrine...)
- coagulation
- inflammation (CRP, partie du complément)
Synthèse du cholestéral Épuration :
- déchet du métabolisme = amoniaque sous forme d'urée (catabolisme
azotée), bilirubine ,
- hormones (stéroïdes)
Transforme médicaments, toxique.... par modification (ex: cytochrome
P450) puis conjugaison
### Bilirubine
Production
- 20% catabolisme dans le foie des autres composants de l'hème ou
destruction érythroblastes moelle
- 80% hémoglobine par destruction des hématies
Cycle:
- Bilirubine libre/non conjuguée = circule dans le plasma liée à
l'albumine
- conjugée dans le foie
- bilirubine conjugée secrétée dans le duodenom par voies biliaires
- oxydation qui va donner la couleurs aux selles. Une partie passe
dans les urines
Patho:
- excès des capacité de transport de la bilirubine libre (exemple =
préma) on a alors bilirubine libre non liée à l'albumine
- bilirubine conjugée dans le plasma -\> urines foncées (diag
d'ictère)
### Fonction biliaire
- élimination métabolite
- absorption lipides
Patho: sursaturation du cholestérol -\> cristaux -\> calcul
## Marqueurs
### Cytolyse:
- [ALAT]{.underline} \> 40 U/L = cytosol (foie +/- muscles)
- [ASAT]{.underline} \> 35 U/L = cytosol + mitochondrie (foie,
muscles, coeurs, rein, pancréas, cerveau)
Attention :
- hémolyse = ininterprétable (aminotransferase globules rouges\>
plasma )
- ASAT \< ALAT car demi-vie inférieure (sauf alcool chronique car
grosses mitochrondrie)
- Aigü : normalisation en 6 mois
- seulement souffrance cellulaire et non état fonctionnel du foie
NB: LDH (lyse cellulaire) non spécifique mais très marqué pour métastase
hépatique NB: peuvent être augménte si stéatose, inlammation modérée,
obstruction des voie billaire, cirrohse, exercice musculaire violent
### Synthèse
- [Coagulation]{.underline} : complexe prothrombinique diminué
- non spécifique des insuffisance hépatocellulaire (cholestase
avec défaut absorption vitamine K)
- si \< 60%, doser facteur V pour confirmer IHC
- attention: fibrose dès \<90% dans patho chronique
- [Albumine]{.underline} : produit par l'hépatocyte
- important mais non spécifique de l'IHC (malnutrition,
malabsorption, rénal)
### Épuration
- [Urée]{.underline} = diminué si IHC (genèse hépatique)
- [Ammoniac]{.underline} = augmenté si ICH -\> suivi des IHC et foie
(toxicité système nerveux central)
### Sécrétion bilaire
Surtout défaut d'excrétion [bilirubine conjugée]{.underline} +
augmentation bilirubine totale
### Cholestase
Diminution/arrêt sécrétion biliaire. 3 atteintes :
1. synthèse
2. Sécrétion intrahépatique
3. extrahépatique
Marqueurs
- bilirubine : augmentation totale + conjuguée (attention, ictère
retardé : conjonctive si \> 50µmol/L)
- enzyme :
- [phosphatase alcaline]{.underline} (PAL) augmentée mais non
spécifique (patho. osseuses, cancers). Active dans foie, os,
rein, intestin, placenta \[Attention âge, grossesse\]
- [gamma-glutamyl transférase]{.underline} (γGT): origine
hépatique pour l'enzyme circulante (+ pancréas, reins, rate,
poumon, prostate). Augmenté sensible mais peu spécifique
(alcool, contraceptique, phénoparbital) \[Attention population
africaine\]
Coagulation: Diminution du TP avec facteur V normal
Autres
- Augmentation acides biliaire totaux = cholestase
- Pigments
- biliaire dans urines (+produits transformations)
- Selles décolorées = cholestase
- IgM = cirrhose biliaire primitive
### Inflammation
CRP, vitesse sédimentatino érythrocytaire, électrophorèse ptoténies
sériques
### Fibrose hépatique
- ponction biopsie, Fibroscan (non invasif)
- acide hyaluronique = surtout valeur prédictive négative
- scores : Fibrotest, Fibromètre, Hépascore
## Interprétation
Augmentation ALAT/ASAT
- aigue \> 10N: hépatite virale aigüe A, B, médicaments (IMAO,
méthyldopa...), toxique (paracétamol, champignon), lithiase de la
voie biliaire principale, ischémie hépatique aigue
- aigüe modérée 3-10N: hépatite virale A, B, autre infections (EBV,
cmv, HSV, toxoplasmose), alcool, surcharge pondérale, atteinte
hépatobiliaire chronique
- chronique \< 3: VHC, VHB chronique, stéatose hépatique du
diabote/dyslipidémie,/obésite, alcoolisme (rappport inversé), autres
médicaments (isoniazide...), autto-immun, surcharge (hméocromatose,
Wilson) NB: élimiier une nécrose musculaire/myocardique, pancréate
NB: cherche un risque d'hépatite fulminante : TP, facteur v,
ammionémie
Bilan enzymatique anormal
γ GT PAL ALAT,ASAT Interprétation Étiologies
---------- ---------- ------------------- ---------------------------- --------------------------------------------
augmenté augmenté augmenté hépatopathie cytolytique hépatite virale, alcool, médicaments
augmenté augmenté N ou peu augmenté hépatopathie cholestatique \- médicaments (antidépresseurs),
\- biliaire, pancréas, foie
augmenté N N alcool, médicaments inducteurs
enzymatique, stéaotose, sucharge pondérale
+/- hyperthyoroïdies, parasite
Cholestase : PAL \> 1.5N (plutôt extra hépatique), γGT \> 3N (plutôt
intra-hépatique), ALAT, AST \< 2N Ictère : augmentation bilirubine
----------------- -------------------- ---------------------------------------------------------------------------
non conjuguée : \- extra-hépatique hémolyse (nouveau-né, constit, acquis)
\- hépatique : Gilbert, Criggler-Najjar, ictère transitoire du nouveau-né
conjuguée \- intra-hépatique : médicaments, hépatite virale/parasitaire, autoimmun,
carcinome, cirrhose biliaire primitive, septicémie, cholestase gravidique
\- extra-hépatique lithiase cholédoque, cancer pancréas, pancréatite chronique
, cholangite sclérosante, sténose/carcinome des voies biliaires
----------------- -------------------- ---------------------------------------------------------------------------
## Cirrhose
- IHC: TP, facteur V, dosage albumine (ou EPS)
- inflammatoire : bloc β-γ, augmentation α2 globuline
- score Child-Pugh (ascite, encéphalopathie, albuminméue,
bilirubinémie, TP)
## Dépistage carcinome hépatocellulaire
αfoetoproténie = suivi et non iagnostic. régérénration des hépatocyttes
## Grossesse
- Physiologique : diminution albuminémie possible, augmenation PAL
- cholestase gravidique : prurit, augmenation acide biliarie sérique :
10-40 modéré,, sérève si \> 40
- ALAT = 2-10N \>\> ictère 10%, bili augmentée et γGt
No/augmentée: 30%, stéatorrhéie (déficit en vitamine K visible
sur TP)
# Reference
Bonnefont
#biochimie
## Physiopatho
### Cycle
![](../images/biochimie/fer.png) NB: *apo-* est utilisé quand il n'y a pas de fer (ex: apotransferrine = transferrine sans fer)
1. Stockage
Surtout dans le foie et la rate, sous forme de Fe^3+^ contenu dans soit
- ferritine : macrophages, hépatocyte
- hémosidérine (libération lente)
Le $Fe^3+$ est oxydé en $Fe^2+$, se retrouve dans le plasma où il va
être oxydé afin d'être transporté par la transferrine (oxydation
réalisé par la céruléoplasmine) NB: Les macrophages sont mobilisé en
premier pour l'érythropoïèse
2. Production et transport
Production de Fe^2+^
- Absorption intestinale de Fe^2+^
- Dégradation de l'hémoglobine par les macrophage avec production
de bilirubine et Fe^2+^
Évolution du Fe^2+^ (intestinale ou macrophage): 2 possibilités
- stocké dans la cellule sous forme de *ferritine* (en se liant à
l'apoferritine),
- ou pris en charge par la *ferroportine* et largué dans la
circulation sanguine
Dans le sang Fe^2+^ oxydé en Fe^3+^ qui est transporté par la
*transferrine*. Il va y avoir ensuite des échanges entre la moelle
osseuse, le foie et le système réticulohistocytaire
### Régulation
- HFE: diminue l'affinité du récepteur de la transferrine -\>
- hepcidine : dégradation de la ferroportine -\> fer \"bloqué\" dans les entérocytes -\> hyposidérémiant
## Patholologiques
### Surcharges
1. Hémochromatoses héréditaires
- Type 1 = 80% des adultes = autosomale récessive sur *HFE* : affinité excessive du fer pour réticulohistocytaire et cellules parenchymateuse hépatique
Atteinte hépatique (hépatomégalie, cirrhose),pancréatique, cardiaque
- Forme juvénile également
- traitement = saignée (oral si juvénile)
2. Secondaires
- excès supplémentation martiale/transfusion
- Anémies hémolytique, dysérothropoïèse, thalassémie, hémoglobinopathies
- dysmétabolique : biologique = syndrome métabolique
d'insulinorésistance
### Autres
- Anémie inflammatoire (infection sévère, chronique, néoplasie): le fer provenant de l'hémolyse physiolique est mal recyclé
- autres affection génétique microcytaire hypochromes avec sidérémie normale/augmentée: OMIM 209300 604290 206100
- Carences martiales (saignements chronique, maladie de Wilson, carence vitamine C, malabsorption...)
## Exploration
- Ferritine circulante = le plus sensible et le plus précoce, ≈ stock de fer
- Fer sérique : augmenté si surcharge en fer, cytolyse hématique, diminué si carence martial, inflammation
- transferrine : augmenté si carence en fer, diminué si malnutrition attente hépatique grave, syndrome inflammatoire
- Capacité totale de fixation de la transférrine = 25 × transferrine
- Coefficient de saturation de la transferrine = fer sérique / CTF × 100
- Autres :
- fer non lié à la transferrine = spécialisé
- récepteur soluble de la transferrine = diagnostic des carences en fer pendant état inflammatoire
- protoporphyrine libre : augmenté dans les urines si carence en fer, cancer, affection chronique
- Ahepcidine = anémie hypochrome microcytaire avec suspicion génétique, suivi hémochromatoses héréditairesc IRC et inflammation chronique
Génétique: 1. p.Cys282Tyr de *HFE*. 2. si non homoygote, coefficiente de saturation (diminué si hétérozygote)
## Arbre
ferritine normale
------------------ ------------------- -------------- ----------- ---------- ---------------
Ferritine Transferrine CTF CST Autres
carence martiale diminuée augmentée augmentée diminuée
inflammation normale/augmentée diminué diminuée normale CRP augmentée
thalassémie etc CRP normale
------------------ ------------------- -------------- ----------- ---------- ---------------
ferritine augmentée
- CTF et CRP normale : surcharge acquise, maladie de Gaucher
- CS augmentée : hémochromatose type 1 ou surcharge secondaire
# Référence
Bonnefont
#biochimie
La clairance de la créatinine est estimée par le Débit de Filtration Glomérulaire. Évaluation DFG à partir de la créatininémie
- Cockroft et Gault: age, **poids**, créatinimie. Mauvaises
performances si obèse, \> 75 ans.
- MDRD, CKD-EPI : **sexe**, age, créatininémie, **ethnie**. **pas le
poids**
-\> CKD-EPI. recommandé par la HAS. Aussi plus précise que MDRD pour
valeur basse
- Schwartz : enfant
- recos HAS:
- MDRD non validé si
- CKD-EPI si dosage enzymatique, MDRD si colorimétrique
Attention : formules non utilisable chez l'enfant (formule du Schwartz),
variation aigüe de la fonction rénale, cirrhose hépatique décompensée,
gabarit hors norme, amyotrophie important, grossese
Dans ce cas, utiliser clairance urinaire sur urines de 24h = créat
urinaire\*débit/créat sanguine
Permet d'éliminer l'ammoniaque et l'urée
## Initialisation
le $CO_2$ passe du cytosol dans la mitochondrie puis :
$CO_2 + H_2 O \leftarrow HCO_3^{-} + H^{+}$ Puis
$HCO_3^{-} + ATP \rightarrow NH_3 + ADP$
Le $NH_3$ est converti en carbamate -> carbamoyl-P (catalysé par N-acetyl glutamate, qui entre dans le cycle
## Cyle
1. Le Carbamoyl phosphate est converti en citrulline (raction de condensation avec l'orinithine).
2. La citrulline sort de la mitochonrie et va se condense avec l'aspartate. Le \"cleavage\" va créée de l'arginine et du fumarate.
3. L'arginine est clivée par l'arignase, libérant de l'urée et reconstituant de l'orinithine, qui retourne dans la mitochondrie.
#biochimie
## Naissance
Pour excrétion dans les urine, la [*créatine*]{.spurious-link
target="Créatine"} est tansformée en créatinine
## Vie
Libérée par le muscle
## Mort
Éliminée par le rein par filtration glomérulaire et excrétion dans le
tubule proximal
## Effet
Pas de rôle physiologique
## Indication
Pas de réabsorption par le rein, donc marqueur de fonction rénale
## Dosage
La clairance de la créatinine sert d'approximation pour le débit de
filtration glomérulaire (voir [*DFG*]{.spurious-link target="*DFG"})
#biochimie
## Naissance
Il s'agit d'un produit de l'arginine (transformation en glycine par la
glycine amdinotransferase, qui va générer du guanidinoacetate et de
l'ornithine. Cette première est méthylée en créatine). Ces réactions ont
lieu dans le foie, rein et cerveau.
## Vie
La créatine est transportée dans les muscles squelettique La
phosphorylation de la créatine sert à faire la phosphocréatine, qui est
un réservoir d'énergie (muscle squelettique, cerveau surtout) car la
déphosphorylation permet de créer de l'ATP. \$creatine + ATP ↔
phosphocreatine + ADP \$
## Mort
Pour l'excrétion dans l'urine, la créatine est convertie en créatinine.
## Naissance
Enzyme dans le cytosol ou mitochondrie des cellule : muscles
squelettiques++ et cardiaque, cerveau, rein, gastrointestinal
- CK-MM (95%) = muscle strié squelettique
- CK-MB = muscle cardiaque
- CK-BB (= cerveau, gastro-interdsstinal
## Vie
Catalyse la phosphorylation de la créatine en créatine phosphate par
l\'ATP (avec production ADP) Voir [*Vie de la créatine*]{.spurious-link
target="*Vie"}
## Mort
## Effet
contraction musculaire
## Indication
- Infarctus du myocarde, myopathie, myosite
- Certains cancers, affection du système nerveux central
## Dosage
Physiopathologie
[Équilibre acido-basique](Équilibre%20acido-basique.md)
[[DFG]]
[[Fer]]
[[Foie]]
[[Fonction intestinale]]
[[Natrémie]]
[[Phosphatase alcaline]]
[[Phospho-calcique]]
Dosage
[Acides aminés](Acides%20aminés.md)
[Acides biliaires](Acides%20biliaires.md)
[Albumine](Albumine.md)
[[BNP]]
[[Ammoniaque]]
[CPK](CPK)
[[Bilirubine]]
[[Creatine]]
[[Créatinine]]
[[Cycle de l'urée]]
[[Lipides]]
[[PTH]]
[[Vitamine D]]
[[Hyperammoniémie]]
[[Inteprétation biochimie]]
![](../images/biochimie/bilirubin.jpg)
#biochimie
## Naissance
synthétisé par myocyte du ventricule gauche (et droit) en réponse à une
surcharge volémique
## Vie
- Form de réserve = pré-proBNP, clivé en pro-BPN, clivé en NT-proBNP
(inactif) et BNP (actif).
Se fixe sur les récepteurs de type A sur endothélium vasculaire
- Stockage : non
## Mort:
- BNP: demi-vie de 20min puis dégradé endothéliium
- Nt-proBNP = éliminé dans tous les tissus où le débit est élevé.
Demi-vie : 1-2h pour NT-proBNP, 20min pour BPN,
## Effet
compense la surcharge volémique par
- vasodilatation périphérique
- natriurétique (d'où le nom)
- augmentation filtration glomérulaire (**diurétique**)
- diminution réabsorption du sodium (\*natriurétique)
- inhibition du système Rénine-Angiotensive-Aldostérone
## Indication
marqueur global de l'issufisance cardiaque (diagnostic, pronostic,
suivi)
## Dosage
## Valeurs
- < 100: forte probabilité d'absence d'insuffisance cardiaque
- 100 - 500 : zone grise
- > 500: forte probabilité d'insuffisance cardiaque
## Dosage
- 2 formes : NH~3~ (gaz), NH~4~^+^ (majoritaire)
- Hautement toxique en excès -\> élimination sous formne d\'urée
## Ammionac : Fonction
- source de nitrogène pour la synthèse des protéines + composés
essentiels
- maintien du pH
## Ammionac : Production
- Intestin : digestion des protéine + désamination
- Rein : excrété dans les urine / sang (désamination de glutamine)
Dégradation des acides aminés (pour énergie ou stockage sous forme de
graisse/glycogène) -\> désamination dans le foie
Transamination : le groupe amine est transféré vers l\'acide
α-ketaglutarique qui devient l\'acide glutamique
![](../images/biochimie/transamination.png)
L\'acide glutamique peut transférer son groupe amine également ou le
largue sous forme d\'ammoniac NH~3~
## Ammionaque : Vie
Introduit dans les acides aminés par la glutamine synthetase ou
glutamate dehydrogenase Sous forme de glutamine, va être transporté dans
le sang Glutamate + ATP + NH3 = glutamine + ADP+ P Principal moyen
d\'échanger des groupes amines entre les différents organes
## Ammionaque : Vie : pH
Tubule collecteur : H^+^ sécrété va se combiner à NH~3~ pour excréter
ion ammoniaque. Un ion biocarbonate va retourner dans le sang
![](../images/biochimie/tampon-ammoniaque.png)
Acide : augmentnation de la sécrétion d\'ion ammoniaque
## Ammionaque : Mort
1. Extra-hépatique : Formation de glutamine : ammonia + glutamate -\>
glutamine (enzyme = glutamine synthetase) qui sera transportée dans
le foie Note: dans le cerveau, pas de formation d\'urée donc c\'est
le même mécanisme !
2. Intra-hépatique : cycle de l\'urée = converti en urée
## Ammionaque : Mort : cycle de l\'urée
![](../images/biochimie/cycle-uree.png)
Mitochondrie foie : ammoniac + bicarbonate catalés par cPS1
(carbamylphosphate synthase 1) (Celle-ci provient du glutamate +
acetylco) Le produit est transformé en citrulline avec l\'ornithine
Dans le cytosole hépatique : convertin en acide aminé (arginine)o à
l\'aide de 2 cataliste : ASS1 (argininosuccinate synthase 1) et ASL
(argininonsuccinate lyase)
Arginine est clivée en urée et ornithine et regénère ornithine qui
permet de redémarrer le cycle
+++
title = "Japonais"
date = 2021-09-30
+++
# 2021-09-30 Aya-sensei : Intro
# 2021-10-08 Aya-sensei : Leçon 9 (JFBP II)
## Vocabulaire
- 友人(ゆうじん): ami
- 募集(ぼしゅう): recruter
- 経験(けいけん): expérience
- 間に合う: être à l\'heure
- 遺伝学 (いでんがく): genetique
- 医大 (いだい): faculté de médecine
## Grammaire
### Modifier avec des clauses
- 雨ではない日: un jour sans pluie
- 経験が長い人: une personne avec beaucoup d\'expérience
# 2021-10-15 Leçon 6 (JFBP II)
## Vocabulaire
- 顔色: visage (ex: 顔色がよくありませんんね = tu n\'as pas l\'air
bien)
- 膝(ひざ): genou
- 蜂蜜(はちみつ): miel
- 賑やか(にぎやか): animé (ville)
- むりをする: en faire trop, むり(な): impossible (むりできる ne pas
pouvoir)
## Grammaire
### Adverbes
- 早く起きました
- ーてきます: Partir faire quelque chose et revenir rapidement
- 本を借りてきて
- ーた ほうがいいですよ: il serait bien que tu +++ Attention, forme en
ーた!
- 風邪をですか。じゃあ、家に帰って休んだほうがいいですよ Attention, la
forme négative n\'utilise pas la forme en ーた
- 煙草(たばこ)を吸わないほうがいいですよ
# 2021-10-21 Leçon 3
## Vocabulaire
- 頭(あたま)/歯/喉 がいたい(あたま): mal à la tête/dent/gorge
- 気分(きぶん)/調子(ちょうし) がわるいんです: je ne me sens pas très
bien (調子 semble être plus général) =\> おなかの調子がわるいんです
- 怪我(けが):blessure =\> 手/足(あし)/指(ゆび)に怪我をしたんです
- 風邪をひく Marche aussi pour インフルエンザ mais pas pour le
covid+++
- 二日酔い(ふつかよい): hangover (\"2eme jour\")
- 寝不足(ねぶそく):insomnie
- 時差ぼけ(じさぼけ): jet lag
- ーができます:
- 嚔(くしゃみ)ができます: éternuer
- 咳(せき)ができます: tousser
- 鼻水(はなみず)ができます: avoir le nez qui coule
- 欠伸ができます: bailler
- アレルギー: allergie
- 花粉症(かふんしょう): rhinite allergique
- covoiturage: ライドシェリン(?aya-sensein) 相乗り(wiki)
- 犬がきらい: détester les chiens
## Grammaire
### ーていません: Pas encore:
まだ書いていません (je suis en train) レポートは書きません (je ne le
ferais pas \[c\'est facultatif !\])
- ーんです: expliquer
まだ書いていないんです (je suis en train)
# 2021-11-06 Quizz + Leçon 7
Solution du quizz
I. 1. に 2. に 3. に 4. が 5. で(?) II. 1. これから 2. そろそろ (まだ =
OK) まだ 3. 実は これから III. 1. もってくる+んです。2。帰った 行く した
買った
## Vocabulaire
- さっき: il y a un moment
- こんど: cette fois
- それから: \"après ça\" (pour faire la jonction entre 2 parties
d\'une phrase ex: 熱(ねつ)があるんです。それから病院に行ってきました
- これから: à partir de maintenant
- 浴びる(あ): se laver (douche), se baigner
- 洗う(らあ): nettoyer (ex une cabine de douche)
- お大事に(おだいじ): prenez soin de vous\
- 用事(ようじ): tâches à faire
- つごう: pratique
- きかい: opportunité
- 薬(くすり): médicament (attention, ressemble à たのしい)
- 昼休(ひるやすみ): la pause déjeuner
- 会議(かいぎ): réunion (différent de 会話(かいわ): discussion)
- ボックスを開く(ひらく): ouvrir des boites (carton)
- ポスターを貼る(はる): accrocher un poster
## Grammaire
- V + 前に(まえ) : avant de \~ Attention, pas de passé ni de négatif
! Ex: 日本に来る前に、日本語の勉強を始めました \~ てから: après
# 2021-11-13 Fin leçon 7
## Vocabulaire
- 卒業(そつぎょう)
- X と遊び: jouer avec quelqu\'un (ou un animal) Mais X で遊び: jouer
avec un objet
- メールをチェックする: vérifir ses mails
- 化粧(けしょう): se maquiller
- 他(ほか):autre (ex: personnes)
- éducation au Japon:
- 小学校(しょうがっこう):école primaire
- 中学校(ちゅうがっこう): junior high school \~ collège en
France
- 高等学校(こうとうがっこう): senior high school\~ lycée en
France
- 狩猟(しゅりょう): chasse
- 猟師(りょうし): chasseur
## Grammaire
- \~てから: 2 sens
- succession d\'action, ex: 食べてから、飲んて、読んて (note: plus
de から après la première action)
- depuis \~, ex:
日本に来てから、ずっと日本語の勉強をしています=j\'étudie le
japonais depuis que je suis arrivé au japon)
- \~前に: avant \~ (forme du dictionnaire, cf leçon précédente)
- の時(とき)/ adjectif en i い時/adjectif en na な時 = quand ex:
3さいのとき、: quand j\'avais 3 ans
# 2021-11-27 Fin leçon 7
## Vocabulaire
- 熊に注意(くまにちゅうい): attention à l\'ours !
- 転職(てんしょく) changer de travail
- 就職(しゅうしょく) trouver un travail
- 退学(たいがく) être viré de l\'unversité
- 子供ができるêtre enceinte
- 婚約する(こんやく)se fiancer
- しりあう: apprendre à connaître quelqu\'un
- 生まれる(うまれる): être né
- 試験を受ける(うける):passer un examen
- 離婚する(りこん): divorce
- ずっと仕事を続ける(つづける): continuer à travailler
- 受験」(じゅけん): examen d\'entrée à l\'université
- 高2のとき(こうに) : (abrégé) quand j\'étais en 2ème année de
lycée (senior high school)
- Alex とよんでください: vous pouvez m\'appeller Alex
- 経済(けいざい): économie (matière)\
- 二年後(ご): 2 ans après
- X 前と後に半年ずつ : 6 mois (1/2 année) avant et 6 mois après X
(ずつ = chacun)
- 営業部(えいぎょうぶ): le département des ventes d\'une entreprise
## Grammaire
- bien que : ときも、~ ex: bien que j\'aie attrapé froid, je dois
travailler 風邪を引くときも、働かなければなりません (NB: il y a
aussi のに et ても)
# 2021-12-11 Leçon 8
## Vocabulaire
- 塾(じゅく): cours du soir au Japon
- 辺り(あたり): (dans) le voisinage
- ずいぶん: très
- 2中(ちゅう): 2e année de junior high school (= collège)
- 2日前(ふつかまえ): il y a 2 jours (attention à la lecture !)
- 登り降り(のぼりおり): montée et descente = \"altitude\" d\'une
course
- 一位(いちい) la première personne d\'une course, etc
- 大勢(おおぜい)の人が+++ : comme il y avait beaucoup de monde
- 人前(いちにんまえ)) : portion pour 1 personne
- 3人前(さんにんまえ): portion pour 3 personne
- 届ける(とどける): délivrer
- 休暇中(きょうかちゅう): en vacances
- 小さなマラソン:course
## Grammaire
- ~になります Ajectif en -i : remplacer i par く+ なります
忙しい 忙し くなります(いそがしい) Ajectif en -na et nom : ajout
de に 有名になります 教師になりたい(きょうし)
- Rappel : forme en -て de なります : ないて On peut combiner donc :
春(はる)にないて、あたたかくなりました
- ここに来るとき: sur le chemin, en venant ici
# 2021-12-18 Leçon 9
## Vocabulaire
- 預かる(あずかる):garder, s\'occuper de
- 設計図(せっけいず):plan (de construction)
- 吹き出す(ふきだす):exploser, éparpiller
- スキー場(じょう): une station de ski
- 売店(ばいてん): petite boutique (ex: en gare+++)
- 拾う(ひろう): ramasser
- 席(せき): siège
- 書く(かく): écrire (un sms)
- 過ごす(すごす): passer (du temps) ex: クリスマス誰と過ごすの: avec
qui vas-tu passer Noel ?
## Grammaire
- A とき、B: \"quand\" A, B (A = forme du dictionnaire) Si A est au
passé, A est \"fini\". Sinon. A est en cours Cela explique les
différentes nuances :
- A et B sont présent ou passé = A puis B: ex:
新聞を読むとき、眼鏡をかけます しんぶん めがね
享年ドイツに行ったとき、ビールをたくさん飲み成した
- A au présent et B au passé : avant A, j\'ai fait B ex:
日本に来るとき、空港で買いました (くうこう) avant de venir au
japon, je l\'ai acheté
- A au passé et B au présent : futur ? ex:
日本に来たとき、空港で買います (くうこう) Subtilité :
新幹線に乗るとき、ビールを買いました = avant de monter, il a
achéte de la bière (= sur le chemin)
新幹線に乗るとき、ビールを買います = action habituelle (il
achète de la bière avant d\'y monter)
しんかんせん
- citation \~林さんは「教徒に行きます」といっていました= directe
\~林さんは教徒に行くといっていました = indirecte
# 2022-01-08 Lecon 9
## Vocabulaire
- 陰性(いんせい): négatif (test, ex: covid)
- 陽性 (ようせい): positif (test, ex: covid)
- 駅(えき): gare peut aussi être utilisée pour le métro, si le
contexte est clair
- 転ぶ(転ぶ):tomber de sa hauteur
- 落ちる(おちる) :tomber (mais de haut) Nature
- 木(き): arbre
- 森(もり): forêt
- 林(はやし): forêt
- 緑(みどり): verdure
- 池(いけ): mare
- 空気(くうき): ciel
- 畑(はたけ) : champ
- 田んぼ(たんぼ): rizière Urban life
- マンション: immeuble
- 道路(どうろ) 道(みち): route
- 橋(はし): pont
- 工場(こうじょう): usine
- 駐車場(ちゅうしゃじょう): parking
- 商店街(しょうてんがい): rue commerciale
- ガソリンスタンド: pompe à essence CHange:
- できる: être construit
- なくなる: démolir
- かわる: changer
- (きれいになる: rénover - 汚くなる(きた): se dégrader
- 広くなる(ひろ)devenir plus large - 狭くなる(せま): devenir plus
étroit
## Grammaire {#grammaire-7}
- ~ と思います:je pense que X Verbe と思います na-ajectif +
だ/ではない と思います i-ajectif と思います A は~と思っています: A
pense que X (attention !)
- いい -\> よくない(négatif) NB: よかった(passé), よくなかった (passé
négatif)
# 2022-01-16 Lecon 9
## Vocabulaire (cf Anki)
## Grammaire {#grammaire-8}
Transforner une phrase en nom avec の
明日の会議にでるのは、かどうさんです
Attention, il faut mieux mettre が ミルズさんが出張に行くのは 来週です
# 2022-01-29 Leçon 9
## Vocabulaire
Cf Anki
## Grammaire {#grammaire-9}
Nominalisation (suite) Rappel : マリアさんは出張に行くのは来週です On
peut également utiliser のが (qui s\'apparente à ことがあります)
子供ど遊ぶのがすきです お菓子を作るのがじょうずです ou のを selon le
bsoin お金を払うのをわすれました メール返事だすのをわれれました
# 2022-02-13 Leçon 10
- ので = \"donc\". Comme から mais plus poli - -いので - nom/adjectif
en
- na+なので On utilie la plain form ! - ありません-\>ない
- お金がないので、何も買いません - です-\>な - でした-\>だった
- 雨だったので、どこにもでかけませんでした
# 2022-02-27 Lecon 10
Discussion surtout + ので
# 2022-03-20 Leçon 10
## Grammaire {#grammaire-10}
Potentialité: on peut utiliser できます ou la forme potentielle
### forme potentielle
- Verbes réguliers I : う-\> える
- 合う ー>会える
- 話す ー>話せる
- Verbes réguliers II : る-\> られる
- 食べる ー>食べられる
- 見るー>見られる
- irréguliers 来るー>来られる(こ) する ー>できる
# 2022-03-20 Leçon 10
Discussion surtout
# 2022-03-27 Leçon 10
Vocab surtout
# 2022-04-10 Leçon 11
Discussion surtout
## Grammaire {#grammaire-11}
X よう: \"volitionel\" = \"faisons X\"
- る de la forme du dictionnaire -\> よう ex: 見るー>見よう
- pour les regular I : う-\> おう 飲むー>飲もう
X ようと思います: je pense faire X ex:
# 2022-04-24 Leçon 11
## Grammaire {#grammaire-12}
ことになりました : il a été décidé pour moi (c\'est un évènement
unique). Ex: il a été décidé que je déménage ことになっている : il est
convenu = c\'est une habitude ! Ex: il est convenu de ne pas fumer ici
# 2022-06-12
## Grammaire : questions indirecte
Je ne sais pas si
- quesion oui/non : verbe/ajectif + どうか
- 予約できるか どうか わかりません = je ne sais pas si je peux
faire une réservation
(よやく)
- 便利かどうかわかりません
- question \"quoi, qui+++\": pas besoin de どうか
- 何の医者なるか わかりません = = je ne sais pas quel sorte de
médecin je veux être
- どこに 行くか おしえてください : dis moi ou aller
Il y a une subtile différence entre どうか et か : premier =
\"whether\", second = si
# 2023-02-26 - Aya-sensei : discussion
Grammaire -ta koto ga arimasu : déjà fait
- ちゃんと : suffisamment
- 飼う(ka): avoir un animal
- いがくせいぶつがく 医学生物学 = biologie médicale
- sample = sample
- かんじゃ 患者 patient
- けんきゅう 研究 recherche
- けっか 結果 résultat
- はんしょくき 繁殖期 saison de reproduction
# 2023-03-12 - Aya-sensei: lecmon 11
## Vocabulaire
- zenkai : la dernière fois
- compter des verre = \"pai\" ippai = 1 verre, nippai = 2 verres
- saikin = bactéries
- sakkinn = stériliser
- c'était plus loin que ce qu'il mavait dit = ita yori mo+++
- chuushiki = seringue
- doggu = outil
- けっか 結果 : hépatite B
TODO: vocab sur skype + skilled
## Grammaire {#grammaire-13}
forme en -ou + to omoimasu
nakerebanarimasen NB: -nasai = injonction (bossy !)
# 2023-03-25
## Vocabulaire
- 雪は山の上に行かないとないですか = il faut aller en haut de la
montagne pour avoir de la neighe (double négatiionidiomatic)
- 夜勤 j(やきん) = garde (tochaku = plutôt pour les gens de la
sécurité+++)
- 能力(のうりょく) = capacité à faire qqc
- 認める(みとめる) = reconnaître
- 能力が認められれば色々な仕事をすることができます。
- 教わる = apprendre
- 子供のような態度(たいど) = se comporter comme un enfant
- 〜だと言われました = il a été dit que +++
- 落ち着く = se calme
- びっくりします = être surpris
- あんしんします = être soulagé
- がっかりします = être décu
- こまります = avoir des diffculté, être troublé
- さびしい = se sentir seul
- うれしい = être content
- かなしい = être triste
- はずかしい = être embarasssé
- きもちがいい/わるい
- ざんねん\[な\]. = regretter (une situation)
- しんぱい\[な\]
## Grammaire {#grammaire-14}
-te vs -node -te = pour décrire un sentiment, une sensation -node =
demander une permission, être poli
\'can we use Feeling+て+++, not only 〜て feeling+++?\' Yes, for
example:
ロキくんがいなくなってさびしくて、ごはんが食べられません。仕事のことがしんぱいで、ねむれません。
These work with feeling+て (giving a reason) as it\'s followed by
potential verbs.
# 2023-04-02 Listening comprehension 「日本のおもしろい経験」
## Vocabulaire
- 経験(けいけん) expérience
- 特に(とくに) particulièrement
- 珍しい(めずらしい) rare
- 不味い(まずい) ayant mauvais goût (nourriture)
- 何でも : totu
- ニヤニヤする : sourire, grimacer
- 不安な(ふあんな) : se faire du souci (\"non\" + \"sécurité\")
- 体にいい(からだ) : être bon pour la santé
- 一生に一度(いっしょうにいちど) : une foi dans sa vie
- もう\~ない : après tout
- 焼き(やき) : grillé (ex: yakiniku)
- 興味(きょうみ) : intérêt
- 野菜(やさい) : légume
- ムール貝(がい) : moules
- 城(しろ) : château
- 蜘蛛(くも ) : araignée
# 2023-04-11 Tue\> Listening comprehension 「満員電車」
Travail sur comprehension
- 満員電車(まんいんでんしゃ): un train bondé (NB: bondé peut
s'utiliser pour d'autres type de transport)
- 第一ン章(だいいちいんしょう): première impression
- 込む(こむ) : être bondé
- 空港(くうこう): avion
- 医学生物学 (いがくせいぶつがく) : biologie médicale
- 民間研究所(でよかったです) laboratoir privé
- 救急医療室(きゅうきゅういりょうしつ) : urgence
- 単語(たんご ) : vocabulaire
- 昼(ひる ) : midi
- ある日(ひ) : un jour
- 〜に限らず(かぎらず): ne pas se limiter à (forme en -zu)
- 国民( こくみん) : citoyen
- 引退 (いんたい): retraite
- 選(えらぶ) : choisir
- いきなり
- 〜みたいです
Note: 「いつも同じ電車に乗ります」= Always, I ride on the same train.
「いつもと同じ電車に乗ります」= I ride on a train that I always use/ride
le premier = plus l'accent sur \"toujours\"
# 2023-04-22
## Vocabulaire
- 泊まる(と) : rester (à un hôtel)
- 翻訳(ほんやく): traduction
- 時給(じきゅう): salaire horaire
- いいアイデアです: une bonne idée
- 編み物(あみもの) : couture
- 衛生検査所(えいせいけんさじょ): laboratoire de biologie
- ベルトコンベアう: tapis roulant
- 看護師(かんごし): infirmière
- コンサルタント: consultant
- 医者は貧血の検査をするためサンプルを分析した : le doctor a fait une
analyse de sang sur un échantillon pour anémie
いしゃ ひんけつ けんさ ぶんせき
## Grammaire {#grammaire-15}
Voir [*Grammaire : questions indirecte*]{.spurious-link
target="*Grammaire : questions indirecte"} Prochaine leçon : travailler
questions indirecte
# 2023-05-06
## Vocabulaire
- 助けられるかどうかわかりませんでした : je ne sais pas si je peux
aider (attention à la possibilét)
- 審査員(しんさいん): jury (ex: de thèse)
- 方向( ほうこう): direction
- 質問というより、会話のようでした: c'était plus une conversation que
des questions
- 国民の休日( こくみんきゅうじつ): jour férié national
- 修理(しゅうり): réparer
- おの : hache
- 刃(は): lame
# 2023-05-29
## Vocabulaire
Microbiologie
- 半日(はんにち) : une demie journée
- 一日(いちにち) : un jour
- 一日中(じゅう)toute la journée
- 二週間に一度の日曜日: le samedi d\'il y a 2 semaines
(にじゅうかん) (いちど) (にちようび)
- 選ぶ(えらぶ)choisir
- 人権(じんけん)droit de l\'homme
- 細菌(さいきん)bactérie
- 結果(けっか)résultat, conséquence
- カビ moisissure
- 生ぬるい(な)tiède
- 細菌(さいきん) を 培養します(ばいようします) : les bactéries
poussent
- 決める(き)décider
大阪(おおさか)に残って(のこって)好きな仕事を続けましょう(つづ):
reste à Osaka et continue à faire le travail que tu aimes
- 悩み(なやみ) souci
- アドバイス: conseil (donner) != 相談(そうだん)= conseil
(demander)
- 年上(としうえ): être plus agé
- 付き合う(つきあう): sortir avec
- 愛す(あいす) aimer
- どうしたらいい: que faire
- 急に(きゅうに): soudainement
- 場合(ばあい): cas, situtation
# 2023-06-04
## Grammaire {#grammaire-16}
V-といいです: Il faudrait que tu V ex:
「頭が痛いです」「水を飲むといいですよ」
v-たらどうですか: il serait bien que tu V ex:
「水の飲んだらどうですか。」
ne rien X nanino tabemasu nanio hanusu koto ga arimasu
nogaku narimasu = ?? nariso ???
## Vocabulaire
- 自動( じどう ): automatic
- 何日間: how many days
togaru = avoir très envie de
# 2023-06-25
## Vocabulaire
- 法的 ( ほうてき ) : légal
- 法的にギリギリ ( ほうてき ) : être dans une zone grise lélagement
- 法的にどうかはわかりません : je ne sais pas si c\'est légal
- 医学書(いがくしょ): livre de médecine
- 温暖化(おんだんか ): réchauffement climatique
- 晴れています(は): il fait beau (noter la forme en -te imasu)
-木工(もっこう) : menuiserie
- 解決(かいけつ) : résolution
- 諦める (あきら ) : abandonner
## Grammaire {#grammaire-17}
Rappel
- 〜たことがありません : ne jamais avoir fait
- 〜たことがありませんでした : ne jamais avoir fait (mais maintenant
c\'est fait !)
\~にくい: difficile de
- 行きにくい : difficile à atteindre
# 2023-07-09
## Vocabulaire
- 傷つく(きず ): être blessé
- 水流(すいりゅう): courant de la rivière
- 体力 (たいりょく ): endurance mais aussi force physique (selon
contexte)
- 初心者(しょしんしゃ): débutant
- 処方箋(しょほうせん): prescription médicale
- 出張 (しゅっちょう ) : voyage d\'affaire
- 危険 (きけん) : danger
- 渓谷 (いこく ) : gorge (canyon)
- 沢登り (さわのぼ ) : remonter un canyon
- 懸垂下降( けんすいかこう ) : rappel (escalade)
- 水泳 (すいえい ) : nage
- 飛び込み (と-こ-) : saut
# 2023-07-23
## Vocabulaire
- 埋め立て地 (う た ち): décharge (déchet)
- その当時(とうじ): à ce moment (passé)
- 成功(せいこう): réussite
- 大成功
- スタジオ: studio de cinéma
- 〜作品 ( さくひん ): compteur pour les films
- 普通は(ふつう は): d\'habitude (?)
- 一度(いちど): une fois
- 〜が待ち遠しいです: avoir hâte de +++
- トビ: milan noir
- 主題 しゅだい : sujet, thème (film, composition..)
- 試験に合格する(しねん ごうかく) : réussir un examen
- 試験に 落る(おち) : échouer à un examen
- 試合に勝つ(しあい かつ) : gagner un match
- 試合に 負ける(ま): predre un match
- 鞄をを忘れる(わ): perdre son sac
- 財布を落す(さいふ おと): perdre un portefeuille
- 寝坊する (ねぼう): trop dormir
- 会議 送れる(かいぎ おく): être en retard pour une réunion
## Grammaire {#grammaire-18}
décrire un état: verbes + te, emotion
- 嬉しかった(うれ): être content
- 驚きました(おどろ): être surpris
- 悔しかったです(くやし): être déçu/fustré
- がっかりしました: être indifférent
- 困りました(こま): être embêté
- 大変 たいへん: c\'est horrible
- 恥ずかしかった(は)Ê: être embarassé
Ex: 試験に合格して、嬉しかったです
# 2023-08-06
- 早めに(はや) : en avance, rapidement
- 地方(ちほう): région (adminstratif)
- 朝型 (あさがた): être une personne matinale
- 夜型 (よるがた): être un personne du soir
- 瞑想(めいそう): méditation
- メディテーション: méditation
- 機能しません(きのう):ne pas être fonctionnel i.e ne pas être
réveillé
- 運動する(うんどう): faire du sport
- 朝起ききたごの2時間 (あさおき ご): 2 here après s\'être levé
tôt
- 絶食(ぜっしょく): jeûne (mais ne marche pas pour le jeûne
intermittent)
- 担当(たんとう): être responsable de
- 苦になりません(く): faire disparaître les soucis
- 何もする気になれない(なに き): n\'avoir rien envie de faire
- 最初(さいしょ): début
- 向上が見られない(こうじょう): être sur un plateau (\"ne plus voir
de progrès\")
- 集中(しゅうちゅう)できます: puvoir se concentrer
- やる気(き): la motivation, volonté
- 遅刻(ちこく) : retard (être en retard+++)
- 必須(ひっす) : obligatoire, indispensable (ex: un cours)
- 必須科目(ひっすかもく) : une matière obligatoire (école)
# 2023-09-17
## Vocabulaire
- 観光(かんこう): tourisme
- 検査技師 (けんさぎし): technicien de laboratoire
- すべる : glisser
## Grammaire {#grammaire-19}
- verb + づらい: difficile de faire V
- ex: 辛い つらい
- ex: 一緒に仕事しづらいです
- \~ぶりに : depuis \~ (idée que beaucoup de temps s\'est écoulé)
四年ぶりにパラグライダーをまた始めました。
# 2023-10-01
## Vocabulaire
- 空(から): vide
- ほとんど : la plupart
- 蒸します(むします) : cuire à la vapeur
- 蒸し器(むしき): un cuit-vapeur
- ボツリヌス中毒(ちゅうどく): empoisoinnement par botulisme
- 何日後(なにちこ): il y a combien de jours ?
- 少々 お待ちください(しょうしょう おまち): attendez un peu
- 用意します (ようい):
- 連絡(れんらく) : contact
- 連絡先(れんらくさき): contactio informatdion
- ガスボンベ: bouteille de gaz
- 一日(いちにち)
- 目玉焼き(めだまやき)
- ミディアムレア : saignant (cuisson)
- レア : bleu (cuisson)
- 焼く(やく) : griller
- 目玉焼き(めだまや ): oeufs au plat
- 18 000 = まん はち せん 4月 一日と2日、3名
なんんですが。。。(しがつ ついたち ふつか): une réservation du 1er
au 2 avril (2 nuit). Attention à la lecture
## Grammaire {#grammaire-20}
- \~かもしれません: peut-être
- ーたら vs ーとき:
- ーたら : si \~, alors +++
- ーとき: quand \~, alors..
La différence vient du faire que tara est une période de temps assez
flou (i.e pas tout de suite)
# 2023-11-19
## Vocabulaire
- 住んでいる (す) = habiter
- 人口は 5 万人 ( じんこう ) (ごまんにん) : une population de 50 000
- へきち( 僻地 )= arrière-pays
- びょういん hopital
- 突き崩す (つきくずしました) = razer
- A と B の間にを建てました (あいだ) (た) : construire entre A et B
- 貸す(かす) = prêter
- 家賃が安い (やちん やすい): le loyer n\'est pas cher
- シェアアパー = coloc
- 借りる(か ) = louer
今の病院のあまりよくない所(点)は緊急医療室の忙しさです。
- 寮(りょう) : internat (\"dormitory\")
- 洪水(こうすい) inondation
- 泥(どろ) : boue
- どろどろ boueux
- 体操 たいそう gymnastique
- 体全体 (からだ ぜんたい) : tout le corps
- 健康 けんこう santé
- 普通 ふつう normal, ordinaire
- 内科 ないか : médecine interne
- 外科 げか chirurgie. Ne pas confondre 料 (matériale, ex: cuisine
りょうり 料理 avec 科 (département)
- いい人 une bonne personne
- 悪夢 あくむ un cauchemar
- いい所 (ところ) : un point positif. Exemple
今の病院の方がいい所がたくさんあります。 il y a beaucoup de points
positifs par rapport à mon hôpital actuel
## Grammaire {#grammaire-21}
Nominaliser un adjectif
- en -i -\> remplacer par -sa. いそがしい -\> いそがしさ
- en -na -\> remplacer par -sa へんな -\> へんさ
今の病院のあまりよくない所(点)は緊急医療室の忙しさです。
après X: -てから. Exemple : après être allé : きってから
# 2023-12-17
## Vocabulaire
- おゆがわく:mettre de l'eau à bouillir (passif)
- おゆをわかす : faire bouillir de l'eau (actif)
- 肉をやく: mettre de la viande à cuire
- 肉がにえる : faire cuire de la viande
- やすいを入れる : mettre des légumes
- ダンボール箱: carton (de déménagement)
- 食用(しょしょう): comestible
- 役に立たない: être inutile
- 説明する(せつめい): expliquer
- 美術館(びじゅつかん): musée d'art
- 自由時間: moment pour soi
- 過ごします: passer du temps
- 食堂(しょくどう: catine
- 集まる: rassembler
- 怖がり(こわい): timide, peureux (forme en -gari)
-ポット: thermos (attention, faux ami)
- 着く(つ ): arriver
- 2時すぎ: un peu après 2h
- 旅館: ryokan
一れつに おならびくあさい: faites une line (= queue) svp
## Grammaire {#grammaire-22}
- らしい
- Révision -たら
- compter les animaux : pikki
- petit animaux (chien, chat): 匹 (ひき
- lapins, oiseaux : 羽 (wa)
# 2024-01-21
## Vocabulaire
- sorekara = pour succession d'action
- sorenara = dans ce cas (propose une solution alternative)
- 毎月 (まいつき) = tous les mois
- 電話代 (でんわだい ) = facture de téléphone
- 電話料金 ( でんわりょうきん ) = frais de téléphone
- 月額 ( げつがく ) : somme mensuelle
- データ通信量(つうしんりょう): débit internet
- プランを変えました : forfait téléphonique
- お年寄り(としよ) : personne âgée
- 観光 ( かんこう ): touriste ("celui qui voit la lumière")
- 説明 : explication
## Grammaire
- Il n'est pas obligatoire de : ~ なくてもいいです
- Ex. もうワクチンは受けなくてもいいです
# 2024-01-28
## Vocabulaire
- 避けます(さけます) : éviter
- 健康 (けんこう) : santé
- 味 (あじ) : goût (nourriture)
- あまり好きではない : ne pas trop aimer quelque chose
- 神の雫 (かみのしずく) : les gouttes de Dieu (manga)
- 旅館 (りょかん)
- 旅行 (りょこう) : voyage
- 図書館 (としょかん ): bibliothèque
- 一日中 (いちにちじゅう) : toute la journée
- 早い話が (はやい) (はないしが) : pour faire court+++ (expression)
- 曲げます (ま) : se déformer sous (ex: subir la pression (en société par exemple))
- この席 空いていました 席 (おいて)
- そうだん になります: je vais te conseiller (on va regarder ça ensemble)
- たすかります : je vais t'aider (formule de politesse)
- 用意ができたら 、出かける 予定です (ようい) (ようてい): je prévois de sortir quand je serai prêt
# 2024-03-09
## Vocabulaire
- くわしい :
- 老人ホーム : maison de reraite
- 日程を決める : réserver une date
- 下書き : brouillon
- 自信がある : have confiance
- 地震 : tremblement de terre
- 夜の12時ごろ : vers minuit
- 脳の体力 : "endurance mentale"
- 選択の余地がない : je n'ai pas le choix
- 選択ができません : je n'ai pas le choix
- 〜しないわけにはいかない : je n'ai pas le choix (être obligé de )
- 明日遅れることが一番 : il vaut mieux être en retard demain
- 明日送れることが一番 : il vaut mieux l'envoyer demain
- まったく知らないわけではない : ce n'est pas comme s'il ne savait pas (= il sait faire)
## Grammaire
- あまり〜ていない: peu de ...
# 2024-03-31
## Vocabulaire
- 海外旅行 (かいがいりょこう): voyage à l'étranger
- リメイク : remake
- 同じレストランに二度行くようなこと : c'est comme aller deux fois de suite dans le même restaurant
(ふたたび)
## Grammaire
ーてきます pour exprimer un changement. Ex: 人工(じんこう)がふえてきました = la population a augmentée
# 2024-04-28
## Vocabulaire
- さしぶり est composé du préfixe ぶり, qui peut être utilisé avec d'autres durée. Ex 一年ぶり = cela fait un an que l'on ne s'est vu
- 宣誓する (せんせいする): prêter serment
- 婚約(こんやく): fiançiailles
- プレゼンテーション : présentation
- 留守(るす)する: être absent de la maison
- ちょうど良い : être exactement (de la bonne taille, longueur...)
## Grammaire
- -たら = si. On utilise la forme en -た en rajoutant ら. Ex: さむかったら、。。。
- Dragmap :
- correction PR
- compliation ne fonctionne plus avec glibc : explique nixpkgs review. Mise àjour glibc
https://github.com/bminor/glibc/commit/64b1a44183a3094672ed304532bedb9acc707554
fait le 16 mai donc il faut <= glibc-2.37.9000.
On patche simplement la ligne fautive, en supprimant le pclose
On veut éviter que le sang ne soit trop dilué, ou on contraire pas assez
dilué.
Or les mouvements d\'eau (entre le secteur intra- et extracellulaire)
vont dépendre des concentrations ! Par exemple, il y a surtout du sodium
en extra-cellulaire. Donc s\'il y est très concentré, l\'eau va sortir
des cellules pour équilibrer tout ça.
Comme c\'est compliqué de calculer la quantité de sodium, on va regarder
sa concentration, la natrémie.
# Cas 1: hyponatrémie (sang trop dilué ?)
Une natrémie basse = augmentation du volume plasmatique ? Pas
toujours...
- si la glycémie est très haute, cela va forcer un déplacement d\'eau
en dehors des cellules. Donc le sodium sera dilué mais ce sera
simplement un **transfert** !
- s\'il y a trop de protéines, la machine qui mesure la natrémie va
les compter aussi dans le volume. Donc **fausse dilution**
Sinon oui ! (**vraie hyponatrémie**) Dans ce cas, on réfléchit sur la
diminution de la concentration du sodium = quantité de sodium / volume.
On a 3 situations
1. Augmentation du volume seule : c\'est la version facile. Ça peut
être du à :
- trop de boisson !
- l\'hormonone anti-diurétique qui est sécrétée en excès
- autres
2. Le sodium et le volume diminuent mais le sodium diminue nettement
plus : on a donc des **pertes de sel**
- soit par le rein (diurétique...)
- soit ailleurs (vomissement, diarrhés...)
3. Le sodium et le volume augmentent mais le volume augmenet nettement
plus : pour simplifier, il faut imaginer qu\'il y a des oedèmes.
L\'eau s\'accumule en interstitiel, donc la pression artérielle
diminue. En réaction, l\'hormnone antidiurétiqe est stimullée pour
corriger tout ça. D\'où **réabsorption de sodium et d\'eau** !
- insuffisance cardiaque
- insuffisance hépatocellulaire
- insuffisance rénale (mécanisme différent)
Physiopath de l\'HTA
- Sténose de l\'artère rénale : rein hypoperfusé =\> activation du
système rénine angiotensine =\> augmentation rénine et par
conséquent aldostérone, hypokaliémie
- Coarctaion de l\'aorte : hypoperfusion =\> activation du système
rénine angiotensine
- Phéochromocytome : tumeur de la médullosurrénale =\> produit
(nor)adrénaline
- Adénome de Conn : tumeur des surrénale =\> produit aldostérone =\>
hypokaliémie et diminution rénine en réaction
- Syndrome de Cushing : compliqué mais augmentation résistance
vasculaire et du débit cardiaque =\> aldostérone, rénine basse
- Acromégalie : rétention de sodium, expansion volémique
- Hyperthyroïdie : augmentation volume sanguin, débit cardiaque
# BNP
Effet natriurétique (d'où le nom)
\< 100: forte probabilité d'absence d'insuffisance cardiaque 100 - 500 :
zone grise \> 500: forte probabilité d'insuffisance cardiaque
# [TODO]{.todo .TODO} Ammoniaque {#ammoniaque}
## Naissance
Libéré par la dégradation des acides aminées.
## Vie
## Mort
Pour éviter une excrétion continue d'eau. il est converti en urée dans
le foie puis excrété. Cela permet d'éviter la toxicité de l'ammoniaque.
## Effet
## Indication
## Dosage
# Bilirubine
![](../images/biochimie/bilirubin.jpg){width="400px"}
# BNP (Brain natriuretic peptide)
## Naissance
synthétisé par myocyte du ventricule gauche (et droit) en réponse à une
surcharge volémique
## Vie
- Form de réserve = pré-proBNP, clivé en pro-BPN, clivé en NT-proBNP
(inactif) et BNP (actif).
Se fixe sur les récepteurs de type A sur endothélium vasculaire
- Stockage : non
## Mort:
- BNP: demi-vie de 20min puis dégradé endothéliium
- Nt-proBNP = éliminé dans tous les tissus où le débit est élevé.
Demi-vie : 1-2h pour NT-proBNP, 20min pour BPN,
## Effet
compense la surcharge volémique par
- vasodilatation périphérique
- natriurétique
- augmentation filtration glomérulaire (**diurétique**)
- diminution réabsorption du sodium (\*natriurétique)
- inhibition du système Rénine-Angiotensive-Aldostérone
## Indication
marqueur global de l'issufisance cardiaque (diagnostic, pronostic,
suivi)
## Dosage
# [TODO]{.todo .TODO} Corps cétoniques {#corps-cétoniques}
# CPK (créatine-phosphokinase)
## Naissance
Enzyme dans le cytosol ou mitochondrie des cellule : muscles
squelettiques++ et cardiaque, cerveau, rein, gastrointestinal
- CK-MM (95%) = muscle strié squelettique
- CK-MB = muscle cardiaque
- CK-BB (= cerveau, gastro-interdsstinal
## Vie
Catalyse la phosphorylation de la créatine en créatine phosphate par
l\'ATP (avec production ADP) Voir [*Vie de la créatine*]{.spurious-link
target="*Vie"}
## Mort
## Effet
contraction musculaire
## Indication
- Infarctus du myocarde, myopathie, myosite
- Certains cancers, affection du système nerveux central
## Dosage
# Créatine
## Naissance
Il s'agit d'un produit de l'arginine (transformation en glycine par la
glycine amdinotransferase, qui va générer du guanidinoacetate et de
l'ornithine. Cette première est méthylée en créatine). Ces réactions ont
lieu dans le foie, rein et cerveau.
## Vie
La créatine est transportée dans les muscles squelettique La
phosphorylation de la créatine sert à faire la phosphocréatine, qui est
un réservoir d'énergie (muscle squelettique, cerveau surtout) car la
déphosphorylation permet de créer de l'ATP. \$creatine + ATP ↔
phosphocreatine + ADP \$
## Mort
Pour l'excrétion dans l'urine, la créatine est convertie en créatinine.
# Créatinine
## Naissance
Pour excrétion dans les urine, la [*créatine*]{.spurious-link
target="Créatine"} est tansformée en créatinine
## Vie
Libérée par le muscle
## Mort
Éliminée par le rein par filtration glomérulaire et excrétion dans le
tubule proximal
## Effet
Pas de rôle physiologique
## Indication
Pas de réabsorption par le rein, donc marqueur de fonction rénale
## Dosage
La clairance de la créatinine sert d'approximation pour le débit de
filtration glomérulaire (voir [*DFG*]{.spurious-link target="*DFG"})
# Cycle de l'urée
Permet d'éliminer l'ammoniaque et l'urée
## Initialisation
le CO~2~ passe du cytosol dans la mitochondrie puis :
$CO_2 + H_2 O \leftarrow HCO_3^{-} + H^{+}$ Puis
$HCO_3^{-} + ATP \rightarrow NH_3 + ADP$
Le NH~3~ est converti en carbamate -\> carbamoyl-P (catalysé par
N-acetyl glutamate, qui entre dans le cycle
## Cyle
1. Le Carbamoyl phosphate est converti en citrulline (raction de
condensation avec l'orinithine).
2. La citrulline sort de la mitochonrie et va se condense avec
l'aspartate. Le \"cleavage\" va créée de l'arginine et du fumarate.
3. L'arginine est clivée par l'arignase, libérant de l'urée et
reconstituant de l'orinithine, qui retourne dans la mitochondrie.
# DFG
La clairance de la créatinine est estimée par le Débit de Filtration
Glomérulaire. Évaluation DFG à partir de la créatininémie
- Cockroft et Gault: age, **poids**, créatinimie. Mauvaises
performances si obèse, \> 75 ans.
- MDRD, CKD-EPI : **sexe**, age, créatininémie, **ethnie**. **pas le
poids**
-\> CKD-EPI. recommandé par la HAS. Aussi plus précise que MDRD pour
valeur basse
- Schwartz : enfant
- recos HAS:
- MDRD non validé si
- CKD-EPI si dosage enzymatique, MDRD si colorimétrique
Attention : formules non utilisable chez l'enfant (formule du Schwartz),
variation aigüe de la fonction rénale, cirrhose hépatique décompensée,
gabarit hors norme, amyotrophie important, grossese
Dans ce cas, utiliser clairance urinaire sur urines de 24h = créat
urinaire\*débit/créat sanguine
# Fer [[bonnefont]{.smallcaps}]{.tag tag-name="bonnefont"} {#fer}
## Physiopatho
### Cycle
![](../images/biochimie/fer.png) NB: *apo-* est utilisé quand il n'y a
pas de fer (ex: apotransferrine = transferrine sans fer)
1. Stockage
Surtout dans le foie et la rate, sous forme de Fe^3+^ contenu dans
soit
- ferritine : macrophages, hépatocyte
- hémosidérine (libération lente)
Le Fe^3+^ est oxydé en Fe^2+^, se retrouve dans le plasma où il va
être oxydé afin d'être transporté par la transferrine (oxydation
réalisé par la céruléoplasmine) NB: Les macrophages sont mobilisé en
premier pour l'érythropoïèse
2. Production et transport
Production de Fe^2+^
- Absorption intestinale de Fe^2+^
- Dégradation de l'hémoglobine par les macrophage avec production
de bilirubine et Fe^2+^
Évolution du Fe^2+^ (intestinale ou macrophage): 2 possibilités
- stocké dans la cellule sous forme de *ferritine* (en se liant à
l'apoferritine),
- ou pris en charge par la *ferroportine* et largué dans la
circulation sanguine
Dans le sang Fe^2+^ oxydé en Fe^3+^ qui est transporté par la
*transferrine*. Il va y avoir ensuite des échanges entre la moelle
osseuse, le foie et le système réticulohistocytaire
### Régulation
- HFE: diminue l'affinité du récepteur de la transferrine -\>
- hepcidine : dégradation de la ferroportine -\> fer \"bloqué\" dans
les entérocytes -\> hyposidérémiant
## Patholologiques
### Surcharges
1. Hémochromatoses héréditaires
- Type 1 = 80% des adultes = autosomale récessive sur *HFE* :
affinité excessive du fer pour réticulohistocytaire et cellules
parenchymateuse hépatique
Atteinte hépatique (hépatomégalie, cirrhose),pancrétaique, cardiaque
- Forme juvénile également
- traitement = saignée (oral si juvénile)
2. Secondaires
- excès supplémentation martiale/transfusion
- Anémies hémolytique, dysérothropoïèse, thalassémie,
hémoglobinopathies
- dysmétabolique : biologique = syndrome métabolique
d'insulinorésistance
### Autres
- Anémie inflammatoire (infection sévère, chronique, nopélasie): le
fer provenant de l'hémolyse physiolique est mal recyclé
- autres affection génétique microcytaire hypochromes avec sidérémie
normale/augmentée: OMIM 209300 604290 206100
- Carences martiales (saignements chronique, maladie de Wilson,
carence vitamine C, malabsorption...)
## Exploration
- Ferritine circulante = le plus sensible et le plus précoce, ≈ stock
de fer
- Fer sérique : augmenté si surcharge en fer, cytolyse hématique,
diminué si carence martial, inflammation
- transferrine : augmenté si carence en fer, diminué si malnutrition
attente hépatique grave, syndrome inflammatoire
- Capacité totale de fixation de la transférrine = 25 × transferrine
- Coefficient de saturation de la transferrine = fer sérique / CTF
× 100
- Autres :
- fer non lié à la transferrine = spécialisé
- récepteur soluble de la transferrine = diagnostic des carences
en fer pendant état inflammatoire
- protoporphyrine libre : augmenté dans les urines si carence en
fer, cancer, affection chronique
- Ahepcidine = anémie hypochrome microcytaire avec suspicion
génétique, suivi hémochromatoses héréditairesc IRC et
inflammation chronique
Génétique: 1. p.Cys282Tyr de *HFE*. 2. si non homoygote, coefficiente de
saturation (diminué si hétérozygote)
## Arbre
ferritine normale
------------------ ------------------- -------------- ----------- ---------- ---------------
Ferritine Transferrine CTF CST Autres
carence martiale diminuée augmentée augmentée diminuée
inflammation normale/augmentée diminué diminuée normale CRP augmentée
thalassémie etc CRP normale
------------------ ------------------- -------------- ----------- ---------- ---------------
ferritine augmentée
- CTF et CRP normale : surcharge acquise, maladie de Gaucher
- CS augmentée : hémochromatose type 1 ou surcharge secondaire
# Foie [[bonnefont]{.smallcaps}]{.tag tag-name="bonnefont"} {#foie}
## Physiologie
Énergie:
- stocke glucose
- libère le glucose stocké, le produit par néoglucogenèse
- synthèse des corps cétonique: oxydé pour être utilisé comme énergie
par muscle squelettique, cardaque, cortex rénal
Synthèse majeure partie des protéines sauf immunoglobulines
- albumine
- transport (transferrine...)
- coagulation
- inflammation (CRP, partie du complément)
Synthèse du cholestéral Épuration :
- déchet du métabolisme = amoniaque sous forme d'urée (catabolisme
azotée), bilirubine ,
- hormones (stéroïdes)
Transforme médicaments, toxique.... par modification (ex: cytochrome
P450) puis conjugaison
### Bilirubine
Production
- 20% catabolisme dans le foie des autres composants de l'hème ou
destruction érythroblastes moelle
- 80% hémoglobine par destruction des hématies
Cycle:
- Bilirubine libre/non conjuguée = circule dans le plasma liée à
l'albumine
- conjugée dans le foie
- bilirubine conjugée secrétée dans le duodenom par voies biliaires
- oxydation qui va donner la couleurs aux selles. Une partie passe
dans les urines
Patho:
- excès des capacité de transport de la bilirubine libre (exemple =
préma) on a alors bilirubine libre non liée à l'albumine
- bilirubine conjugée dans le plasma -\> urines foncées (diag
d'ictère)
### Fonction biliaire
- élimination métabolite
- absorption lipides
Patho: sursaturation du cholestérol -\> cristaux -\> calcul
## Marqueurs
### Cytolyse:
- [ALAT]{.underline} \> 40 U/L = cytosol (foie +/- muscles)
- [ASAT]{.underline} \> 35 U/L = cytosol + mitochondrie (foie,
muscles, coeurs, rein, pancréas, cerveau)
Attention :
- hémolyse = ininterprétable (aminotransferase globules rouges\>
plasma )
- ASAT \< ALAT car demi-vie inférieure (sauf alcool chronique car
grosses mitochrondrie)
- Aigü : normalisation en 6 mois
- seulement souffrance cellulaire et non état fonctionnel du foie
NB: LDH (lyse cellulaire) non spécifique mais très marqué pour métastase
hépatique NB: peuvent être augménte si stéatose, inlammation modérée,
obstruction des voie billaire, cirrohse, exercice musculaire violent
### Synthèse
- [Coagulation]{.underline} : complexe prothrombinique diminué
- non spécifique des insuffisance hépatocellulaire (cholestase
avec défaut absorption vitamine K)
- si \< 60%, doser facteur V pour confirmer IHC
- attention: fibrose dès \<90% dans patho chronique
- [Albumine]{.underline} : produit par l'hépatocyte
- important mais non spécifique de l'IHC (malnutrition,
malabsorption, rénal)
### Épuration
- [Urée]{.underline} = diminué si IHC (genèse hépatique)
- [Ammoniac]{.underline} = augmenté si ICH -\> suivi des IHC et foie
(toxicité système nerveux central)
### Sécrétion bilaire
Surtout défaut d'excrétion [bilirubine conjugée]{.underline} +
augmentation bilirubine totale
### Cholestase
Diminution/arrêt sécrétion biliaire. 3 atteintes :
1. synthèse
2. Sécrétion intrahépatique
3. extrahépatique
Marqueurs
- bilirubine : augmentation totale + conjuguée (attention, ictère
retardé : conjonctive si \> 50µmol/L)
- enzyme :
- [phosphatase alcaline]{.underline} (PAL) augmentée mais non
spécifique (patho. osseuses, cancers). Active dans foie, os,
rein, intestin, placenta \[Attention âge, grossesse\]
- [gamma-glutamyl transférase]{.underline} (γGT): origine
hépatique pour l'enzyme circulante (+ pancréas, reins, rate,
poumon, prostate). Augmenté sensible mais peu spécifique
(alcool, contraceptique, phénoparbital) \[Attention population
africaine\]
Coagulation: Diminution du TP avec facteur V normal
Autres
- Augmentation acides biliaire totaux = cholestase
- Pigments
- biliaire dans urines (+produits transformations)
- Selles décolorées = cholestase
- IgM = cirrhose biliaire primitive
### Inflammation
CRP, vitesse sédimentatino érythrocytaire, électrophorèse ptoténies
sériques
### Fibrose hépatique
- ponction biopsie, Fibroscan (non invasif)
- acide hyaluronique = surtout valeur prédictive négative
- scores : Fibrotest, Fibromètre, Hépascore
## Interprétation
Augmentation ALAT/ASAT
- aigue \> 10N: hépatite virale aigüe A, B, médicaments (IMAO,
méthyldopa...), toxique (paracétamol, champignon), lithiase de la
voie biliaire principale, ischémie hépatique aigue
- aigüe modérée 3-10N: hépatite virale A, B, autre infections (EBV,
cmv, HSV, toxoplasmose), alcool, surcharge pondérale, atteinte
hépatobiliaire chronique
- chronique \< 3: VHC, VHB chronique, stéatose hépatique du
diabote/dyslipidémie,/obésite, alcoolisme (rappport inversé), autres
médicaments (isoniazide...), autto-immun, surcharge (hméocromatose,
Wilson) NB: élimiier une nécrose musculaire/myocardique, pancréate
NB: cherche un risque d'hépatite fulminante : TP, facteur v,
ammionémie
Bilan enzymatique anormal
γ GT PAL ALAT,ASAT Interprétation Étiologies
---------- ---------- ------------------- ---------------------------- --------------------------------------------
augmenté augmenté augmenté hépatopathie cytolytique hépatite virale, alcool, médicaments
augmenté augmenté N ou peu augmenté hépatopathie cholestatique \- médicaments (antidépresseurs),
\- biliaire, pancréas, foie
augmenté N N alcool, médicaments inducteurs
enzymatique, stéaotose, sucharge pondérale
+/- hyperthyoroïdies, parasite
Cholestase : PAL \> 1.5N (plutôt extra hépatique), γGT \> 3N (plutôt
intra-hépatique), ALAT, AST \< 2N Ictère : augmentation bilirubine
----------------- -------------------- ---------------------------------------------------------------------------
non conjuguée : \- extra-hépatique hémolyse (nouveau-né, constit, acquis)
\- hépatique : Gilbert, Criggler-Najjar, ictère transitoire du nouveau-né
conjuguée \- intra-hépatique : médicaments, hépatite virale/parasitaire, autoimmun,
carcinome, cirrhose biliaire primitive, septicémie, cholestase gravidique
\- extra-hépatique lithiase cholédoque, cancer pancréas, pancréatite chronique
, cholangite sclérosante, sténose/carcinome des voies biliaires
----------------- -------------------- ---------------------------------------------------------------------------
## Cirrhose
- IHC: TP, facteur V, dosage albumine (ou EPS)
- inflammatoire : bloc β-γ, augmentation α2 globuline
- score Child-Pugh (ascite, encéphalopathie, albuminméue,
bilirubinémie, TP)
## Dépistage carcinome hépatocellulaire
αfoetoproténie = suivi et non iagnostic. régérénration des hépatocyttes
## Grossesse
- Physiologique : diminution albuminémie possible, augmenation PAL
- cholestase gravidique : prurit, augmenation acide biliarie sérique :
10-40 modéré,, sérève si \> 40
- ALAT = 2-10N \>\> ictère 10%, bili augmentée et γGt
No/augmentée: 30%, stéatorrhéie (déficit en vitamine K visible
sur TP)
# Fonction intestinale [[bonnefont]{.smallcaps}]{.tag tag-name="bonnefont"} {#fonction-intestinale}
## Calprotectine fécale
- Présence : polynucléaire neutrophique, macrophages, certaines
cellules épithéliales des muqueuses
- Proportionnel à l'\*inflammation de la muqueuse\*
Algorithme :
- \< 50μg/g : pas d'inflammation, trouble fonctionnel
- 50-150μg/g : zone grise
- \> 150μg/g : inflammation
## Tests respiratoire
- Mesure hydrogène/méthanase après une fermentation anaérobie
intestinale
- Contexte :
- intolérance aux glucides : non absorbé dans le grêle donc
fermentation (retardée)
- pullulation microbienne : fermentation précoce
## Stéatorrhée, élastate, acitivté chymotrypsique fécale
Stéatorrhée : \> 7g/27
- défaut d'absorption (coeliaque, MICI) -\> acides gras à la
microscopie
- défaut de digestion (insuffisance pancréatique exocrine...) -\>
triglycéride à chaînes longues
Élastase fécale : témoin de l'insuffisance pancréatique : sévère si
\< 50μg/g
## Ionogramme fécal
- augmentation débit Na^+^ ou K^+^: diarrhée hydroélectrolytique
- trou osmolaire
- \< 50mOsmol/L : diarrhée sécrétoire (colite microsocpie,
viopem...)
- \> 125 50mOsmol/L : diarrhée osmotique (laxatif...) ou
malabsorption glucidique (déficit en lactase...)
- normal : diarrhée motrice, pathologie mixte
## Clairance fécale de l'αantitrypsine
- Fuite intestinale physiolique de protéine. Si augmenté: entéropathie
exusidatione, souvent associée à des maladies érosive (MICI), non
érosive (coeliaque), (hypo)
- αantitrypsine: inhibe l'activité catalytique de sérines protéases.
Marqueur de fuite protéique intestinale
- Interprétation :
- oedème ou hypoprotidémie avec hypoalbuminémie et
hypogammaglobulinémie non explique par
dénutrition/protéinurie/syndrome inflammatoire -\> la clairance
de
l'*α**x* − *a**n**t**i**t**r**y**p**s**i**n**e**d**i**a**g**n**o**s**t**i**q**u**e**u**n**e**g**a**s**t**r**o**e**n**t**é**r**o**p**a**t**h**i**e**e**x**s**u**d**a**t**i**v**e*
# Interprétation
## Protéines
source <https://www.memobio.fr/html/immu/im_el_pr.html> DIMINUTIONS
PROTEINES TOTALES
- Défaut d'apport alimentaire : malnutrition, kwashiorkor
- Défaut d'absorption : insuffisance pancréatique
- Défaut de synthèse hépatique : insuffisance hépato-cellulaire,
inflammation aiguë sévère, subaiguë ou chronique
- Fuite de protéines : hémorragie, fuite urinaire, fuite digestive
(entérocolite, maladie de Crohn), fuite cutanée (brûlure)
AUGMENTATIONS
- Déshydratation extracellulaire : cf hydro-électrolytique
```{=html}
<!-- -->
```
- Hypergammaglobulinémie
- polyclonale : parasitose, maladies auto-immunes (LES, hépatite
auto-immune), sarcoïdose, purpura hypergammaglobulinémique
- m
## Kaliémie
### Hyperkaliémie
- excès d'apport (rare)
- transfert IC -\> EC :
- acidoe métabolique à trou anionique normale
- hyperosmolarité
- destruction tissulaire aigùe massive
- exercice physique
- β-bloquant, digitalique, again α-adrénergique
- diminution excrétion rénale
### Hypo
- carence apport (exceptionnelle)
- transfert EC -\> IC
- alcalose métabolique/respiratoire (entrée K+ en échange de
proton reglaré par les tampons)
- insuline
- β-adrénergique : stress, sablutamole
- stimulation hématopo̤è,se : vitamine B~12~, acide folique, anémie
mégaloblastique
- perte :
- rénale (fuite urinaire K\^+):
- HTA : hyperaldstéronésmie (activation SRAA, adénome
surrénale), hyperminéralocorticisme (Cushing)
- HTA normale
- acidose tubulaire rénale, acidocétose métabolique
- alcalose métaboli: diurétique thiazidique/anse
(chlorurie élevée), vomissement abondant (chlorurie
basse)
- digestives (kaliurèse adaptée = diminuées) : diarrhée
aigüe/chroniqu
## Ferritine
- HFE
- Syndrome métabolique
- cytolyse hépatique (hépatite aigïue) : augmentation CST
- syndrome inflammation (fe sérique et CST diminué)
- alcoolisme chronique
- surchrage fer
- cytolyse msculaire (cardiqaue/périph)
## Liquide d'ascite
Si inflammation, protéines passent la membrane -\> doit diminuer avec la
diminution de l'inflammation TG: suivi post-op pour chylotorax
(accumulation de lymphe) afin de suivre également le réatbilssement
# Lipides
Valeur normales :
- triglycéride \< 1.5g/L (ou 1.7 mmol/L)
- LDL (calculé mais valable si TG \< 3.4 g/L ou 3.9mmol/L): selon les
facteur de risque : \< 2.20g/L (5.7 mmol/L si 0)
- HDL : protecteur si \> 0.60g/L
# Natrémie
Osmolalité = \$2 × \[*N**A*^+^\] + \[Gly\] ≈ 285 \$ mOsm/kg d'eau
## Déshydratation extracellulaire = perte de sodium
Pure si iso-osmolaire (l'eau \"suit\")
Étiologie :
- perte extrarénale : bonne réponse du rein donc oligurie, natriurièse
effondrée, urines concentrées
- perte rénale : pas de réponse du rein donc diurièse normale,
natriurièse élevée, urines non concentrées
## Hyperhydratation extracellulaire = excès de sodium
Iso-osmolaire (l'eau \"suit\")
Étiologies : insuffisance cardiaque, cirrhose ascitique, syndrome
néphrotique surtout
## Déshydratation intracellulaire = perte d'eau
Donc hyperosmolalité plasmatique avec appel d'eau intra-cellulaire
Étiologie :
- hypernatrémie =
- déficit en eau seul (DIC) =
- perte extra-rénale en eau =
- perte rénale en eau = diabète insipide
- déficit en eau \> déficit en sodium (DIC + DEC) =
- natriurèse adaptée (basse): sueurs, pertes digestives
- natriurèse inadaptée (normale): diurèse osmotique
- gain eau \> gain sodium = apport excessif NaCl
- natrémie normale mais soluté osmotiquement actif : mannitole,
éthylène glycol... -\> \"trou anionique\" entre osmolalité mesurée
et calculée
## Hyperhydratation intracellulaire = excès d'eau
1. Éliminer ****fausse**** hyponatrémie
- hyperprotidémie et hyperlipidémie (dilution)
- hypertonique : hyperglycémie important, méthanol, éthanol
2. Hypoosmolaire = hyponatrémie vraie
- osmolalité urinaire diminué : apport augmenté (polydipsie,
apport faible en solutié)
- osmolalité urinaire augmenté : extracellulaire
- diminué : déficit sodium \> déficit eau
- natriurièse adaptée (diminuée) : perte cutanées,
digestive, 3e secteur
- natriurièse inadaptée (augmentée) : perte rénale :
diurétique, insuffisance surrénale..
- normal : excès d'eau : SIADH++, hypothyroïdie,
hypocortisolisme
- augmenté : excès d'eau \> excès sodium : insuffisance
cardiaque, cirrhose hépatique, syndrome néphrotique,
insuffisance rénale
## Traitement
- HEC: gain de sodium (isoosmolaire) -\> éliminer le sel (apport ou
diurétique)
- DEC: perte de sodium (et d'eau car isomolaire) -\> apport sel (oral
ou IV isotonique)
- DIC : perte en eau
- pure -\> apport oral d'oeau (pas d'IV)
- global (perte en perte et sodium) -\> soluté hypoosmolaire
- avec HIC (perte en eau et gain sodium) -\> hypotonique +
diurétique
- HIC : excès d'eau -\> restriction hydrique et
- si DEC (excès d'eau, perte de sodium) -\> soluté isoosmolaire
- si HIC (excès d'eau et sodium) -\> restriction sodée
# Phosphatales alcalines
## Naissance
Très répandues dans les tissus.
## Vie
Libérées dans le sang lors de l\'altération de la membrane cellulaire
## Mort
## Effet
Permet le passage de métabolite à travers les membranes cellulaires
(catalyse l\'hydrolyse d\'esters monophosphorique en libérant du
phosphate)
## Indication
- Maladies hépato-biliaire cholestatiques
- Malades osseuses avec régénération ostéoblastiques
- Grossesse avec cholestase gravidique
- Certaines pathologise intestinales, suivi de certains cancers
## Dosage
# Phosphocalcique [[bonnefont]{.smallcaps}]{.tag tag-name="bonnefont"} {#phosphocalcique}
## Intérêt (Guyton)
Régulation fine calcémie
- contraction musculaire (squelettique, cardiaque, muscle lisse)
- coagulation
- transmission nerveuse
Hypocalcémie= hyperexcitation (tétanie, épilepsie) car augmentation la
perméabilité membrane neuronale au sodium Hypercalcémie= hypoexcitation,
## Calcium
### Métabolisme calcium
99% squelette
Calcémie totale =
- no diffusible (40%) liée aux protéines (surtout albumine)
- diffusible = calcium ionisé (50%) \[=biologiquement active\] +
calcium complexé (10%) \[sels de phosphate, oxalate, citatre,
bicarbonate\]
*NB: calcémie diminue avec le pH* Rénal: Ca^2+^ et calciul soluble no
ionié est filtré mais la quasi-totalité est réabsorbé
![](../images/biochimie/calcium.png "calcium"){#calcium}
### Régulation
PTH = hypercalcémiant
- stimulée par le phosphate
- inhibée par le calcitriol
```{=org}
#+name: PTH
```
![](../images/biochimie/pth.png) Vitamine D = hypercalcémiant
- absorption intestinale
- résorption osseuses
- rétroncontrôle négatif PTH
![](../images/biochimie/vitaminD.png "vitamine D"){#vitamine D}
calcitonine = effet opposé PTH mais moindre
### Résumé
1. Os = 1ere ligne de défense via des sels de calcium dans les os
(0.5-1%)
- hypercalcémie -\> dépôts de ces sels
- hypocalcémie -\> asbsorption 50% de l'excès de calcium peut être
absorbé en 70%
Mitochondriea (foie, intestant) = tampon additional
2. Hormonal : diminution PTH dans 3min après hypercalcémie,
augmentation calcitonine
## Phosphore
### Métabolisme
85% os Le phosphore sanguin = 90 hématies. Dans le plasma :
- organique (15%) = phospholipides
- minérale = ions de l'acide orthophosphorique
Élimination selles et surtout dans les urines (réabsorbtion partielle
dans le tubule proximal) Régulation = équilibre absorption intestninale,
réabsorbtion rénale, échange os \<-\> extracellulaire
- FGF-23 = augmente excrétunio urinaire
- diminue réabsorbtion rénale
- synthèse calcitriol
- stimule inactivation calcitriol, 25-OH-D
## Magnésium
nécessaire à la sécrétion de PTH par parathyroïde
## Dosage
référence = calcium ionisé mais augmenté si acidose, diminué si
hypophosphatémie
- Hypo/hypercalciméie : dosier calcémie, et phosphate
- fragilité osseuse/lithiases rénale/néphrocalcinose : calcémie,
phosphatémie, créatininémie, PTH, 25OH vitamine D, calciurie 24h
### Calcémie
- à jeun
- très sensible à l'albumine : plusieurs formules (imparfaites)
- corrigé = total + 0.02 × (4\*-albuminémie) si albuminémie \<
40g/L
- liaison Ca^2+^ - albumine fortement dépendant du pH
(proportionnel)
### Calciurie
- à adapter selon le poids, apport (alimentaire + médicament)
- plus élevée chez femmes ménoposée
### Calcium/créat urinaire
= dégradationosseuse
### Phosphate
0.80-1.45mmol/L chez l'adulte hémolyse = augmentation phosphotaes (GR
riches en phosphase)
Capacité du rein à réabsorber le phosphate
- Taux de réabsorption du phosphate = 1 -
`\frac{phosphaturie \times créatininémie}{phosphatémie \times créatininurie}`{=latex})
- TmP/DFG = seuil maximum de rabosorption du phosphate -\> calculé à
partir du TRP, phosphatémie et abaque
### PTH
immunoenzymatique. ne dose pas la PTHrp
### Vitamine D
- 25OHD =routine
- 1,2)OH~2~ D = difficulie, 2e indication
## Pathologies
### Parathyroïde
1. Hyperparathyroïdie primaire
- Production inappropriée PTH.
- Fréquent, surtout féminin, asymptomatique/aspécifique
- Étiologies : adénome(s) parathyroïdes, hyperplasie autonomisée
des 4 glandes parathyroïde, carcinome parathyroïdien (rare), NEM
(1 surtout, 2)
- Diagnostic = biologique +/- scinti/échographie
- hypercalcémie, hypercalciuire
- +/- hypophosphatémie
- 1,25(OH)2 D + marqueur remodelage ossex
- attention: PTH peut être normale haute. On peur avoir une HPP
normocalcémique
- Diagnostic différentiel = hypercalcémie-hypocalciurie familiale
bénignie (*CaSR*, *AP2S1*, *GNA11*) : hypocalciurie relative
- Traitement : chirurgical mais non systémiatique
2. (Pseudo)Hypoparathyroïdie
- Hypoparathyroïdie = défaut synthèse PTH avec hypocalcémie, PTH
basse/normale basse, phosphatémie haute/normale haut, calciurie
le plus souven normale
- Pseudo-hypoparathyroïdie = résistance = hypocalcémie,
hyperphospatméie mais PTH élevée
- microdel chr22 (di george), chirirguie, hypomangésémie
chronique
### AVitamine D
Surcharge
- intox vitamine D = très rares mais sévère. Génère hypercalcémie, que
le rein essaye de compenser en augmentant la calciurie.
L'hypercalcémie apparaït qand le rein est débordé 25OHd \> 150ng/mL
- granulomatose (sarcoïdose): les cellulels du granulome (=
macrophages + descendants) peuvent hydroxyler la 25OHD circulante et
relarger la 1,25OH2D
- hypercalcémie, PTH basse, hypercalciurie, 25OHD normale et
1,25OHd élevé, enzyme de conversion angiotensine élevée
- hypersensibilité vitamine D : récessive, *CYP24A1*
Carence = rachitismie, ostémalacie
- défaut d'absorption calcium, phosphore -\> hypercalcémie avec
augmentation PTH -\> calcium normal mais tensadance à
hypophosphatémie -\> défaut de minéralisation avec élévation PAL
Également, stimulation production éranle de 1,25OHD2, mais s'arrête
quand il n'y a plus de 25OHD -\> grave !
- alimntation très riche en fibres /phytate (inhibe absorption
intestinale calcium !!)
- situation de résisstance : type 1, 2, 3
### Hyperparathyroïde secondaier IRC
- PTH élevée, hyperphosatémie, hypocalcémie, déficit calcitriol
- Mécanisme : IRC -\>
- diminution synthèse rénale calcitriol
- dimination absorption intestinale phosphate + calcium
- rétentation phosphates -\> aumentation FGGH23 -\> augmente
excrétion urinaire phosphate + diminution synthèse réranle
calcitriol (cf supra)
### trouble réabsorbtion rénale duphosphate : diabète phosphaté
hypophosphatémie, calcémie normale
- rachitisme héréditaire hypophoshatémique = fuite rénale de phosphate
(Tmp/DFG bas) avec PTH normale / légèmenet élevée. Déficite relative
en calcitriol qui aggrave hypophosahtémie
- ostémolacalie tumorale hypophosathméique = production FGh23 par
dtumeux mésenchymateusebénignise : cf supra pour la biologie avec
1,25OH2D normale/basse donc inadaptée
### tumorale
sécrétion d'une substance analogue PTH = pepite apparénté PTH -\> se
fixe sur les récepteur PTHR1 et induit effet biochimique PTH -\>
diminution PTH
# PTH
## Effet
- libéraction de calcium à partir de l'os (ostéoclastes)
- réabsorbtion rénale calcium
- via la vitamine D : absorption intestinale
# Vitamine D
## Naissance
2 sources
- synthèse à partir des rayonnements UV sur la peau et d'un stéroïde
- alimentation (vitamine D2 \[végétal\] et D3 \[animal\])
## Vie
1. Accumulation dans le foie
2. première hydroxylation conduit à 25-OH-vitamine D (calcidiol).
3. Transport via le sang dans le rein puis une seconde hydroxylation
rein conduit à 1,25-dihydroxy vitamine D (calcitriol = forme active
de la vitamine D)
Le calcidiol est peu controlé mais la seconde est régulée par la PTH et
phosphatémie :
- augmenté par PTH, hypophosphatémie, hypocalcémie (via PTH)
- inhibé par hyperphosphatémie, hypercalcémie
![](../images/biochimie/vitaminD.png "vitamine D"){#vitamine D}
## Mort
Dégradation par oxidation/hydroxylation et excrétion dans les
urines/selles
## Effet
Calcitriol:
- stimule l\'absorbtion intestinale du calcium et phosphose
- os: favorise la minéralisation (en augmentant la calcémie)
- rein : stimule la réabsorption tubulaire du phosphore et calcium
- diminue PTH
## Indication
- 25-hydroxy-D = forme circulante prépondérante. Reflète les réserve
-\> dosé si possibilité de carenc
- 1,25-dihydroxy-vitamine D (calcitriol) = ne reflète **pas** les
stock : réservé à une anomalie de 1-α hydroxylation
## Dosage
# Hyperammoniémie - cycle de l\'urée
## Ammionac: Généralités
- 2 formes : NH~3~ (gaz), NH~4~^+^ (majoritaire)
- Hautement toxique en excès -\> élimination sous formne d\'urée
## Ammionac : Fonction
- source de nitrogène pour la synthèse des protéines + composés
essentiels
- maintien du pH
## Ammionac : Production
- Intestin : digestion des protéine + désamination
- Rein : excrété dans les urine / sang (désamination de glutamine)
Dégradation des acides aminés (pour énergie ou stockage sous forme de
graisse/glycogène) -\> désamination dans le foie
Transamination : le groupe amine est transféré vers l\'acide
α-ketaglutarique qui devient l\'acide glutamique
![](../images/biochimie/transamination.png)
L\'acide glutamique peut transférer son groupe amine également ou le
largue sous forme d\'ammoniac NH~3~
## Ammionaque : Vie
Introduit dans les acides aminés par la glutamine synthetase ou
glutamate dehydrogenase Sous forme de glutamine, va être transporté dans
le sang Glutamate + ATP + NH3 = glutamine + ADP+ P Principal moyen
d\'échanger des groupes amines entre les différents organes
## Ammionaque : Vie : pH
Tubule collecteur : H^+^ sécrété va se combiner à NH~3~ pour excréter
ion ammoniaque. Un ion biocarbonate va retourner dans le sang
![](../images/biochimie/tampon-ammoniaque.png)
Acide : augmentnation de la sécrétion d\'ion ammoniaque
## Ammionaque : Mort
1. Extra-hépatique : Formation de glutamine : ammonia + glutamate -\>
glutamine (enzyme = glutamine synthetase) qui sera transportée dans
le foie Note: dans le cerveau, pas de formation d\'urée donc c\'est
le même mécanisme !
2. Intra-hépatique : cycle de l\'urée = converti en urée
## Ammionaque : Mort : cycle de l\'urée
![](../images/biochimie/cycle-uree.png)
Mitochondrie foie : ammoniac + bicarbonate catalés par cPS1
(carbamylphosphate synthase 1) (Celle-ci provient du glutamate +
acetylco) Le produit est transformé en citrulline avec l\'ornithine
Dans le cytosole hépatique : convertin en acide aminé (arginine)o à
l\'aide de 2 cataliste : ASS1 (argininosuccinate synthase 1) et ASL
(argininonsuccinate lyase)
Arginine est clivée en urée et ornithine et regénère ornithine qui
permet de redémarrer le cycle
## Ammionaque : Clinique
Cycle de l\'Urée = fondamental pour garder ammoniémie basse
Détoxication impactée si cirrhose, IRA, shunt portal... -\> accumulation
toxique -\> encéphalopathie hépatique (trouble neuropsy + coma)
symptômes non spécifiques en période néonatale : mauvaise alimentation,
vomissements, somnolence, irritabilité, tachypnée
Partiel : mmois ou des années après la naissance et est souvent
déclenchée par une maladie ou un stress catabolique.
- perte d\'appétit, des vomissements cycliques, une léthargie ou des
anomalies comportementales
- tendance à éviter spontanément les protéines, en particulier les
femmes présentant un déficit en ornithine transcarbamylase (OTC)
(Scaglia et al 2002). Le r
2 premières année de vie : si prolongée, dommages irréversibles
(atrophie cérébrale, dilatation ventriculation, démyélination,
hypondensité) -\> épilepsize, troubles cognitifs important,
## Toxicité cérébrale
- entrée dans les cellules de l\'amonniac -\> modification du tampon
potassium (homéostasie électrolytique)
- Protection contre hyperammoniémie : détoxication par conversion en
glutamine
- stress osmotique -\> gonflement des astrocytes (mais n\'explique
pas tout)
- mitochondrie astrocytes : glutamine -\>~glutamate~ + ammoniac
-\> modification du pH, potentiel de mmebrane, ... modification
de nombreux transportseux production de radicaux libre etc =\>
avec modification du ca2+, effondrement du potentiel de membrane
intérieure , diminution synthèse ATP -\> perte des
mitochondrie + morts cellulaire
- cascade inflammation
- modification métabolisme mitochondrial
- perturbation du cycle de Krebs
- stimulation de glycose + inhibiton oxidation du pyrhuvate -\>
produciton de lactate dans le c-eraux
- Neurotransmission altérée :glutamine -\> désaminé en glutamate qui
va activer récepteur NMDA. Excès de glutamate -\> aptoptose
neuronale.
- modification neurotransimssion GACAergique
## Maladies congénitales : cycle de l\'urée
Une des 6 enzyme ou 2 transporteux défectueux -\> accumulation
Néonataal : pas d\'activité enzymatique (ou très faible)
- symptômes à 24h de vie
- impact cognitif, comportemental important
Plus tardif : activité résiduelle
- déclenché par catabolisme protéqiue, IR, augmentation d\'ammoniac
(sport, maladie, sepsis...)
taux de mortalité importante par encéphaloapathie
### Déficit CPS1
AR, 1/1 300 000 Non traité : encéphalopathie, épilepsie, coma, décès Bio
: hyperammoniémie + glutamine, diminution citruliline + arginine
(logique)
### Déficit NAAGS
AR \> 1/3 500 000 Seul à être traité Bio : hyperammoniémie + glutamine +
glutamate, diminution citrulline (logique) Non traité : détérioration
neuro heures/mois
### Déficit OTC
Le plus fréquent 1/56 500 transmission liée à l\'X !! oedème cérébrale,
épilespsie, coma Plus grave chez homme (variable chez femme) Bio :
hyperammoniémie + glutamine + alanine, diminution citrulline (logique)
troubles cogniif
### Déficit ASS1
clinique variable (parfois asymptomatique force tardive) Arginine
diminuée, citrulline augmentée plasma et urine et acide orotique dans
les urines (diminution activité onithine transcarbamylase ?)
### Déficit transport citrin
AR 3 formes
1. néonatale : cholestase intrahépatique,
2. Adulte : hyperamméniomé récurrente (début brutal adulte)
3. enfant : dyslipidémie, troubles croissance Bio : hyperammoniémie et
citrulline
Clinique : neuropsy, délire, coma
### ASL
après 24h forme néonat : létharie, convulsion, coma, mort 2e plus
fréquent toruble de l\'urée : 1/70 0000.AR Acide argininosuccinique
élevé dans les urine + ammoniaque et citrulline augmenté
### Arginase 1
1/950 0000 Arginine augmentée, psasticité, régression mentale + moteur,
épilepsie
Si hyperammoniméie : atxaie
### ORNT1
Triple H (hyperonirthinémie-hyperammonémie-homocitrullinurie)
accumulation cytoplastimce ornithine + lysine Bio : hyperammoniméie
+ronthinie + homocitrulline dans les urine
## Maladie congénitale : acidurie organique
\> 65 maladies, AR 1/3 000
Néonat: décompensation métabolique = grave+++ vomissement, convulsion,
léthargie, hypotonie, acidose métabolique, lactate, kétonurie,
hypoglycémie
Bloc métabloique -\> accumulation d\'acide organieque dans les
tissus/fluides. Ex
- acide propionique
- acide méthylmalonique
- acide isovalérique
Hyperammonémie = souvent dans les fornme classique. Lié à une
modification des cycles de krbes et de l\'urée ? Déficit en carnitine
qui accompagne ces maladies ?
## Oxidation des acides gras
a lieu dans les mitochondries, essential pour fournir de l\'énergie
quand il n\'y a pas de glucose AR 1/9000 Clinique variable, SNC souvent
affecté (hypoglycémie/hyperammoniémie)
Acide gras insuffisament utilisés Hypermamménion = très souvent
retrouvé, not. chez patients avec hypoglycémie, encéphaloathie,
insuffisance hépatique
## Dosage
Photométrie Interférence : hémolyse, pyruvate Pré-analytique : tube
vert, glace
## Traitement
- dialyse
- si rein rormal : \"scavenger\" (sodium benzoate, sodium
phenylacetate...) SP = augmente crxtrétuion rénale de glutamine
- supplémentation selon cause : arginine (CPS1, ...), citrulline
[Équilibre acido-basique](202404301046-%C3%89quilibreacido-basique.md)
[Acides aminés](202404301047-Acidesamin%C3%A9s.md)
[Acides biliaires](202404301049-Acidesbiliaires.md)
[Albumine](202404301050-Albumine.md)
---
title: Biochimie
tags: medecine biochimie
---
+++
title = "Virologie"
date = 2023-08-01
+++
# Clinique
## Uvéite
HSV chez l'enfant
## Pneumopathie
Expectoration plus rentable que LAB
## Péricardite
cause virales
- **entérovirus** surtout
- CMV, EBV, HHV6
- +/- parvovirus B19 mais discuté car 75%
## Hépatite
Parentérale : B,D,C féco-oral : A, E Bilan séro EBV, CMV **pas** PCR
# Virus
Oncogénicité : si virus pousse pour la phase S (donc pas si apport
polymérase par le virus+++)
## Adénovirus
- Spectre étendu d'infection aigüe
- Persistance possible intestin (asymptomatique) -\> si
immunodépression, sympto
- très fréquent en population générale : pas de diag virologique !
- résistant dans l'environnement, transmission souvent manuportée +/-
épidémie nosocomiale
- Diag: PCR
- Transplanté (receveur CSH en pédia): infection sévère -\> suivi des
réaction dans les selles
- test antigénique (gastro-entérite): ne détectent pas toutes les
espèces
- ttt = ténofovir
- y penser si cystite hémorragique chez greffé rénal
## Anelloviridae (adn)
- virus nu, ADN circulaire simple brin, polarité négative
- forte prévalence population générale
- nombreux fluides biologiques et tissus
- non pathogène pour humain
- potientiel biomarqueur immunitaire chez patients transplantés
## Arboviroses
## BK
- Latence rein/urothelium
- Néphropathies chez transplanté rénal -\> tester urine : risque si
**\> 7 log**
- risque virémie puis fibrose
- Cystite hémorragique chez allogreffé
- Suivi : PCR urine/plasma/sang total
- Ttt : diminuer immunosuppression
## CMV
100% afrique, 50% france
- tout organe peut être touché
- nombreuses stratégies pour échapper au système immunitaire
- infection latente à vie (ttt antiviral inefficaces)
- virose opportunistes
- primo/réactivation = bénigne si immunocompétent
- sévère chez immunodéprime =\> surveillance
- **infection congénitale virale la plus répandue**
- si primo chez mère
- ou réactivation/infection autre souche
- diagnostic + surveillance : PCR
- ttt : valganciclovir
Définition:
- maladie à CMV = test CMV+ et symptomatique =\> ttt curatif
- infection à CMV = test CMV+ et asymptomatique =\> ttt anticipé
Stades
1. Primoinfection : symptomatique ou non, disséminaton hématogène
2. Latence/persistence : pas de réplication virale et persistance dans
les monocytes, macrophages, cellules endotéliales
3. Récurrence : gravité selon status immunitaire : atteinte tissulaire
si VIH, transplantation+++ Asymptomatique sinon
Femme enceinte : Note
- greffe : rique si solide : CMV- recoit CMV+ ou réactivation receveur
=\> primo infection, pneumopathie
- VIH : récurrence CMV (rétinien, digestique, pulmonaire+++)
Traitement: ganciclovir (ou prodrogue valganciclovir)
Pas de grosse concentration dans le sang (3-4log)
### Diagnostic
- Primoinfection postnatale : IgM, IgG +/- CMV
- Foetus : PCR CMV liquide amniotique
- Congénitale : PCR urine/salive pour distinguer d'une inféction
périnalae (sans conséquence mais excrétion virale J21)
- Surveillance immunodéprimé : VIH+ et lymphocytes T CD4 \< 100/mm^3^
- fond d'oeil si positive ! (choriorétinine)
- atteinte SNC: PCR LCS
- digestive: biopsie digestive
## Dengue
- zone tropicale/substropicale
- La plus fréquente (flavirius)
### Clinique
- si arthralgie, possible rash associé
- TODO:
### traitement
symptomatique
## EBV (ADN)
- Infection lytique et latente
- ubiquitaire, transmis voie salivaire
- \> 95% adultes
- immortale et induit prolifération lymphocytes B
- latence: 4 profiles d'expression cancers EBV: a minima expression
EBNA
Adulte et \> 4 log
- lymphome Burkitt (cellules B) chez enfant afrique
- lymphmoe Hogdkin
- cancer nasopharynx
- VIH : lymphome non hodgkinien (malin), **post-greffe : syndrome
lymphoprolifératif**, MNI
Stades
1. Primoinfection : symptomatique ou non, dans muqueues oropharynix
(cellules épithéliales et lymphocytes B). disséminaton hématogène
2. Latence/persistence : pas de réplication virale et persistance dans
les lymphocytes B mémoire
3. Récuerrence : gravité selon status immunitaire : atteinte tissulaire
si VIH, transplantation+++ Asymptomatique sinon
Diagnostic : Traitement: rituximab (anti CD20)
### Validation
IgM + sans IgG : immunodépression ?
## Encéphalite japonaise
Très peu de cas par voyageur : vaccination si \> 3 semaine en zone
rurale
## HHV6/7
- Infection chronique persistante
- Quasi totalité population
- Intégration chomosomique 1% population et transmis cellules
germinale
- Infection : lymphocytes T, monocyte, macrophages, cellules gliales
SNC, hématopoétique
- Infection activation (primo/réactivation): asympto/bénin (exantème
subit = primo HHV6)
- Encéphalite possible, surtout immunodéprimé
- Rôle débatut pour SEP, myocardities, SIDA+++
- Diagnostic : PCR (attention iciHHV6, suspecté si 6log -\>
**confirmation bulbe de cheveux**)
- Ttt gaciclovir+++
- DRESS: V7
- ID: réactivation: syndrome pseudogrippal +/- défaillance d'organe
Clinique
- Exanthème subit/roséole infantile
- réactivation si dRESS (toxidermie grave)
- fièvre, convulsion, infection respiratoire/digestive, syndrome
mononucléosique
## HHV8
## HPV
- HPV à haut risque : cancer col utérus, majorité cancers anaux, une
partie des cancers anogénitaux et oropharynx
- infection col utérin = très fréquente (surtout avant 30 ans) mais
transitoire dans la majorité des cas -\> ne pas traiter en l'absence
de virus !
- pas d'infection persistante par un HPV haut risque : risque
quasi-nul de cancer de col de l'utérus
- persistance de l'infection et risque de progression supérieurs si
infection par HPV16
- recherche HVP haut risque = plus sensible que cyto pour détecter le
slésions de haut grade au niveau du col utérin.
- choix de la méthoed biomol = selon recos internationales
- vaccin prophylactique = protège contre la majorité des cancers
attribuables aux HPV
### Algorithme
- 25-30 ans = cyto seule (sinon on détecterait trop de HPV car pic à
l'activité sexuelle)
- \> 30ans : PCR
- positive -\> cyto: si anomalie, colposcopie, sinon test à 1 an
### PCR
rendue positive si \> seuil détection et \> seuil clinique
### Prévalence
- HPV16~~+~~ quelque soit le cancer
- HPV18 cancer col utérus
### Génotype
3 tests possibles
- détection HPV sans génotype
- 16 et 18
- 16, 18, 45 autres
- HPV
## HSV (adn)
- Dermotrope et neurotrope
- Phase latente : persiste à vie dans les ganqlions nerveaux
sensitifs.
- Réactivation de fréquence variable +/- clinique
- Phase latente : antiviraux inefficaces =\> éradication impossible
- Formes grave chez nouveau-né, nourisson eczémateux, immunodéprimé
**ou** oeil, encéphale, fois
- Diagnostic:
- autres cas : PCR = la plus utilisé mais ne signifie pas qu'il y
a du virus infectieux+++
- méningoencéphalite herpétique = PCR sur LCS
-
- TTT : aciclovir. Si forme grave, instaurer en probabiliste
Intubé \> 5log = possible implication
## HTLV
Clinique
- leucémie à cellules T
- paraparésie spastique tropicale = neuromyélopathie chronique
40-55ans
Transmission mère-enfant (**allaitement**)
## JC virus
Immunodépression : leucoencéphalopathie mulitofocale progressive (LEMP)
= foyers de démyélinisation -\> y penser si VIH avec déficit CD4+
- patients VIH ou immunosuppreuse
- Pas de traitement
- évolution généralement fatale
## Polyomavirus: BK, JC, MC, TS
- Ubiquitaire
- Pouvoir pathègen seulement chez immunodéprimé
- BK: attente rénale et vésicales chez les transplantés
- JC : LEMP si immunodéprimé
- MC: carcinome neuroendocrite des cellules de Merkel (âgé ou
immunodéprimé)
- TS: dysplasie sévère des follicules pileux chez les
immunodéprimés
- Pas de traitement antiviral -\> restauration immune ou diminution de
l'immunosuppression
## Parvovirus
- tropisme précurseurs médullaire lignée érythroïde
- précoce : anémie, crise érythroblastopénie aigüe. 2eme phase =
production anticorps (éruption, arthralgie)
- mégalérythème épidémique, arthralgique -\> diag clinique
- sauf si compliqué ou contact femme enceinte
- anomalie constitutive globule rouge -\> crise aigüe -\> transfusion
culots
- immunodépréssion : anémie chronique -\> Ig polyvalente
- foetus: anémie profonde + myoc'ardite virale +/- anasarque
foetaplacentaire -\> transfusion pour éviter mort in utero
### Physiopatho
- Moelle osseuse -\> infection + lyse des précurseurs érythroïdes -\>
**anémie centrale**
### Clinique
- Bénigne che l'enfant
- **Grave** si **anomalie globule, rouge, immunodéprimé foetus**
- Enfant: mégalérythème épidémique (5eme maladie)
- Atteinte cardiaque
- Adulte (30%): polyarthralgie bilatérale symétrique extrémité
- Atteinte érythroblastes: problème si diminution de la vie des
globules rouges car l'érythropoièse ne compense plus l'hémolyse
périphérise
- anomalie de l'hémoglobine : drépanocytose, thalassémie
- protéine membrane : sphérocytose , Minkowski-Chauffard
- métabolisem G6PD =
-\> crise (anémie brutale et profonde) mais transifoire
- **Attention femme enceinte** ! GR immatures
- mort foetale
- anasarque (lyse GR = modification pression osmotique)
## Prévalence
- EBV, HHV6, VZV 95%
- HSV2 60-80%
- CMV 50% (plus dans les pays du sud)
- HSV1 10-50
- HHV8 \< 10
## Puumala
- Clinique
- Fièvre hémorragique avec insuffisance rénale
- +/- myopie transitoire
- Géographie \~ forêts : pays nordiques, Franche-Comte et
Champagne-Ardennes
- Fait partie des Hanta virus
- Transmission par les excréments des rats
## VCH
Charge virale: augmente vite et fort mais diminue à 0 sous traitement
### Traitement
2 antiviraux d\'action directe (ex: sofosbuvir + veplatasvir)
## VHA (arn)
- petite taille, ARN simple brin, polarité positive
- excrété sous forme nue dans les selles mais circule dans le sang
sous forme quasi enveloppé
- multiplication dans les hépatocytes (sans effet cytopathique)
- Lésions résultatns des réponses immuntaires (inné et adaptative) de
l'hôte qui détruisent les hépatocytes affectés
- maladie aigüe fréquente
- diagnostic : IgM spécifique
- clinique selon âge : asympto avant 5 ans, le plus souvent
symptomatique après
- **pas d'infection chronique**
- vaccin (qui peut servir de prophylaxie avant et après exposition)
- risque épidémique dans population âgée par amélioration condition
d'hygiène, diminution circulation et baisse séroprévalence
(paradoxal !)
### Notes
- Trasmission: hautement résistant + écrétion dans les selles
- risque : hygiène précaire, traitement eaux usé inefficace
- proximité VHA
- HSH
- zone d'endémie
- Clinique
- 4 semaine incubation
- prodrome pseudogripal
- état: hépatite bioloqique : asymptomatique chez l'enfant,
bruyant adulte, rare hépatite fulminante
- attention à la prise de paracétamol
- **pas de portage chronique**
- Diagnostic = sérologie : **IgM antiVHA seulement si hépatite
aigùe**, IgG antiVHA = passé ou vaccination
- **Déclaration obligatoire**
- Vaccin + rappel = protection à vie
## VHB (adn)
- enveloppé ADn circulaire partiellement bicaténaire et extrêmement
compact
- multiplication dans hépatocytes (pénétration via récepteur NTPC)
sans effet cytopathique
- cytolyse lié à la réponse immunitaire
- toute infection peut promouvoir le développement d'un
hépatocarcinome
- 1ere étpa : formation cccDNA inta-hépatique (persiste à vie !) +/-
intégration génome humaine (facultatif)
- multiplication virale via un intermédiaire ARN avec une
transcriptase inversée portée par la polymérase virale et
responsable de l'émergence de nombreux variants génétique
- plupart de liquides biologique avec concentation importante
- contamination: sexuelle et toxico IV (pays industrialisé),
mère-enfant -\> enfant (pays ressource limité)
- complications: asymptomatique - cytolitique sévère voire fulminante
- persistance \> 6 mois : risque hépatite chronique avec évolution
possible cirrhose/cancer foie
- dépistage AgHBs, Ac antiHBs, Ac antiHBc
- AgHBs positif : chercher coinfection VHD, sérologie HBe, charge
virale, atteinte hépatiqiue
- vaccin VHB = seule prévention possible HVB, HVD, hépatocarcinome
- traitement : IFN (interféron pégylé), analogue nucléositique mais
éliminent rarement AgHBs
### Notes
Transmission: percutané, muqueuses, salive, sécrétion vaginale.
Évolution: 10% porteur asympto ou hépatite chroniqu (+/- cirrhose/cancer
du foie)
Structure : enveloppe extérieure (Ag HBs) et nucléocapside (Ag HBc)
Charge virale: évolution en \"vague\", moins élevée que VHC. Sauf pour
infection congénital avec très fortce réplication virale asymptomatique
jusque 25-30 ans, puis réponse immunitaire (symptômes variables)
**C'est la réaction immunitaire** qui abime le foie et non la
réplication.
### Sérologie
- Ac anti Ag HBc = témoin d'une infection mais persiste après
guérison+++
- Ag HBe = en général, réplication virale active. Disparait avant Ag
HBs. Séroconversion Ag -\> Ac antBHC = résolution ou rémission
Attention: AgHBe, Ac antiHBe: utilisé seulement pour classification.
réplication. Ne pas utiliser pour distinguer infection aigüe (ex: Ac
antiHBc)
Sérologie
- Ac antiHBc: compétition. Négatif si \> 1. Sensibilité/spécificite
100%
### Cinétique des marqueurs
- Hépatite aigüe guérie : AgHBs+ 1 à 3 mois avant clinique/bio, puis
Ac antiHBc
- NB: AgHBe souvent associé à réplication virale, disparaît avant
AgHBs
- fulminante
- stade aigu : **IgM anti HBc** constant mais attention, **AgHBs
et AgHBe peuvent être négatifs**
- réaction*chimio-induite* surinfection hépatite D: ?
- hépatite chronique : AgHBs \> 6 mois, AgHBe et Ac antiHBc positif
- séroconversion (= négativation)
- HBe = négativation AgHBe et Ac-antiHBe positif = évolution
favorable
- HBs = négativation AgHBs et Ac-antiHBs = objectif ultime
- charge virale = suivi chronique car corrélé risque fibrose/cancer
foie
NB: charge virale peut être négative avec AgHBs + car il y a une
éxcrétion d'AgHBs \"vides\" par le réticulum endoplasmisque alors que
les antiviraux vont agir sur la formation \"complète\" du virus
### Interprétation
AgHBs Ac AntiHBs Ac AntiHBc Interpretation
------- ------------ ------------ -------------------------------------------
\+ \+ Infecion évolutive (récente ou chronique)
-\> IgM, évolution à 6 mois
\+ Hépatite aigüe, post vacin
faux positif
\+ Vacciné ou immunoglobuline
\+ \+ Infection guérie
\+ Faux positif, contact
hépatite aigùe, mutant AgHBs (Asie)
Pas de contact
**AcHBc isolé** =\> - IgM HBcpour différencier phase aigùe, ADN VHB et
acVCH
- possible sous traitement
- possible si réplication VHC en parallèle (notion d'équilibre)
### Traitement
**tenofovir**, (ancien: lamivudine, emtricitabine)
## VHC (arn)
- ARN simple brin de polarité positive. capside icosaédrique et
enveloppe
- hépatotrope -\> infection aiqüe e chronique
- aigüe = généralement asymptomatique et évolue vers chronocitié
dans la majorité
- chronique : activité nécrotico-inflammatoire et fibrose
hépatique (gravité variable)
- hépatite chronique = 2e cause de cirrose et de carcinome
hépatocellulaire après l'alcool. 2500 décès/an
- curable par traitement antiviral avec diminution/éradication lésions
et régression fibrose
- révolution avec nouveaux traitement sans IFN avec \> 95% efficacité
(inhibiteur de protéase+++)
- importance du dépistage
## VHD (arn)
- Virus défectif, seulement chez individus infectés par VHB. Utilise
les protéines d'enveloppe du VHB pour former les particules virales
infectieuses.
- ORF -\> 2 isoformes proténiques : la petite (s-HDAg) activate la
réplication du génome, la grande (L-HDAg) fait inhibent la
réplication
- CoinfectionVHB VHD non négligeable (10-20 millions) -\> maladie plus
sévère (aigüe et chronique)
- diagnostic : Ac anti-BHV et charge virale plasmatique
- Traitement : INF α-pégylé mais peu efficace
- vaccination VHB protège aussi contre VHD
## VHE
- Pays à ressources limités : grandes épidémies, mortalité élevée chez
femmes enceinte
- Pays industrialisés : transmission zoonotique, transfusion,
chronique chez l'ummindéprimé, formes sévère si atteinte chronique
du foie, atteinte neurologie
- Diagnostic : IgM anti-VHE (+ ARN viral sang/selles chez
l'immunodéprimé)
- Ribavirine si chronique
## VIH
Patient connu: western blot peut être négatif ! Épidémio: VIH2 = 2%
primo: objectif
- -2Log à ??
- \< 400/mm^3^
- \< 50 copies/mL à 6mois
### Diagnostic
Ac-anti VIH1 et 1 et Agp42
- négatitf: pas d'infection si exposition \> 3 semaines
- positif: western-blot
- positif: contrôle 2e prélèvement pour éviter erreur
d'identification + Déclaration Obligatoire (quand ??)
- négatif/douteux: primo-infection ? Ag p42 et ARN VIH1
- négatif = réaction non spécifique en l'absence de traitement
ou exposition VIH2
- positif = primo-infection probable
confirmation par Western blot: obligatoire pour ne pas passer à côté
d'une co-infection VIH2 !!
IgG contre
- glycoprotéine transmembranaire (gène *env*): gp160,gp120,gp41
- capside/matrice/core : p55, p24,p18 (gène *gag*)
- enzyme virale (p66, gène *pol*)
- intégrase : p34
-\> 2 bandes *env* et 1 bande *gag* pour *pol*
- Plutot précoce : glycoprotéine, p55,p24
- Plutôt tardif : p34
### Bila initial
Séro EBV, CMV
### Traitement
1 ou 2 inhibiteur nucléosidique transcriptase inverse + 1 non nuléo ou 1
intégrase
- 1ere ligne :
- dulotegravir + 2 inhibiteur nucléosidique.
- Attention: abacavir : contre indiqué HLAB\*5701 risque
d'hypersensibilité
- Sinon efavirenz - 2 INTI
- Enfant : raltégravir + 2INTi
Primo:
- objectif = diminuer contagiosité.
- Utiliser traitement avec forte barrière génétique
- Si possible, traitement par ?? pour faire chuter la charge virale
EI: tenofovir = nephrotoxique, sauf forme alafénamide daru = pb
cardio vasculaire
Note: bithérapie possible dès début. Sinon allègement avec CV
indétectable depuis 2 ans
### Résistance
Lamivudine, emtricitabine = mutation M134 V/I
- codong ATG donne soit ATA (I) sout GTA (V): le premier est plus
fréquent à cause d'APOBEC
APOBEC= enzyme qui protège des infection virale : édition ARN C-\> U
qui rend la réplication quasi-impossible. Le VIH a ViF qui désactive
cette enzyme. NB: APOBEC peut éditer le génome intégrer (peu d'effet
? contrairement à EBV)
## VZV (adn)
- Dermotrope et neurotrope
- Latence ganglion nerveux sensitifs -\> éradication impossible par le
sytème immunitaire ou antirétroviraux
- Primo = varicelle : généralisée, pendant l'enfant.
- presque toujours symptomatique.
- formes grave varicelle chez immunodéprimé = (val)aciclovir
- augmentation nombre cas au printemps
- femme enceinte: risque
- avant 20SA: risque congénital
- 3 semaines avant accouchement : néonat sévère (risque majeur
à J-5 et J+2)
- Réactivation (endogène) = zona, limité dermatome
- pas d'épidémie
- algie post-zostérienne = principale complication après 50 ans
=\> valaciclovir en prophylaxie
- vaccin ! (varicelle + zona)
## VZV (adn)
- Dermotrope et neurotrope
- Latence ganglion nerveux sensitifs -\> éradication impossible par le
sytème immunitaire ou antirétroviraux
- Primo = varicelle : généralisée, pendant l'enfant.
- presque toujours symptomatique.
- formes grave varicelle chez immunodéprimé = (val)aciclovir
- augmentation nombre cas au printemps
- femme enceinte: risque
- avant 20SA: risque congénital
- 3 semaines avant accouchement : néonat sévère (risque majeur
à J-5 et J+2)
- Réactivation (endogène) = zona, limité dermatome
- pas d'épidémie
- algie post-zostérienne = principale complication après 50 ans
=\> valaciclovir en prophylaxie
- vaccin ! (varicelle + zona)
+++
title = "Immuno-hématologie"
date = 2024-01-20
+++
# Fiches
- IgM : anticorps froid (optimum 4°), ne passent pas la barrière hématoplacentaire, agglutation spontanée, fixe le complément
- Ig : optimium 37`, peut passer la barrière hématoplacentaire
![TIA](/images/hematologie/coombs-indirect.png)
![TIA](/images/hematologie/coombs-direct.png)
- Test indirect antiglobuline (RAI): plasma patient + globules rouges connus + antiglobuline
- Test direct antiglobuline (TDA): globules rouges patient avec Ac + antiglobuline
- ABO, Lewis, P1, MN = tissulaire, glucidique, non propre à l'Homme, anticorps naturels
- RH, Duffy (FY), Kiddl, Ss : propre aux GR, Homme, proétique, pas d'anticorps naturels
- Rare : Lu (b-) (0.1% Lu (a+, b-) et exceptionnel Lu(a-,b-))
- Antigène public (>= 99.9%) : H, LU2, KEL2, LEK4
- Attention : un c+ en France est probablement D+
# Phénotypage érythrocytaire
Antigènes des groupes sanguins :
- portés par glycolipides ou glycoprotéines
Classification
1. ABO et associés = tissulaires
- GR mais pas que
- pas propres à l'homme
- naturels
- synthétisent enzymes qui vont produire les antigènes (pas de production directe par les gnes)
2. Rhésus et autres = inverse
Anticorps
- naturels = apparait spontanément, présent milieu extérieur, stimule système immunitaire
- immuns = après grossesse, transfusion, greffe incompatible
- réguliers = toujours présent si antigène absent (ex: antiA)
- irrégulier = peut être absent malgré antigène (ex anti-D)
- 1 seul échantillon, 1 seule détermination si automatique (2 techniciens si manuelle)
- Groupe sanguin = ABO, Réhus (RH2,3,4,5), KEL1
- Indications limitées : transfusion, grossesses (pour transfusion)
- Choix pour transfusion :
- toujours ABO
- protocole RH-KEL1 : femmes de la naissance à fin période procréatrice, RAI positive, hémoglobinopathie, transfusion itératives, groupe sanguin rare
- Pour un groupe valide : 2 déterminations, 2 prélèvements indépendants, étiquettage et identité stricte du patient (risque vital !!)
## Notation
Exemple pour A+ Cc ee
1. A CcDee
2. A RH 1,2,-3,4,-5 (car 1=D, 2=C, 3=E, 4=c, 5=e)
3. A+ E- (on ne rend que les négatifs)
## ABO et associé
### ABO
Le plus important des groupes.
Nature glucidique : ABO -> glycosyl transférase
- groupe A = antigène A, anticorps antiB
- groupe O = pas d'antigène A ni B, anticorps anti A et B
- Génétique: A et B co-dominant, O récessif, code pour une enzyme et non l'antigène dircetement
1 gène ABO
- allèle A et B : forte homologie, enzyme codée ont le même substrat (sustance H), codominant
- allèle A avec délétion : enzyme est inactivée
- donc
- groupe A => 1 allèle A, 0 allèle B
- groupe B => 1 allèle B, 0 allèle A
Substance du base (tous les individus) -> enzyme H (codée par gène H chez la plupart des individus)
- individu O = rien de plus
- individu A: +enzyme A
- individu B: +enzyme B
Substance H = produite par substrat H
Groupe Bombay = pas de gène H donc anticorps antiA, B et **H**
Donc
- que du H = groupe A
- que du A = groupe A1 (fort)
- majoritairement A = groupe A2 (faible)
- idem B
2 épreuves (il faut ja concordance !!)
1. antigènes A et B sur les globules rouges (mis avec sérum Ac antiA et B)
2. anticorps anti A et B dans plasma (avec hématies test A B)
Note: sous-groupe A1 et A2 mais pas d'intérêt en transfusion
#### Variants ABO
![](/images/hematologie/groupe-a.png)
A1 (80%) :
- enzyme A1 : convertit tous les antigène H en A -> *Anticorps naturel irrégulier anti-H* (dangereux si actif 37%)
- Ag A1
A2 : enzyme A2 : convertit tous les antigène H en A
- pas d'Ag A1 -> anticorps antiA1
- pas d'anticorps antiH
#### Phénotype rares
- Phénotype bombay : absence d'antigène A, B et H -> anticorps anti-A,B et H très puissant !
- phénotypes H déficient :
- non sécréteur : Bombay (h/h se/e), Bombay réunion (un peu d'antigène H)
- sécréteur (paraBombay) : AgH absent des globules rouges mais dans sécrétions
- NB: -> anticorps antiH moins puissent pour Bombay réunion ou para-Bombay
- faible expression antigène A B
- cis-AB : 2 allèles transmis comme un (d'ou le cis-)
- B(A): les hématies du sujet B peuvent être agglutinées par des anticorps anti-A. Idem pour A(B)
- acquis: B, A, perte expression partielle chez patients hémato
#### Anticorps
Attention, il y a bien 2 types d'anticorps en ABO !
- naturels : réguliers, surtout IgM, ne passent pas la barrière hémato-placentaire, 3 à 6 mois après la naissance
- immuns : irrégulier : après allo-immunisation (grosesse), hétéro (vaccins), IgG, passent la barrière hémato-placentaire
Antiènes dans le milieu extérieur (bactéries) -> immunisation
- Recherche antigène A, B (à partir d'anticorps)
- Recherche anticorps antiA, antiB (à partir hématie tests)
#### Régles
Incompatibilité :
- donner des GR à un patient ayant dans le plasma des anticorps contre cet antigène
- donner du plasma avec des anticorps à un patient qui a des antigène sur le GR
Sinon hémolyse intra-vasculaire par activation du complément
- libration des cytokines, protéines inflammatoirre -> état de choc + arrêt cardiaque
### Hh et SEse
- Gènes H et SE -> haplotypes HSE, Hse, hSE, hse
- codent pour la même enzyme mais sur des cellules différentes (H = érythroblaste, SE = muqueux, épithélial) avec production antigène H
- h et se = silencieux ("non sécréteur")
- Phénotype H déficients : pas d'antigène H, mais anti-H plus ou moins intense (exemple du phénotype Bombay qui a un anti-H très puissant ("receveur dangereux"))
- Anticorps antiH: dangereux chez sujet Bombay, Ah ou Bh
#### LE (ancien. Lewis)
- Peu utile pour transfusion
- Pas un vrai système de groupe sanguin mais sécrétion/tissulaire (existence d'une substance LE1 ou LE2 mais seule la second est dans les globules rouges).
- Enzyme produit antigene seulement dans cellules sécréteuses (muqueuse de glande salivaire, cellules inconnues)
- antigène adsorbé par le globule rouge et non produit
- Anticorps : anti-LE1, LE1, LebH, LebL+++.
- dépend du gène sécréteur (SE) et du gène Lewis (Le)
- se/se et le/le : pas de sécrétion, pas de Lewis dans la cellule sécrétantes = reste tel quel (précurseurs type)
- se/se et LE : enzyme -> antigène Lewis a
- SE et LE : antigène H d'abord puis antigène Lewis b (action successive des 2 enzymes)
- défini à 2 ans donc pas d'impact obstrétrical
- chez la femme enceinte, les antigènes vont se décrocher
Anticorps :
- naturels et irréguliers
- hémolysant dans certains cas
- anti Le^a : /jamais chez les Le^a négatif
- anti Le^b : le plus sovuent chez Le (a-,b-), très rarement chez /jamais chez les Le^a négatif
#### P1PK et globoside
- P1PK =
- 3 antigènes (P1, Pk, NOR)
- anticorps :
- anti-P1 : fréquent, pas utile en transfusion ou obstétrique
- anti-PP1PK = naturel, régulier, **attention transfusion**, **fausses couches précoces, à répétition**
- Globoside=
- 1 antigène P (très rarement absent)
- allo anti-P = hémolyse transfusion
- autoantiB = hémoglobinurie a frigorue
### Système LU
Gène LU
- 20 antigènes
- 4 couples d'antigènes dits antithétiques car il faut au moins l'un des 2 (a ou b) (sinon très rare)
- 12 ag fréquents
- Lutheran b = rare (impasse transfusionnelle)
- anticorps
- anti LU1 = rare
- anti LU2 = très rare, actif à 37° donc *attention transfusion*
- antiLU3 = receveur dangereux
### Antigène I et i
Ag i se transforme en I (sinon extrêmement rare -> avec anticorps anti I: **pas de transfusion possible**)
## RH1/D et RH-KEL1/Rh-Kell
### RH1/D
- Propre à l'homme et GR
- 5
- Recherche antigène RH1/D (avec anticorps)
- 5 antigène majeurs C, E, c, e Kell (RH2, 3, 4, 5 et KEL1 resp.)
- le plus immunogènes
- accidents transfusionnels graves, maladies hémolytique du nouveau-né parfois graves
- 2 gènes étroitement lié sur chromosome 1
- RHD : présent -> code protéine D -> D+, sinon D-
- RHCE : 4 allèles possible pour une protéine RHCE Ce,CE, cE, ce
- C/c et E/e sont antithétique (si absent, autre présent en double dose: ex: C- -> c+)
- e 98% ! (quasiment public)
Transmission: D = dominant
Nomenclature : D+ C+ e- E- par exemple, RH 1,2,-3,-4
Variants :
- soit moins de sites antigèniques (Ag faible) -> pas d'alloimmunisation
- soit épitopse normaux (sites antigénique normaux, diminués) (Ag partiel) -> allo-immunisation possible avec anticorps antiD "sauvage"
- recherche biomol si hémoglobinopathie, femme subsaharienne < 50 ans, femme caucasienne < 50 ans si C-, E- (les D partiels y sont associé)
#### Anticorps
- Immun : induit par grossesse/transfusion incompatible
- IgG, traversent la barrière
- le plus immunogène : RH1 (D) surtout, puis RH4 (c)
### KELL
- Précurseurs précurseurs lignée érythroiide
- KEL1 = pouvoir immunogène important
- Antigènes
- 2 principaux et antithétique : K (KELL1,), k (KELL2 ou cellano) = antigène public en france
- autre : Kbpa, Kpb (KEL3 et KEL4)
- Anticorps : IgG, traversent la barrière hémato-placentaire
- antiKEL1 = fréquent
- antiKEL2 et 4 = **impasse transfusionnel**
### Impact délivrance
RAI positive avec allo-immunisation : anti RH1,2,3,4,4 et KEL1 -> phénotype négatif pour l'antigène et respect de tout le phénotype RH KEL
Femme de la naissance à la fin de l'âge de procréation : respect de tout le phénotype RH KEL
## Système FY JK MNS
- Les plus important en transfusion avec Rhesus et Kell
- antigènes propres aux globules rouges
- antigènes propres à l'homme aux
- bien développé à la naissance
- le plus souvent immun (IgG)
- **accident transfusionnel très graves**
### Duffy
- 2 antigènes : FY1 et FY2 (Fya et b resp.)
- Population caucasienne : 3 phénotypes : (a+,b-), (a+,b+) et (a-,b-)
- *Pop. africaine : le plus répandu (a-,-b)* !
Public : prévalence > 99.8%
- Ag FY3 : absence (a-,b-)
#### Génétique
- Chr 1-
- gène /DARC/ et protéine DARC
- porte d'entrée du plasmodium dans globule rouge
- exprimé rein, rate, poumoin+++ (attention aux greffe)
- nb de site antigénique plus faible si hétérozygote qu'homozygote (effet-dose)
- enzyme protéolytique : utile pour identification (ex: papaïne : détruit antigène FY1 et FY2, trypsine pour anticorps anti FY1 et FY25
- FY*A et FY*B codominant
- FY*A produit Ag FY1 et FY2
- FY*B produit Ag FY2 et FY2
- polymorphisme
- allle FY*X : produit antigèn FY2 d'expression affaiblie -> FY*A/Fy*B de phénotype apparent (a+, b-) mais en réalité (a+,b+)
- allèle, FY*B_null : silencieux mais uniquement dans globule rouge. Récessife : phénotype (a-,b-) dans gR mais (a-,b+) dans autres cellules
- mutation promoteur gène: facteur de transcription ne se fixe pas HGAT1 donc pas de transcription du gène dans lignée GR
- FY*0 : très rare, pas d'expression DARC donc pas d'antigène FY sur globules rouges et autre cellules -> vrai phénotype null (a-,b-)
- très courant afrincain, très rare caucasien:
- **receveur dangereux** car produit antiFY1, 2 et surtout **3**
- plasmodium vivaux et knowlesi utilige l'atigène FY pour traverser la membrane -> sujet (a-,b-) sont protégé
#### Anticorsp
- Immun IgG
- fixe parfois complément -> **grave**
- antiFY1, antiFY2 : **GCR phénotypé FY typés négatif**
- anti FY3 : immuns, origine transfusionelle (fréquent drépanocytaire)
- risque d'hémolyse : **hyperhémolyse** chez drépanocytaire
### Kidd (JK)
- 2 antigènes principaux JK1 et 2 (a et b), *antithétique*
- exprimé aussi dans rein (attention refjet geffe)
- 2 allèles codominant JK*01 et 02 produisant antigèn JK1 et 2.
- (a-, -b) très rare
- Ag JK3 fréquent
- Gène : rôle transport urée
- Effet-dose (variant nb site antigénique) mais pour *certains* antiJK1 et JK2
#### Anticorps
- IgG fixant le complément (hémolyse intravasculaire)
- antiJK1 *perfide et dangereux* car difficile à identifier (limite de détection) et très hémolysant, se réactive rapidement
- **accidents hémolytiques graves**, rejet greffe rénale
- antiJK1 et 2 positif -> **CGR phénotypés négatifs et comptabilisés**
- **épreuve de compatibilité peut être négative**malgré des anticorps présents en faible quantité donc on transfuse du JK négatif
- JK3 = (a-,b-) : attention car anticorps anti JK1 et 2..
- auto-anticorps possible
### MNS
- 48 antigènes dont 35 fable prévalence
- 4 antigènes principamux : MNS 1 et 2 (M et N) (antithétiques), 3 et 4 (antithétiques, S et s)
- antigène U = exprimé si S ou s (sinon peu ou pas exprimé)
- 3 gènes : GYPA, B et E -> code pour glycophorine A et B
- Phénotype rare : S- s- U-
- exceptionnel caucasion, 2% afroantilons
- phénotype U- : délétion gène : déficit total GPA, **anti-U très puissant**
- phénotype Uvar : U faible et partiel (qualitatif et quantitaf)
- attention les 2 ne sont pas incompatibles+++ -> **génotypage obligatoire S- s-** cr les U- peuvent s'immuniser contre Uvar
#### Anticorps
- AntiMSN1 : naturel, régulier, stimulé par transfusion, infection batérienne -> pas d'incidence sur transfusion **sauf drépanocytaire : risque hémolyse**
- antiMSN2 = très rare
-> sang compatiblisé mais non phénotypé *sauf drépanocytaire*
- antiMSN3 et 4 : donner du négatif, réaction très sévère
## Autres
Grande fréquence (public: > 99.9% en pop générale)
- attention si absence Ag public : production anticorps anti-public -> *receveur dangereux
Ag Faible fréquence (privé < 1%)
- ac anti privé : transfusion, grossesse.
- Pas d'impasse transfusionnelle.
- Pb en obstétrique (dangereux pour foetus)
Panel non obligatoire : DO, YT, CO, X
# Anticorps anti-érythrocytaire (RAI)
Autre anticorps que ABO
## Dépistage
Principe: 3 hématies de phénotype O détectants anticorps contre antigènes
- RH a minima : D,C,c, e
- Kel: Kell, k, p
- FY: Fy^a, Fy^b
- JK: Jk^a, Jk^b
- MNS: M, N, S, s
- LE: Le^a, Le^b
- P_1
- Lu^b
## Épreuve de compatibilité
Test plasma/sérum receveur avec hématies de la tubulure du produit à transfuser
## Titrage anticorps anti-érythrocytaires autres qu'ABO
Test indirect
## Examen direct à l'antiglobuline
Montre sensibilisation des hématies avec anticorps antiIgG et antiC3d
# Technique IH
Applications IH
- transfusion
- suivi femmes enceintes
- anémie hémolytique auto-immune (Coombs direct)
Principe = agglutation hématies
2 types
## Agglutination - Immunologique (mais pas tojours)
1. Fixation antigène-anticorps mais réversible
2. +/- agglutination (selon le type d'anticorsp: ##IgM est agglutinant##, IgG nécessite un "artificie")
- Hématies = charge négative => se repoussent
- Spontané = IgM surtout, grosses molécules, "froid" (optimin (+4%)), ne passent pas la barrière placentaire, - activent complément (jusqu'à destruction de l'hématie, ex de l'accident ABO)
- Agglutination artificielle : IgG, "chaud" (37°), passent barrière placentaire (plus petits),
- -> problème de grossesse, ! **Ac anti JK** peut fixer le complément -> hémolyse intra-vasculaire comme accident ABO
- test indirect (ex RAI) : plasma patient + globules rouges + antiglobuline
- Test direct anitglobuline : GR patient porteur anticorps + antiglobuline
Techniques:tube d'hémolyse, gel ou microplaques
- gel : automatisable (agglutination = reste au sommet)
- Phénotypage : Délai 1h sur gel ou tube
Applications
- Phénotype : ABO, Rhésus, Kell
- RAI
- Coombs direct (le patient a-t-il des anticorps fixés sur GR ?)
- recherche agglutinine froide
Tube prélevé sur anticoagulant (EDTA) + centrifugé -> plasma (Ac) ou GR (antigènes)
## Recherche d'agglutinines irrégulières
- Allo-anticorps contre autre que antigènes autres que A et B (not. après transfusion+++)
- EDTA, **frais**, plasma après centrification
- Dépistage: plasma du patient + 3 hématies tests connues + antiglobuline (semi-quantitatif : 1 à 4 croix)
- Identification : sur 11 hématies tests + témoin autologue
- regle des 3+/3- : 3 hématies positives pour l'antigène et 3 négatives
- Résultat
- Si positive , alloanticorps donc identification sur 11 hématies test (avec témoin autologue)
- vérifier absence de l'antigène correspondant (phénotype étendu)
- culot à transfuser phénotypé
- épreuve directe de compatibilité (plasma patient + hématies à transfuser)
- nouvelle carte de groupe (refaire groupe)
- Si négative :
- **un anticorps un jour, un anticorps toujours** (non détecté ? concentration variable dans le temps)
- valide 3 jours (21 jours si négatif et pas de transfusion, grosse, greffe+++)
- Indication:
- **obligatoire avant toute transfusion** (sauf urgence vitale immédiate)
- après transfusion
- accident hémolytique après transfusion
- suivi grossesse
## Test direct à l'antiglobuline
- Montrer qu'il y a des anticorps (ou fraction du complément) présents sur hématies du patient
- ajout antiglobuline humaine : agglutine si les anticorps existent
Technique
- Antiglobuline polyvalente (IgG + complémenta)
- Antiglobuline spécifique (IgG et IgM)
Indication
- anémie hémolytique auto-immune
- maladie hémolytique néonatale : anticorps maternels sur antigènes foetaux (obligatoire sur tous les nouveaux nés)
- accident transfusionnel (anticorps du patient sur globules rouges transfusés)
TDA positifs
- IgG : élution
- C3d : recherche agglutinines froides
## Élution directe
Détache ("lave") les anticorps des globules rouges.
Puis test indirect (RAI) pour regarder les spécificités de ces anticorps
## Transition
Sensibiité pour allo-immunisation : éluat > TDA > RAI
- élution positive dans un premier temps car anticorps sont sur les globules rouges seuls (ex. d'une transfusion avec anticorps contre GR ) -> **RAI négative** !
- puis TDA+ (besoin de plus d'anticorps car l'élution fait une concentration)
# Norme 15189 (Patrick Joubaud)
Cf [cofrac]
Attention au IgG+ ou C3d+ en TDA
# Présentations
## Complications transfusionnelles 2
leucémie aigue : phénotype RH-K, irradiation si greffe cellules souche ou ID profondeur
Tumeur solutique : pas d'irradiation
pour les 2, seuil 80
Patient âgé : transfusion lente (2h en moyenne)
Indications
- Phénotypé : transfu répétées, maladie hémato, groupe rare, *femme de la naissance à la fin de période procréatrice*, hémoglobinopathie
- Compatibilté : RAI+, drépano
- Irradié:
- indications: don intrafamiliale (quelque soit degré parenté !), déficit immunitaire congénitale, avant/pendant prélovement CSH, *autogreffe CSH* (au moins 3 mois), *allogreffe* (au moins 1 an)
- prévenir GvH (lymphocytes du donneur attaquent tissus hôte, moelle) Note: immunocompétent, les LT sont censé les détruirer
RAI valide 3j (21 si négative sans transfus, grossesse ou transplantation)
Effets indésirables grave d'imputabilité forte
- allergie 56%
- 40% pulmonaire (oedeme pulmonaire de surcharge surtout)
### TACO = OAP de surcharge (transfusion acute circulatory overload)
- 1ere cause de décès transfu
- sous déclaro
- recos :
- à risque si > 70A avec comordbidité cardio
- (pseudoobstruction d'aval = accumulation sang donc surtout eau en amont: hypertension oreillette gauche donc alvéole in fine )
- altération FEVGE, rétrécisseent aortique, HEC, IRC (déficit élimintation)
- prévention : transfu lente (1 CGR en 2H) + surveillance *TA* (premier signe de surcharge) : furosémide ? (pas de reco)
### TRALI * transfusion acute lung injury
SDRA: altération membrane alvéolo capillaire par PNN
hypoxémie + oedème pulmonaire bilat à la radio + *absence* insuf cardiaque gauche (donc furosémide inefficace)
Étiologie : agression membrane
- directe = infection, trauma thoracique
- indirecte : choc septique, pancréatite, CIVD
Physio : lié au PNN surtout (réponse inflammatoire dérégulée -> chimiotactinsme jusque dans alvéoles puis production de cytokine et destruction membrane). Pronostic ~ infiltrat
Clinique : dyspnée d'aggravation rapide dans les 6h (voire 12-24h), crépitants, infiltrat pulmonaire bilatérale mais *pas de signe de surcharge* contrairement à OAP
Évolution favoirable sous VNI dans la majorité des cas (O2 pousse l'eau dans les vaisseaux)
Fièvre : plutôt tralie, hypertension plutôt TACO
BNP, echocardio : plutôt TACO
## Anémies hémolytique auto-immunes
GR: 120j
Destruction macrophage : hb -> Fer (réuitilsé), globine (décomposé AA), hème (bilirbuine non configuée puis fixée almbunie -> bili conjugée -> 85% stercobiblinogène)
Classiication
- corpusculaire: membrane (sphérocyytose), Hb, déficit enzymatique (G6PD), hémoglobinurie paroxistique nocturne
- extracorpusculaire : mécanique, toxqiue, infection, auto-immune
Autoimmune : Ac contre Ag GR
- plutôt âgé, un peu plus femme
- mortalité 8-15%
- mécanisme : fixation du fragment FC sur macrophages tissulaires ou activation complément (plutôt intravasc)
Étiologie
- idiopathique 50%
- secondaire : infection (MNI, CMV, parvo, syphilis, turberucoles), traitement, associé autominnu (lupus, SAPL), associé hémopathie lymphoïde
Selon type auto-ac
- chaud : adulte, plutôt intratissulaire, IgG 37%
- agglu froide : > 50A, intratissulaire ou vasculaire, IgM, plutôt chronique , plutôt chronique
- froid autre (infectieux)
- hémoglobinurie paroxistique a frigorie : aîgu, enfant. Attention aux mycoplasme aussi
- autre (large amplitude thermique)
Intravasculaire : brutal, fièvre, douleur lobmaire, urine "rouge porto", ictère
Extravasc : progressif, discret (subictère conjonctival)
Diag :
- clinique + bio (anémie normochromoe normocytaire, pas de schizoytes (!= mécanique), sd hémolytique)
- IH: Coombis direct : hématies avec Ac déjà fixées + antiglobuline -> agglu
- Penser à chercher des IgA si neg
- IgG+ : élution (détacher Ac sur hématie et déterminer leur spécifique en TIA) puis Coombs anticiderct (éluta sur panel connu avec antigolbuline)
- C3+ : agglu froide
Tttt :
- autoanticorps chaud : cortico, folates
- froid : MAF: pas d'exposition au froid
NB: **tout positif (panagglu + témoin autologue positif)** -> adsorption (soit le plasma du patient sur hématies du donneur, soit sur ses hématies (l'idéal))
# Suivi immuno-hémato femmes enceintes
Objectifs
- Prévenir immunisation
- Sinon diagnostic + suivi :
- suivi cinétique anticorps, suivi clinique
- sécurité transfusionnelle (femme + nouveau-né)
## Allo-immunisation érythrocytaire
- Alloanticorps dans plasma mère contre Ag présent hématies foetus
- Origine : hétéro (Ag ABO), transfu, hémarragie foeta-maternelle (hématies foetus passent circulation maternelle)
- dépendent de l'immunogénécité de l'Ag (= capacité à induire la sinthèse Ac): **D > K** (ABO faible), quantité GR foetux, individu
2 types
- ABO: exprimés tardivement donc /pas d'impact fœtus/ (expression après naissance), les plus fréquentes, habituellement bénin
- non ABO (vraie alloimmunisation foetomaternelle): tous les systèmes. Plus fréquente RH KEL FY JK, dès vie embryonnaire
### ABO
Mère O : IgM antiA naturels (ne passent pas la barrière hématoplacentaire), IgG antiA immuns (ictère)
NN type A: aura des IgG antiA maternel dans le sang
*RAI chez la mère*, **TDA Chez l'enfant** : si positif, élution pour antiA et antiB
Transfu **CGR groupe O RHKell mais non compatibilisé**
Bénin sauf certaines population (AFrique subsaharienne)
### Alloimmunisation
- 1ere grossesse incompatible : IgM ne passant pas la barrière hématoplacentaire puis switch IgG. Souvent moins d'impact mais possible néanmoins.
- 2e grossesse incompatible : réactivation à la moindre stimulation du ystème immunaire : production massive IgG **passage placenta**
- dès 1er trimestre
- destruction GR fœtus : anémie + hyperproduction bilirubine (impact nouveau-né car éliminé par la mère au stade fœtal)
Impact clinique:
1. anémie sévère (difficile à détecter à l'échographie)
2. accumulation bilirubine système nerveux (mort/séquelle neuro)
### Diagnostic
- *RAI*
- dangerosité selon spécificité anticorps :
- hémolyse GR matures : **antiRH**, JK, FY, MNS3,4, antiMNS1
- GR mature + précurseurs érythroides **antiKEL**
Les plus sévères : **anti RH1, RH4, KEL1**
- bien développés chez foetus (4 SA)
- risque anémie fœtale/néotal
- suivi maternité 3 (sauf si titre faible)
Les plus fréquents : *RH 1 , 3, 4 KEL1*
- antiRH1: Prophylaxie diminue incidence de 80%
### Divers
Ac anti public
- Anti U, public RH, public KEL
- risque d'anémie sévère
- transfert échantillon CNRGS + équivalent obstétrical (CNRHP)
Ac antiprivé
- non détecté RAI chez la mère (pas sur le panel)
- risque anémie fœtale/néonat
- pas de difficulté transfusionnelle
- y penser si hémolyse inexpliquée chez fœtus
- TDA chez foetus +/- compatibilité GR mère et GR fœtus
Autoanticorps ou HLA : pas d'impact
### Suivi biologique
Évalue le risque d'anémie fœtale sévère pour suivi clinique/écho
1. confirmer incompatibilité : phénotype érythrocytaire procréateur, génotypage fœtal non invasif
limiter gestes invasif qui peut aggraver
2. spécificité Ac : RAI
3. affinité de l'anticorps : titrage
4. Concentration : dosage pondéral (seulement antiRhésus)
Génotypage fœtal
- CNRHP
- ADN fœtal libre dans plasma femme (10% ADN forme acellulaire)
- RH1, 3, 4, KEL1
- négatif : confirmer sur 2e prélèvement
- positif/indéterminé : suivi
Titrage
- TIA tube+++ (seuils) ou gel
- comparer avec plasma prélèvement précédent (technique opérateur-dépendant)
- dilution de 2 en 2 : titre = 1/dernière dilution +
- seuil à 8 pour anti-D
Dosage pondéral
- EFS Lille, CNRHP
- si > seuil : maternité 3 et suivi écho (vélocimétrie artère cérébrale moyenne)
- seuil 1υg/mL pour anti-D
### Suivi clinique
- Échographie : trop tardif pour suivi anasarque !
- Rythme cardiaque fœtal : trop tardif, peu sensible
- *doppler cérébral*: anémie augment débit cardiaque et diminue viscosité donc augment vélocité sanguine
- obligation d'informer le prescripteur en cas d'alloimmunisation
- éviter méthodes invasives (réactive immunisation)
Anasarque = pas d'adaptation à l'anémie : urgence vitale (risque de mort fœtal)
Objectif : maintenir la grossesse jusqu'à un terme viable
Transfusion fœtal :
- 2-3% mort fœtale, à partir de 17SA
- **Onegatif sauf si c-**(les O négatifs sont c+ (phénotype rares sinon))
### Prise en chare nouveau-né
- surveillance clinique + bio : peut apparaître plusieurs semaines après !
- groupage sanguin (*interprétable si transfusion in utero*)
- examen direct antiglobuline (attendu positif)
- élution
- NFS, biliburine
- transfusion à partir de *RAI de la mère* et Coombs direct (Ac maternels sur GR du nouveau-né) +/- épreuve compatibilité avec *plasma maternel* (valide 120j)
Tous les labos privés doivent transmettre à l'EFS une RAI positive
### Cas clinique
Ag Kpa = toujours négatif sur panel donc attention
## Suivi réglementaire grossesse de toutes les femmes enceintes
- Détecter et dépister à temps
- Recommandations HAS + décret 1992 :
1. **toutes les femmes** dès 1er trimestre : 2 déterminations de groupe (si non fait) et RAI
2. Puis
- D+ sans antécédent transfu : RAI 1er trimestre et à l'accouchement
- D+ sans antécédent transfu : RAI 1er trimestre et 6e, 8e et 9e et à l'accouchement
- V- : RAI1 trimestre, phénotype GR géniteur, génotype foetal 11SA
- foetus D+: RAI 6+, 8+, 9/
- accouchement
- c- sont **toujours D+** : RAI1er trimestre à l'accouchement mais il faudrait faire 3e trimestre pour ne pas passer à côté de certains cas
### Préventir alloimmunisation antiRH1
- Pour les autres : seulement en transfusion CGR (phénotype RHKell) (25% incompatibilité)+/- rophylac avant transfusion plaquettaire
- Génotypage RH foetal :
- non invasif, >= 11 SA
- si négatif, confirmer 2e prélèvement : Rophylac inutile
- si positif ou indéterminé (souvent des variants), justifie Rophylac en ciblé selon situation (fausse couche+++) et **systématique 28SA**
- Immonoprophylaxie: Ac anti RH1 pour neutraliser les GR RH+ (non reconnu par système immunitaire)
- dérivé du sang (donc risque infectieux)
- **28SA**: justification = couvrir hémorragie foeta-maternelle du 3e trimestre non apparente
- en ciblé si fausse cocuhe, traumatisme, amniocentèse
- **accouchement** sauf rophylac < 3semain, klehauer négatif, antiD >= 6ng
- **RAI avant Rophylac**
- efficacité : < 72h avant l'évènement, IV (biodisponibilité immédiate), adapté la posologie
- Immunoprophylaxie accompagnée par
- RAI: negative avant
- Kleihauer : à partir de 15SA. Fait à chaque évènement immunisant + accouchement (mais pas 28SA). Adapte la posologie : 220υg ok jusque 24 hématies ofetale /10 000
- microtitrage : permet d'estimer les faibles concentrations d'anticorps (à la différence du titrage) (estimation !)
- pour différence alloAc des antiRH1 résiduel
- concentration résiduelle rophylac pour estimer couverture par rophylac
- on compare intensité par rapport à un témoin à différentes dilutions -> dernière réaction positive
- passif si concentration < attendue
#### Prévention secondaire
Nouvelle grossesse chez femme immunisée:
+++
title = "Hématologie"
date = 2023-11-05
+++
# Physiologie
- Durée de vie
- GR: 120 jours
- plaquette 7 jours
- polynucléaire 24h
- Localisation : sac vitellin (\<= 2 mois), foie/rate (\<= 7 mois)
puis moelle
NB: dans la moelle, mégacaryocyte (normalement non présent dans moelle)
Moelle : progéniteur (non identifiable) -\> précurseurs (identifiable).
Puis cellules différenciées dans le sang
CSH
- CD34+, CD38-
- -\> progéniteur lymphoide ou myéloide
- différentiation restreinte à 1 ou 2 lignées
- CD34~~, CD38~~
- peuvent reconstituer toute l\'hématoiès à long terme !
- multipotente, autorenouvellement
- nombreuses interactions CSH avec micro-environnement (\"niche\"
hématopoïètique)
![lignée myéloide](/images/hematologie/myeloide.png)
Pour lignée lymphocytaire:
- le thymus sert à la différenciation des précurseurs des lymphocytes
**T**
- la moelle sert à la différenciation des précurseurs des lymphocytes
B
- les lymphocytes B matures, après activationo avec antigène, se
différencien en LB mémoire et en plasmocytes qui produisent les
anticorps circulants.
![lignée lymphocytaire](/images/hematologie/lymphoide.png)
# Cytométrie en flux
Identification des cellules hématopoïetique par glycoprotéines (surface/cytoplasme) = antigènes de différentiation
- anticorps monoclonaux + fluorochrome
- regroupés en cluster de différenciation (CD) -> sous-populations
Sur sang (EDTA), fluide (tube sec), tissu (enzyme)
Principe : cellule "s'allume" (via fluorochrome) en passant devant un laser
Indication en hémato: hémopathies malignes
- leucémie, lymphome
- leucocytose (hyperéosinophilie, infection (neutro, mono)), neutropénie, LGL
- anémie : HPN, sphérocytose, GF foetaux
- plaquettes : numération, déficit
# Hémostase
- Facteurs dépendant vitamine K: II, VII, IX, X
- déficit en fibrinogène : le plus souvent acquis mais congénital
possible
## Variation TP, TCA
Diminution TP
![](/images/tp-diminue.png)
Augmentation isolée TCA sans traitement
![](/images/tca-diminue.png)
Variations physiologiques
- Grossesse :
- augmentation facteur VIII, Willebrand **fibrinogène**,
diminution XI
- augmentation TP (VII, X, fibrinogène)
- Nouveau-né : carence en vitamine K (donc doser TP, TCA)
## Facteurs
- VIII: 50-150%, évolue parallèlement au willebrand (augmenté
grossesse/inflammation mais aussi cirrhose hépatique par synthèse
endothéliale)
- IX : 50-150% : diminué avant 3 mois
- XI: 60-140% : diminué avec 1 ans, diminué si IHC
## D-dimère
Produit de dégradation de la fibrine
- augmenté si CIVD
- bonne VPN pour thrombose/embolie pulmonaire (\<450-550)
## Principaux réactifs
### TP
- TQ = II,V,VII,X et fibrinogène
- insensible héparine dose thérapeutique et fibrinogène \> 0.6 ou \< 6
- temps de coagulation d\'un plasma citraté avec facteur tissulaire +
phospholipides en excès + calcium
- conversion en % avec droite de Thivolle -\> TP
- TP : spécifique seulement pour VII
- Réactif := thromboplastine
- phospholipides
- facteur tissulaire
- calcium
- inhibiteur héparine
- forte concentration en phospholipides donc TP peu sensible aux lupes
anticoagulants
- modifié par debigatran et rivaroxaban surtout (moins apixaban)
### TCA
- TCA : mesure temps malade / temps témoin (ref \< 1.2)
- Calcul temps témoins à chaque changement de lot, validation de
réactif sur 30 sujets sains
- Réactif : céphaline : phospholipides + activateur (kaolin)
- Allongement variable par HNF en curatif variable
- Choisir le réactif selon indication :
- dépistage risque hémorragique en pré-op
- dépistage lupus anticoagulant
- Peu sensible au antiXa, sensible anti IIa
Dosage fibrinogène avec thrombine calcique en excès + inhibiteur
héparine : mesure du temps et conversion en g/L avec droite
d\'étalonnage
## Fibrinolyse
- Dégradation de la fibrine (une fois le caillot stabilisé)
- Fibrinogène -> (thrombine) monomère de fibrine -> (facteur XIIIa) fibrine insoluble -> (plasmine) D-dimère, produit dégradation fibrine
### Spécificité
Plasminogène
- Activé par t-PA (tissular Plasminogen Activator) et u-PA (urokinase, non fibrinospécifique)
- t-PA : exercice, stress, stase veineuse. Soit lié à la fibrine, soit complexe avec PAI(Plasminogen activator inhibitor type)-1 et éliminé par le foie
- u-PA : protéolyse tissulaire surtout -> dégradation de la matrice extra-cellulaire, activation cytokines+++
- Digestion de la fibrine par liaison plasminogène et t-PA (plasmine) [NB: l'acide tranexamique inhibe l'intercaction du plasminogène]
### Régulation
- \alpha_2 antiplaslmine : inhibe plasmine libre donc un déficit = hémorragie grave
- PAI-1 : inhibe t-PA et u-PA (thérapeutique : modification du t-PA recombinant pour le rendre moins sensibleau PAI-1)
- TAFI (Thrombin activatable fibrinolysis inhibitor) = inhibe liason plasminogène-fibrine
- fibrine elle-même (rend la réaction spécifique)
- architecture de la fibrine (plus ou moins résistante à la fibrinolyse)
### Pahtologies
- hyperfibrinolyse = risque hémorragique :
- plasmine libre en circulation (déficit alpha2 antiplamsione, chirurgie, déficit PAI1, certaines leucémines aigües)
- hypofibrinolyse = risque de thrombose : déficit plasminogène, augmentation PAI1
### Exploration
- Global : thromboélastrogramme
- D-dimères, protéines fibrinolyse
- Si syndrome hémorragique (chir, post-partum), syndrome de consommation, exclure TVP/EP, thrombose récidivante
# Fonctionnement des automates d'hémostase
- Méthode : chronométrique (coagulante), enzymatiques (chromogénique), immuno
- Automates : Stago : starmaxo, Sysmex/Siemes: CS
## Techniques en hémostase
### Chromonétrique
- Ex: TP,TCA, facteur coagulation
- Principe : plasma pauvre en plaquettes : + phopsholipides, activateur +Ca2+ avec déclenchement de la coagulation à 37° -> chronomètre el temps de formation du caillot de fibrine
### Electromécanique (viscosimétrie)
- Technique : oscillation d'une bille (champ électromagnétique). Avec la formation de la fibrine, augmentation de la viscosité et ralentissement du mouvement de la bille
- Avantages : pas d'interférence optique
- Inconvénient : moyenne d'amplitude trop faible
### Photo-optique
- Technique : détection signal diffracté (néphélémétrie) ou transmis (turbidimétrie) modifié par le caillot
- Avantages : voir la formation du caillot
- Inconvénients : détecte mal les petits caillots transparents, interférence si lipémie, hémolyse, hyperbilirubinémie -> lecture à 671nm pour minimiser c ou à plusieurs longueurs d'onde
- CS5100 : TP,TCA, fibrinogène
### Enzymatique : Chromogénique
- Mesure activité protéolytiques des : facteurs/inhibiteurs coag/acttivité AOD ou hépariné
- Principe : susbtrat chromogène + oligopetite spécifique enzyme à doser (qui va couper le petite et libérer le substrat chromogène) -> intensité dus signal proportionnel à l'activité
- Avantages : très spécfiques, mesure activité
- Inconvénients : interférence lipémie, hémolyse hyperbilirubinémie, réactifs couteux
- CS5100 antithrombine, protéine C
### Immuno à détection photo-optique (immunoturbidimétrie)
- Dosage quantitatif Ddimères, monomèes de fibrine, facteur/inhib coag
- Réaction Ag-Ac
- Avantages : très sensible et spécfique
- Inconvénient : réactif couteux, nb tests disponibles limités
- CS5100 : D-dimères
## Examens de biologie médical délocalisés
- Resoponsable = laboratoire
- hHémosatse : attention préanalytique et analytique
- Activated clotting time = chir cardique, radiologie interventionnelle -> surveillance anticoagulation par héparine (chronométrique, sans total)
- TP/INR : INR bien validé surveillance AVK, TP moins validé (guide transfusioin, dépistage coaguliopathies)
- Fonction plaquettaire après ttt anti plaquettaire : résistance, hémorragie -> pas de recommandation, recherche
- Verify now= mesure agrégation par turbidimétrie optique
- Fonction plaquettaire par impédiance
- Thromboélastographie : ROTM et TEG
- étude viscosité et élasticité du sang pendant coag -> calcul temps initiation coagulation, vitesse formation caillot, stabilité (fibrinolyse)
- péri-opératoire (trauma sév-ère, hémorragie post-partum+++)
# Maladies
## Maladie de Willebrand
Suspicion clinique : 1ere intention
- activité facteur VIII
- activité vWF (vWF:Act) : technique de référence agrégométrie/turbidimétrie avec ristocétine (induit liaison vWF-GpIb des plaquettes = glycoprotéine intervenant dans l'agrégation)
- antigénique vWF : immunologique, concentration plasmatique
- Hemogramme
- NB : TCA normal ou allongé (allongé type 2N et 3)
- +/- temps d'occlusion plaquettaire sur PFA = dépistage simple et rapide : *in vitro* par mesure du temps de passage du sang dans capillaires (collagène + activateur plaquettaire jusqu'à occlusion) -> très sensible aux anomalies du vWF 'sauf trype 2N)
Type 1 = déficit quantitatif
Type 2 = déficit qualitatif (2A = déficit vWF, 2B = gain de fonction avec déplétion multimere de haut poids moléculaire (HMW), 2M = qualitatif, 2N seulement binding FVIII)
Type 3 = quasi-absence vWF
Interprétation
- FVIII:c/vWF:Ag > 0.7 sauf type 2N
- taux VWF (antigène ?) :
- diminué si groupe O -> recherche groupe
- augmenté si âge, grossesse, stress, exercice physique, oestroprogestatif, syndrome inflammatoire, insuffisance hépatique -> CRP et fibrinogène pour écarter syndrome inflammatoire
Interprétation activité vWF
- activité vWF 30-50% = déficit modéré
- activité vWF < 30%
- vWF:act/Ag > 0.7 : type 1 ?
- sinon : type 2 ?
- FVIIIc/vWF:Ag <= 0.7 : type 2N ? hémophilie A ?
- Ag < 5% : type 3 ?
![](/images/hematologie/willebrand.svg)
## Thalassémies
Définition : anomalie génétique avec diminution/absence synthèse de chaine alpha ou beta globine
### Beta-thalassémie
Gène HBB (chr 11). AR donc en général
- hétérozygote : peu sévère
- homozygote : le plus souvent sévère (forme mineure)
Avantage sélectif sur paludisme -> méditarrénée, afrique, inde, ase sud-est, *sud de la france*
Forme mineure : diag biologique (peu signe clinique), pas de traitement, conseil génétique
- "syndrome thalassémique" *microcytose, hypochromie, pseudo-polyglobulie* +/- anémie, arégénératif
- étude hémoglobine : (chromatographie liquide haute pression, electrophorèse capillaire car faible fraction) : Hb A_2 >= 3.5% (augmentée)
Forme majeure :
- clinique :
- début nourrison/enfant avec diminution Hb foetale : anémie profonde dépendant de la transfusion
- HMG, SMG, ictère, infeciton à répétition, retard staturo pondérale
- surcharge en fer (transfusion)
- diag biologique : **Hb < 7g microcytaire hypochrome + microcytose**, hypochrile, anisocytose, po%ikylocytose, erythroblaste
- étude Hb *avant* transfusion : absence HbA avec HbF majoritaire
- NB : autre forme ; Hb E, autres variant Hb
Forme intermédiaire : définition clinique : anémie moins sévère, transfusion si nécessaire, complication surtout à la surcharge en fer
Prévention ; dépister les hétérozygots (couples à risque, hémogramme)
DPN ou DPI possible
Traitement :
- symptomatique : transfusion (selon forme), chélation martiale dans les 2 cas
- curatif : greffe moelle osseuse, thérapie génétique (essai thérapeutique)
### Alpha-thalassémie
Ubuquitaires mais extrème-orient, asie pour les formes sévères
Gènes HBA1 et HBA2
- 3 gènes fonctionnels : silencieuse
- 2 : mineure
- 1 ou 0 : sévère : hémoglobinose H et hydrops foetalis resp
Diag biologique :
- silencieuse : microcytose très modérée hypochromie sans anémie, ferritine et etude Hb normales
- mineuse : pseudo polyglobulie, microcytose, hypochromie +/- anémie, etude hémoglobine ormale/HbA2 légèrement diminué
Hydrops foetalis : mort in utero/naissance le plus souvent + risque mère toxémie gravidique
Génétique : si une allèle avec double deletion : risque hydrops foetalis !
Hémoglobinose H :
- **hyperhémolyse** (anémie, ictère, SMG) parfois en crises (fièvre médic), surcharhe en fer
- anémie microcyaires hypochrome +/- thrombopénie avec hémolyse (bili libre augmentée, hapto diminuée, LDH augmenée) et surcharge en fer (ferritine N ou augmentée)
- etude Hb : HbH ou bart, Ae2 diminuée
- coloration bleu de cr&syl ; hématies en balles de golf
## Anémie microcytaire
Définition:
- microcytoraire :VGM < 80 fL (adulte), 72fl (enfant). NB: élevé chez l'enfant
NB : la microcytose est habituellemment associée à une anémie mais pas toujours.
NB: l'anémie microcytaire est habituellement hypochrome (diminution CCMH et TCMH)
Physiopathologie : microcytose = défaut de synthèse de l'hémoglobine donc divisions supplémentaires
Diagnostic initial: hémogramme (nb GR, plaquette, leuco, formule sanguine) (réticulocytes inutiles en première intention)
- frottis : hypochromie, dysérythropoïèes
Causes principales : carence martiale, thalassémie, inflammation
### 1. carence martiale (fer)
- la plus fréquente
- centrale
- diminution synthèse hème par manque de fer
- clinique :
- anémie (asthénie, paleur+++), cutanéo-muquex (fer sert au renouvvellement : peau sèche, ongles cassants), *pas* de fièvre, ADP, SMG, purpura
- troubles du comportement, retard psychomot, atteinte défense immunitaire
- bilan: **ferritine diminuée** (stockage fer), autres = inutiles
- si pas de carence fer : bilan inflammatoire + étude hémoglobine
- cause
1. carence apport (interrogatoire !)
2. perte par saignement : digestif chronique (ex: cancer colon), gynéco (ménorragie, trouble coag))
- traitement : cause ++, fer per os en 1ere intention 2-3 mois (attention tolérance)
- interrogatoire : ration protéique, hémorragies (digestives, gynéco), médicaments
- +/- bilan coagulation, exploration digestive/gynéco
### 2. syndrome thalassémiques (globine)
Cf cours
### 3. Syndrome inflammatoires chroniques (fer séquestré)
- Infection, cancer, maladies inflammatoires chroniques..
- Rétention fer dans les macrophages, sécrétion cytokine (bloque progéniteur érythroïde)
- Anémie normo- puis microcytaire, *ferritine normale/augmenté* (diminue l'inflammation en séquestrant le fer pour diminuer le stress oxydant)
- traitement = celui de l'inflammation
### 4. Causes rares
Myélograme et perls, étude génétique:
- anémie sidéroblastiques constit (hème)
- génétique rare : acéruloplasminémie, atransférrinémie congénitale, déficit DMT1+++
## Myélome
- prolifération plasmocytaire maligne avec soit une Ig entier soit une
chaîne légère libre
- Rare chez sujet jeune (âge médian 70ans)
- Conséquences de la prolifération tumorale
- activation ostéoclastes -\> hypercalcémie, fragilisation os
- suppression hématopoièse normale (GR)
- déficit immunitaire humorale (hypogammaglobulinémie car
plamocytes normaux sont inhibé par clone)
- rénal: accumulation de chaînes légères libres/Ig entière
(néphropathies à cyclindre), hypercalcémie+++
- prolifération: B puis moelle (MGUS -\> myélome) puis sang (leucémie
aigüe à plasmocytes)
- formes biologiques :
- Ig monoclonaire entières (surtout IgG) 80-85%
- chaîne légère libre isolée
- non sécrétant
- autres: plasmocytome solitairee, leucémie à plasmocytes (pronostic
sombre)
### Diagnostic (2014)
- {plasmocytes médullaires \> 10% ou plasmocytome extramédulaire} et 1
parmi
- signes CRAB (hyperCacémie, insuffisance Rénale, Anémie, Bone)
- nouveau marqueur
- plasmocytose médullaire clonale \>= 60%
- chaine légres impliquée/non impliqué \>= 100
- \> 1 lésion focale IRM
NB:
- myélome indolent : pas de CRAB, pas de nouveau marqueur et
{IgG/IgA \>= 30 ou dans les urines \>= 500mg/24hou plasmocytose
médullaire entre 10 et 60%}
- MGUS : tout négatif (pas de CRAB, pas de marqeur, Ig \< 30,
médullaire \< 10%)
### Pronostic et traitement
- myélome multiple = incurable
- score ISS
- réponse au traitement : disparation monoclonale, plasmocytaire
monoclonaires
- surveillance : EPS +/- dosage chaine légère
### Bilan initial
- EPS (pic β, γ ou α; ou hypogamma isolée \[suspicion chaine légre
monoclonale\]
- immunofixation
- chaînes légres libres κ et λ sérum
- uraines 24h: EPS et immunofixation: chaîne lére monoclonaire
(protéinuire Bence-Jones)
- hémogramme (hémoaties en rouleau \[hyperprotidémie\], anémie
normochromoe, normocytaire, arégénératives)
- myélogramme
## Polyglobulie de Vaquez
Diagnostic : A1 + A2 + {A3 ou B}
A1 : Hb \> 16.5 (16 femmes) ou Hct \> 0.49 (0.48) ou masse globulaire
totale \> 125% A2 : biopsie méudllaire : hypercellularité, panmyélose,
mégacaryocytes mature pléiomorphe A3: mutation JAK2 (V617F) B :
diminution EPO
NB: on peut éviter la biopsie osseuse si Hb \> 18.5 avec JAK2 et EPO
mais elle permet de voir une fibrose initiale (permet de dépister
myelofibrose)
Risque :
- vasculaire (court terme) : thromobse art/vein, hémorragie (!)
- hémato (long terme) : myélofibrose, myélodysplasie, leucémie aigue
Traitement :
1. aspirine/saignée
2. si haut risque : hydroxyurée ou ropeginterferon
## Thrombocytose
### Fausses thrombocytoses
Séparation GR
- plaquette se faire sur la taille -> éléments de grande taille peuvent être comptées comme plaquettes par excès
- hématies fragmentées : scitzo, microcytes (brulûres sévères font éclater les GR) -> sysmesx en fluorescence est censé les différencier
- fragments cytopaslmes de leucocytes (blastes, lymphome)
- cryoglobuline, cryofibrinogène
- lipides : hyperlipédmie, prélèvement près d'une perfusion lipides (formation de "micelles" lipidiques perturbant la numération)
- bactéries, candida
## Thrombopénie
- < 150G/L
- Périphérique : mégacaryocytes normaux/éleves, destruction/consomation/séquestration
- Central : mégacaryocytes diminuné, congénital/acquis
- Myélogramme non obligatoire
### Central
- défaut de production (qualitatif/quantitaf): aplasie, carence B9, B12, alcool, médicament, radiot
- envahissement : LA, lymphome, myélome, LLC, LMC, métastases
### Constit (rare)
- nénat, enfance, adulte
- dysmorphie, cardiopathi, IR, surdité, cataracte, anomalie osseuse
- pas/peu de réponse au traitements
- signes hémorragiques inconstants
### périphérique
- destructio immuno:
- PTI (cf plus loins)
- médicaments (vanco, pénicilline+++)
- infection : virus (VIH, hépatite B/C, MNI, CMV, dengue), palu, sepsis grave
- lupus, SAPL
- thyroïde (Basedow, Hashimoto)
- hémato : Biermer, AHAI, lymphome, lymphoïde chronique
- allo-anticoprs (purpura post-transfu, foetal/néotal)
- consommation:
- CIVD : TPdiminué, TCA augmenté, fibriongne diminué, D-dimère augmenté -> choc, obstitqiu, **LAM3**
- microangiopathie thrombotique: anémie hémolytique, *schizocyte* -> SHU, PTT, HELLP (hemolysis, Elevetad liver enzym, Low Platelet )
- trouble de la répartition : hypersplénisme (séquestration) , transfusion massive, cirrhose, grossesse (dilution)
- secondaire
### PTI
- Enfant : contexte viral, plaquette < 5G, *numération et frottis RAS par ailleurs*, pas d'antécédent
- myélogramme inutile
- Adulte = élimination (myélogramme)
### Démarche
Confirmer
- < 150G
- frottis pour éliminer fausse thrombopénie, sous-estimation (plaquette de grande taille)
- recherche microcaillot
Cherche schizo (MAT), hyperlympho (viral), neutropénie/anémie (central), cellules anormales (blastes)
### Fausses diminution :
- agrégabilité
- des plaquettes entre elles (surtout EDTA probablement par exposition d'un site antigénique normalement caché avex ) -> frottis
- des plaquettes autour des neutrophiles (EDTA) : rare, signification clinique non connue
- agrégats mixtes plaquettes/neutro (EDTA) : rare, *in vitro* -> frottis (extrémités)
- Plaquettes géantes ( > seuil les différenciant des GR) -> frottis, canal optique
- pé-ana : perfusion, coagulation partielle, tube pas assez rempli (trop d'anticoagulant), trop rempli (difficulté d'homogénéisation), trop vieux (démarrage de la coagulation)
### Examens systématiques
- NFS sur tube citraté si date
- frottis
- EPS
- séro VIH, VHB, VHC
- bilan hépatique
- anticorps antinucléaire
- créatinine, hémature
- TP, TCA, fibrinogne
- groupe sanguin, RAI si sévère
# Hémogramme
## Lymphocytes
- Pancytopénie :
- périphérique : hypersplénisme, hémodilutation (auto-immun)
- central :
- moelle riche : carenceB12/folates, syndrome d'activaition macrophagiques, myélodyspasie, envahissement (leucémie, lymphome)
- moelle pauvree : aplasie (chimio, parvoris B19, Fanconi), myélofibrose
- Hyperlymphocytose : enfant = coqueluche, viral. Adulte = LLC, lymphoprolifératif autre
- Lymphopénie :
- iatrogène (immunosuppresseur, lithium, cortico),
- viral, VIH
- cancer, lymphome, radiothérapie
- auto-immun : lupus, sarcoidose
- IRC
- Polynucléose neutrophile
- physiologique (grossesse, effort, post-op)
- infection bactérienne
- inflammation chronique
- nécrose tissulaire aigüe
- iatrogène : corticoïdes, lithium, splénectomie
- hémopathie avec myélémie
- tabac
- cancer
- Neutropénie (< 0.5 G/L)
- centrale
- iatrogène
- infection : typhoïde, brucellose, hépatite virale
- aplasie, hémopathie malignes
- périphérique : hypersplénisme, trouble margination
- Monocytose (> 1G/L)
- réactionnelle : infection, inflammation (cancer..), régénération médullaire
- primitive : leucémie myélomonocytaire chronique/juvénile, leucémie aigüe monoblastique
- Myélémie : > 2%
- transitoire : infection grave, hémolyse, régénération (hémorragie, postchimio)
- chronique : SMP, métastase médullaire
## Erythrocytes
Cf anémie, polyglobulie
## Plaquettes
- Thrombocytose : inflammation, carence martiale, splénectomie/asplénie, post-chir, SMP
- cf thrombopénie
+++
title = "COFRAC"
date = 2024-01-15
+++
# Norme (version 2022, Patrick Joubaud)
## Contexte
- EBMD désormais dans la norme
- Reconnaissance par pair (= qualiticien et bio)
- Un organisme par pays (en Europe)
- COFRAC = association à but non lucratif (1994) avec salariés et personnes missionnées (400 qualité, 1400 technique)
- 4 sections dont santé humaine
- Début 2010 : ordonnance = un labo ne peut réaliser un examen de bio médicale sans accréditation (anapath aussi) selon 15189
- Loi 2013 : 100% des examens devaient être accrédités d'ici novembre 2020
- Loi 2020 : ce ne sont pas les examens mais les lignes de portées qui doivent être accréditées
- Ligne de portée
- découpage en domaine (bio med), famille (microbio, hémato, biochimi-génétique), sous-domaine (biochimie, génétique, hémato, imuno, bdr, micro) et sous-famille (pharmaco, génétique constit+++)
- dans une sous-famille, il y a des examens avec même nature examen et principe de méthode = ligne de portée
- ex hemato : recherche Ag (ABO) par hémmaglutination (ligne 1), recherche anticorps par hémagglutination (ligne 2)
- il peut y avoir plusieurs examens : ex en HLA où il y a plusieurs techniques (recherche anticorps HLA, phénotypage, HLA, crossmatch)
- pour chaque ligne, il y a un examen représentatif (arrêté 2021)
- Date limite dépôt demande accréditation : novembre 2021
## Nouvelle version = 2022
- transition : début évaluation octobre 2023 - fin mai 2025
- envoyer SHFORM 03
- envoyer plan de transition = analyse d'impact du changement
## Chap. 4 = exigences générales
- Impartialité :
- objectif, pas de conflit d'intérêt ->
- pour personnel, direction+++
- menaces : intimidation du fournisseur, manque d'objectivité (patient), pas d'indépendance pour audit
- analyse de risque à faire
- actions: signer document
- Confidentialité : personnel interne, mais aussi pour le directeur, SAV externe labo (signature contrat)
- Coût des examens à charge du patient
## Chap. 5 : structurel et gouvernance
- Directeur labo : peut déléguer mais à documenter. Garde la responsabilité ultime
### Prestation de conseil
- par le biologiste
- clinique, interprétation selon contexte, communiquer les bons résultats
Prescription :
- Loi : examen de biologie médicale sur une prescription avec des éléments cliniques pertinents
- Loi (2010) : peut faire d'autres examens que ceux prescrits ou une partie (sauf si prescription claire)
- Maintenant : n'a plus à en informer le prescripteur
- Loi : Il faut être le plus économe dans les ajouts
Pré-analytique
- non-conformité : majeur = non fait (problème d'identité en hémato), mineur = attente jusqu'à régularisation (heure du prélèvement en hémato), minime = fait sans correction
Analytique
- ex: recherche agglutinine froide (cyanose des extrémités+++) :
- si absence de renseignement, Coombs direct en 1ere intention. Si positif C3D, recherche agglutinines froides.
- basé sur bibliographie
- ex: RAI si daratumumab (interférence) = traitement par DTT
Post-analytique : interprétation, communication résultat
- notamment examens urgents (ex: groupe sanguin rare)
Traçabilité : compte-rendu, fiche-individu (EFS), mail, entretien téléphonique
## Chap. 6 : matériel, main-d'œuvre, personnel
Revue périodique des procédures mises en place
## Chap 7 : processus
Préanalytique : commence avec la *prescription* puis recueil données +/- consentement, prélèvement du patient, transport, réception, prélèvement, transport, réception, prélèvement
- Prescription :
- demande acceptée = contrat
- que faire si prescription orale
- examens complémentaires = demande écrite non obligatoire
- délai acceptable pour ajout
- absence de renseignement cliniques : le laboratoire doit les rechercher
Analytique
- fait selon recommandations fournisseur ou publié dans une revue scientifique (portée A) -> vérification de méthode
- écrire la procédure définissant les performances que l'on doit être capable d'atteindre
- étendue de la vérification suffisante d'un point de vue clinique
- ou faite maison (portée B) -> validation de méthode
- à justifier (besoin des patients, marché)
- ex de l'IH de l'EFS à Besançon (utilisation de tubulure de donneurs)
Vérification (portée A)
- Répétabilité : évolution d'un CIQ sur une journée (évolution du coefficient de variation) -> comparé par celui donné par le fournisseur ou sinon avec RICOS (publications)
- Reproductibilité : jour/condition différente avec un CIQ -> idem
- +++ cf GH GTA04
https://tools.cofrac.fr/documentation/sh-gta-04
- moyenne +/- 2DS sur une population de référence (95%) -> attention : si on prend une population de donneur de sangs, sont légèrement carencés
Validation méthode (portée B)
- si méthode maison, ou en dehors périmètre prévue
Garantie qualité : CIQ, EEG, comparabilité des résultats (si différente méthode ou machine)
## SH REF 02
- Complète et explique la norme
- Opposable
+++
title = "Bactériologie"
date = 2023-06-01
+++
# Antibiotiques
## Cibles
- inhibition synthèse de la paroi bactérienne = β-lactamine,
glycopeptides, fosfomycine
- synthèse ADN bactérien : quinolone, sulfamide
- synthène ARN : rifampicine
- synthèse protéines bactérienne : aminoside, macrolides, cyclines
![](/images/microbiologie/antibio-action.png)
## Mécanisme de résistance
- enzymatique
- modification de la cible
- impermeabilité
- efflux
![](../../images/microbiologie/antibio-resistance.png) Résistance
naturelle
- colistine: bactérie gram+
- vancomycine : bactérie gram -
- aminoside: anaérobie
### Synthèse paroi
1. β-lactamase
- Les β-lactamine inhibent la synthèse de la paroi bactérienne
(peptidoglycane)
- se fixent sur les PLP (protéine de liaison des pénicillines)
- mécanisme de compétition
- toutes les β-lactamines ont un cycle commun (β-lactame)
- les β-lactamase vont hydrolyse ce cycle et désactiver les
β-lactamines
2. Modification de cible : PLP
- S. aureus : mutation dans le gène mecA : la PLP mutée (=PLP2a)
ne permet plus aux β-lactamine de s\'y fixer
- Idem pour les PLP mosaïques des pneumocoque
- Idem pour les entérocoque (PLP5)
### Synthèse protéine bactérienne
![](../../images/microbiologie/antibio-ribosome.png)
- aminoside: mauvaise reconnaissance de l\'ARN messager (modification
de la cible)
- linezolide : mauvaise position de l\'ARNt (apporte les acides
aminés) (modification de la cible)
- macrolides : bloque la formation du peptide (\"tunnel\") (enzyme)
### Synthèse acide nucléique
- ADN gyrase va \"détordre\" la double hélice pour la transcription et
traduction
- quinolones vont empêcher cette action (modification de la cible)
## Notes
- β-lactamine inefficaces sur les mycoplasme car pas de paroi !
- glycopeptides inefficaces sur bactérie Gram négatif car elles ont
une membrane externe qui ne laisse pas passer les grosses molécules
- synergie β-lactamine - aminoside sur strepto et entérocoque :
destruction de la paroi par les β-lactamine pour que l\'aminoside
accède au ribosome
- seules les antibio pénétrant dans les cellules (macrolides,
fluoroquinolones, rifampicine, cycline ) sont actives contre les
bactéries \"intracellulaires \" (Chlamydia, Coxiella burnetti,
Rickettsia, Legionella pneumophilia, Brucella meltiensi, Bartonella
)
## Résumé
| |Péni G/V |Péni A |Peni A + inhib βlactamase |Peni M
| --------------------|----------------------------|--------------------------------------------|---------------------------------|---------------------
| Utile |Streptocoque |idem + pneumocoque péniS |idem + Staphylocoque metiS |Staphylocoque metiS
| |Corynebacterium |E. faecalis, Listeria monocytogenes |H. influenza + pénicillinase |
| |Diphteria |Neisseria menigitidis |Enterobactéries + pénicillinase |
| | |Entérobactéries groupe 1 |BNG anaérobies |
| Résistance nat |BGN |Entérobactéries groupe 2, 3; P. aeruginosa | |BGN
| Résistance acquise |Staphylocoque, pneumocoque |Staphylocoque +/- pneumocoque | |Staphylocoque metiR
| | |H. influenza, N. gonorrhea | |
| | |N. mengitidis | |
PéniM = oxacilline, cloxacilline PéniA = amox
| |C2G |C3G orale (1) |C3G injectable
|-------------|----------------------------------|--------------------|---------------------------------
| Utile |Streptocoque, Staphylocoque metS |Streptocoque |Streptocoque (dont pneumocoque)
| |Entérobactérie groupe 1 |entérobactérie 1,2 |Neisseria spp, entérobactérie
| | | |Haemophilus
| Résistance |Listeria, entérocoque |idem |idem
| |Staphylocoque metiR | |
| |P. aeruginosa, intracellaire | |
\(1\) limité car mauvais biodisponibilité
| |Carbapénème |FQ |Aminoside (2)
| ----------------------|------------------------------------------|---------------------------|--------------------------------------
| Utile |Entérobactérie, P. aeruginosa |Entérobactérie |Staphylocoque metiS
| |Entérocoque, Staphylocoque metiS |Intracellulaire |Listeria monocytogenes
| |Anaérobie |Staphylocoque metiS |BGN
| | |P. aeruginosa : ciproflox |Streptocoque, pneumocoque
| Résistance naturelle |P. aeruginosa, entérocoque: ertapénème ! |entérocoque, L. monocyt |strepto, pneumo: **bithérapie amox**
| | |anaérobie |anaérobie stricte
| Résistance acquise |carbapénémase |SAMR, gonocoque (1) |
\(1\) Pas de monothérpaie pour P. aeruginosa et Staphylocoque aureus
(risque mutants) (2) amikacine, gentamicine
| |Macrolides (1) |Lincosamide (2) |Métronidazole |Glycopeptide (3)
|---------------------|-------------------------------|------------------|-----------------------------------------|----------------------------
|Utile |Intracellulaire, streptocoque |Strepocoque |Anaérobie (sauf Acineto, cutibacterium) |Streptocoque, pneumocoque
| |Staphylocoque metiS |Staphylocoque |Parasite |Entérocoque, staphylocoque
| | | | |metiS/metiR
| | | | |Clostri
|Résistace naturelle |entérobactérie, P. aeruginosa |BGN, E. faecalis |Autres |BGN
|résistance acquise |staph, pneumocoque, strepo A |staph, strepto |
\(1\) erythro, azithromycine, clarithromycine (2) clindamycine (3)
vancomycine
## Interprétation
Entérobactéries
- Groupe 1: TRI = résistance amox/ticar/pipe + inhibiteur β-lactamase
- **Céphalosporinase** = **inhibée oxacilline**
- **BLSE** = inhibée par acide clavulanique =\> **\"bouchon de
champagne\"**
- synergie C3G/C4G - ticar + acide clavulanique
- ne touche pas les carbapénèmes
- cefoxitine non touchée =\> permet de différencer d\'une
céphalosporinase déréprimée (voir tableau)
| |Pénicillinase |Pénicillinase déréprimée |Céphalo sporinase |Céphalo. déréprimée |BLSE |Carba pénémase
|---------------|---------------|--------------------------|------------------|---------------------|-----------|----------------
|amoxicilline |R |R |R |R |R |R
|ticarcilline |R |R | |R |R |R
|piperacilline |I/R |R | |R |R |R
|amox+inhib β | |I/R |R |R |**S/I/R** |R
|pipe/ticar | |I/R | |I/R |**S/I/R** |R
|\+ inhib β | | | | | |
|C1G | |I/R |R |I/R |R |R
|C2G | | |I/R |I/R | |I/R
|C3G | | |I/R |I/R |I/R |S (OXA-48)/I/R
|C4G | | | | |I/R |S (OXA-48)/I/R
|carbapénème | | | | | |I/R
- AMX = amoxicilline
- TIC = ticarcilline
- PIP = piperacilline
- AMC = amox - acide clavulanique
- C1G = céfalotine (CF)
- C2G = céfoxitine (FOX)
- C3G = céfixime (CFM), céfotaxime (CTX), ceftazidime (CAZ)
- C4G = céfépime (FEP)
### MSLB
Résistance à l\'érythromicine
- sensible pristinamycine : regarder si induction (\"interaction\"),
si oui, MSLB inductible donc possible sélection de mutant.
- résistant pristinamycine : MSLB constitutif
## Piège
- SAUR sensible oxa mais résistance peni G =\> pénicillinase -\>
résistance à toute les pénicillines
- SARM = résistance à toutes les βlactamanes dont imipénème
- Aminoside
- résistance gentamicine =\> forcément résistant tobramycine,
amikacine, kanamycine
- résistance amikacine =\> forcément résistant kanamycine
- FQ : résistance à ofloxacine =\> forcément toutes les quinolones
## Aminosides
Action = bactéricide, concentration dépendant. Perturbe la synthèse des
protéine (fixation sous unité 30s des ribosomes) Résistances
- naturelle: anaérobie strictes et préférentielle (streptocoques,
entérocoques) par défaut de pénnétration car le système de transport
nécessite la force produite par les chaînes respiratoire aérobies
*NB: penicilline + amoniside passe car agit sur la paroi
bactérienne*
## Sulfamide
Bactériostatique (inhibe croissance) mais en synérgie devient
bactéricide Ex: sulfamethoxazole + trimethoprime (Bactrmie)
Mécanisme : inhibe synthèse microbionne d\'acide folique
## Fluoroquinolone
- 4 générations: initialement répartition extra-cellulaire -\> large
et homogène (intracellulaire) avec les dernières générations
- Élimination rénale et bile
- Effets indésriable nombreux : digestif, phototoxique, trouble
nerveur, inhibe cytochrme P450 (! interactions)
- Contre-indication : déficit G6PI, grossesse
- Action : inhibe réplication et transcription ADN
- Bactéricide, concentration dépendantes
- Indication :
- quinolones = cystite aigùe simple non compliquée, récidivantes
chez l\'adulte
- 2e génération : infetions sévères à bacille Gram négatif
- 3e et 4e génération : sinusite aigüe bactériennes, exacerpbation
pneumopathie communutaire, infection compliquée peau + tissus
mous
Résistante : en augmentatino chez entérobactéries (E. coli,
Klebsiella)
## Métronidazole
Pour anaérobie strictes
# Bactéries
## Staphylocoques
### Résistances
- β-lactamine : production pénicillinase (BlaZ)\> 90%
- résistance méticilline (staph coag négative \>\> aureus) via
- la Staphylococcal Cassette Chromosome mec (SCCmec) \[= zone
génomique comprenant *mecA* qui code pour la protéine PLP2a
- Nouveau gène mecC: code PLP2c
- S. aureus : 15-20% résistant méticilline
- Macrolides-Lincosamide-Streptogramine-Kétolide (MLSK) : modification
de la cible surtout (modification/mutation ribosome)
- phénotype MLS~B~: inductible ou constitutionnel
- 3 phénotype de résistance aux aminosides (inactivation enzymatique =
5% SAMS mais 80-90% SARM)
- glycopeptide : exceptionnel
### Staphylococcus aureus
Cocci Gram+ en amas : aérobie +/- anaérobie. Immobiles. non capsulé, non
sporulé
1. Facteurs de virulence
Associé à la paroi:
- **coagulase** liée = récepteur au fibrinogène, sur la paroi
bactérienne -\> diag (test d\'agglutination)
- protéine A: liaison aux immunoglobuline, protection contre la
phagolytose
Excrété
- hémolysine : lyse des hématies (β-complète)
- coagulase libre = excrétée, clive le fibrinogène -\> embole
septiques. Différence avec les staph. à coagulase négative (S.
epidermidis)
- staphylokinase : libère bactéries des emboles
- **toxine** :
- leucocidine de Panton et Valentine (LPV) -\> leucotoxique
dermonécrotique
- toxine du choc staphylococcique (TSST1-1 -\> activation
lymphocytes T)
- exfoliatines -\> érythrodermie bulleuses
- entérotoxines thermostables -\> TIAC
2. Habitat
- 30% porteur sain (transitoire ou non)
- Transmission intra-humaine par les mains ou indirectevement
(vêtements+++)
- Commensal : microbiote nasal, oropharyngé, digestif, cutané
(aisselles)
3. Clinique
- Porte d\'entrée = cutanée \<-\> site de portage/infection
- Infection communautaires, associées aux soins
- Infection toxiniques :
- LPV : infection cutanée, pneumonie nécrosante
- TSST1 = choc toxinique avec érythrodermie. Entrée = vaginale
ou cutanée
- exfoliatine: impétigo bulleux, syndrome d\'exfoliation
généralisée
- entérotoxine = diarrée à +2h ou 4h, TIAC
- Infections suppurative
- cutanée superficielle (furoncle, impétigo, folliculite) ou
profondre (abcèse, fasciite)
- bactériémie, endocardite
- infections profondes : ostéo-articulaire, pneumopathie,
neuroméningées (abcès)
4. Diagnostic
- Culture : non exigeante
- gélose sang 24h: **beta-hemolytique** (hémolyse total)
- Chapman (mannitol + NaCl) : rouge -\> jaune avec NaCl
- catalase +, oxydase-, DNAse + (à la différece des tretop à
coagulase négative)
5. Sensibilité et résistance
Résistance fréquent à l'hôpital
- β-lactamines :
- phénotype sauvage sensible
- pénicilinase \> 90% des souches (disque FOX de pénicilline
g): résistance pénicilline G, V, A -\> ajout d'inhibiteur de
β-lactamase
- SARM = gène mecA : PLP2 additionnelle -\> résistance à
toutes les β-lactamines **et imipénème**. Souvent
multirésistance aminoside, macrolide, fluoroquinolonie
- vancomycine en 1ere intention
- C4G possible mais pas en france
- Aminoside : sauvage sensible, résistance acquise par
inactivation enzymatique
- Glycopeptide : sauvage sensible, phénotype gIA/hétéroGISA avec
sensibilité diminusée, phénotype gRSA (résistance)
6. Traitement habituellement actifs
oxacilline, gentamicine (aminoside), vancomycine (glycopeptide)
### Staphylococcus non aureus
- = coagulase négative
- opportuniste, favorisé par immunodépression, cathé
- S. epidermidis = le plus souvent à l\'hôpital : matériel (prothèse,
valve dérivation)
- S. haemolytius
- S. epidermidis, haemolyticus = fréquemment multirésistante
- infections communautaire = S. saprophyticus (cystite) , S.
ludgunensis (infections cutanées, endocardite infectieuses)
- traitement : glycopeptide, rifampicine
1. Staphylococcus saprophyticus
- Cocci gram + en amas, catalase positive, nitrate réductase
négative
- Urine :rose sur milieu chromogène mais identification
spectromètre de masse/biochimiue
- Sensibilité nature à la plupart des antibiotique anti-staph
- Résistance naturelle : fosfomycine, acide fusidique, novobiocine
- Résistance acquise fréquente : péni G, érythromycine
## Campylobacter
- Répartition mondiale
- Une des cause les plus fréquentes des diarrhées infectieuses
bactériennes communautaires
- Microbiote digestive de nombreux animaux : *jejuni* = oisaux, /coli=
porc
- transmission animale -\> homme par **alimentation** : surtout
**jejuni**, **coli**, **fetus**
- très mobile pour survivre dans le tube digestif
### Pouvoir pathogène
- douleur abdo
- **gastro-entérique aigue fébrile** : (diarrhées aqueuse voire
mucosanglange, fièvre , vomissement)
- bactériémie
- syndrome de l\'intestin irritable
- syndrome de Guillan-barré
### Diagnostic bactério
- selles (copro): PCR, immunochromatographique
- sang (hémoc)
- examen direct : en forme de S, non sporulé, en \"vol de
moucheron\"
- culture : sélectif en microaérobie
- **oxydase+**, catalase souvent +
- MALDI-TOF
### ATBgramme
- résistance naturelle : vancomycine, pénicilline G, M,
céphalosporine, triméthoprime, streptogramine B
- acquise : érythro, tétracycline, quinolone, amox
### Traitement
- déshydratation
- si fièvre \> 38°, sang dans les selles, enfants, personnes agée,
femmes enceintes: **azithromycine**
- systémique : aminoside + {FQ ou beta-lactamine} sur documentation
### Prévention: hygiène (eau, alimentation)
## Proteus mirabilis
- Bacille gram négatif, **mobile**, oxydase négatif, nitrate-réductase
positive
- Brun sur milieu chromogène, β-glucuronidase et β-glucosidase
négative
- Désaminase positive, indole négative
- Sensible antibio actif sur bacille gram négatif
- Résistance acquise : pénicillinase, BLSE, céphalosporinase de haut
niveau, carbapénémase
## Pseudomonas aeruginosa
Bacille Gram négatif, très mobile
Origine : environnement++. saprophyte des milieux humides
**Opportuniste** : 10% des infections en hospitalisation
- infection nosocomiale (matériel) ou . 1ere bactérie en réa
- mucoviscidose: colonisation ou infection bronchopulmonaire chronique
Facteurs de virulence : exotoxine, exoprotéines, hémolysine Facteur
d\'adhésion Forte capacité à former des biofilms
### Quand réaliser un antibiogramme
- suspicion responsable d\'infection
- colonisation de patients fragile (ID, intbués)
- pulmonaire isolé de patients muco, BPCO, DDB
### Diagnostic {#diagnostic-1}
- Pousse 24h à 37% sur milieu non sélectif.
- Milieu sélectif : cétrimide
- Oxydase positif (!= entérobactéries) -\> test rapide pour
différencier les 2
### Résistance
Naturellement plus résistante que d\'autres Bacille gram -
- Catalase positif - lactose négatif
1. Résistance naturelle :
- amox
- C1G, C2G, **céfotaxime** (*! utilisé pour mécanisme*),
ceftriaxone, **ertapénème**
- anciennes FQ : nofloxacine, péflox, ofloxanie
- cotrimoxazole
- nitrofurantoine
- macrolides
- azithromycine
Association de plusieurs mécanisme (synérgie/complémentaire)
- β-lactamase AmpC (large spectre, inductible)
- enzyme modificatrice aminoside
- effluxs actif (mexAB-OprM, MexXY/OprM)
- imperméabilité (porine OpriF)
2. Résistance acquise
- Surproduction : efflux, β-lactamase AmpC, alétaration porine+++
- gène codant β-lactamase
- Attention: certaines souches accumulent des résultats
- β-lactamase transférable : pénicillinase, BLSE, carbapénémase
Quand chercher BLSE ?
- synergie ceftazidime/cefepime et acide clavulanique
- synergie ceftazidime/cefepime et impiénoèmeacide
clavulanique
Quand chercher carbapénémase ? (\> 90% cabarpénème)
3. Antibiotique
- β-lactamine:
- ceftazidime +/- avibactame
- ticarcilline +/- clavulatane, pipéracilline +/- tazobactame,
- céfépime
- ceftolozane + tazobactame
- imipénème, méropénème
- Aminoside
- FQ: ciprofloxacine, lévofloxacine
- colistine
## Streptocoques
Infections graves = *pyogenes*, *pneumoniae*. Commensal mais
opportunistes (immunodépression) : oraux (**endocardite**, SDRA)
### Classification
- Hémolyse : α partielle, β = totale.
- Lancefield : classification selon un composé de la paroi bactérienne
(polyoside C) avec mise en évidence de l\'antigène par
agglutination.
En première approximation :
- α-hémolyse = non-groupable
- *pneumoniae* résistance par chimérisme PLP (acquis)
- autres anginosus, mitis, sanguinis, bovis, salivarius, mutans
- β-hémolyse = groupable. Les plus importants
- Groupe A = S. pyogenes.
- Groupe B = S. agalactiae
- C : *dysagalactia* (rarement *equi*)
- G : *dysgalactia*, *canis*
*Note*: certaines sous-espèce de Lancefield peuvente être
alpha-hémolytique
### Résistances
- α-hémolytique : dépistage disque péniG: si résistant, CMI d'une
β-lactamine (amox/céfotaxime/ceftriaxone)
- **β-hémolytique: pas de résistance β-lactamine**
- S. pneumonia : 25% résistance acquise β-lactamine (sensibilité
diminuée)
- pas de β-lactamase
- MLSK (Macrolides-Lincosamide-Streptogramine-Kétolide): modification
cible++, efflux, protection ribosomale
- glycopeptide, linézolide : pas de résistance
### Classification d'Ambler
A. BLSE
- résistance pénicilline, C1, C2, C3G
- sensible inhibiteur β-lactamase et carbapénème
- détecté par ceftazidime + acide clavulanique
B. Métallo-beta-lactamases
- résistance comme B. + carbapénème
C. ampC céphalosporinase
- résistance BLSE + céfoxitine + inhibiteur β-lactamase
- sensible carbapénème
- détecté céfoxitine
D. oxacillinase
- sensible β-lactamase
### Streptococcocus pyogenes
Cocci gram+ en chaînettes, capsulé, non sporulé, immobile
Réservoire pharyngé. Transmission = aérienne, contact plaie infectée,
accouchement.
1. Facteurs de pathogénicité
résistance à la phacogytose
- protéine M
- encapsulation
Facteurs de virulence
- enzyme :hyluronidase, stroplysine O et S (favorisent l'invasion
tissulaire)
- exotoxine : activation et prolifération d'une sous population
lymphocytes T -\> cytokine proinflammatoires
- Streptolysine = hémolyse β-complète
- toxine érythrogène : hypersensibilité retardée à la scarlatine
2. Habitat
Strictement humaine, surtout pharyngé +- peau, vagin+++ Pyogène =
responsiable d'infections suppurées
3. Clinique
- non invasive = **angine** érythémateuse/érythémato-pultacée,
otite moyenne aigüe de l'enfant, scalratine, infection cutanée
- invasive : cutanée sévère (fasciite nécrosante), septicémie,
choc toxique streptococcique
- complications post-streptococciques (rare) = immunologique :
- rhumatisme articulaire, glomérulonéphrite aigüe, érythème
noueux
4. Diagnostic
- bactérie exigeante -\> gélose sang +/- ANC (inhibe Gram-)
- β-hémolyse
- Résistance optochine, sensbile bacitracine
- Catalase -, oxydase -
5. Sensibilité, résistance
- β-lactamine : sensible
- macrolide : sauvage sensible, résistance par mécanisme d'efflux,
modiifcation cible ARN23S
### Strepto agalactiae
-Pathogène n.1 des **infections materno-foetales** des pays
développement.
- périphérique = infection probable
- dans le sang ou lCR = infection certaines
- Mortalité 10%, séquelle 20-30%
1. Bactério
- c+ diplococque/chaînette
- aérobie-ana facultative
- catalase négative, **β-hémolytique**
- groupe B lancefield
2. Pathogènicité
- commensale digestif, génital 10-30%
- adulte : infection sujets à risque
- grossese : chorioamniotite, endométrite
- nouveau-né: infection néonat précoce \<7 j, tardive \> 7 jour
- transmission : sang (mère avec bactériémie -\> enfant), vaginal
(+/- rupture membrane)
- 2% nouveau-né des colonisé ont des symptômes
- pneumopathie
- septicémie, méningite (20%)
3. Résistance
- **Naturellement sensible β-lactamine** = 1ere intention
- Résistance bas niveau aminoside, synerige µ-lactamine
- 30% macrolide et clinda
4. Diagnostic
- Néonat : Hémoculture (référence), LCS, aspiration trachéale
- Mère : hémoc si \> 38°, PV
- ED, gram + gélose sang et chocolat 5-10% (croissanec \< 24h
habituellement)
- MALDI/sérogroupage de lancefield
- PCR possible (LCR++, respi)
5. Prévention
- Dépistage 34-38 semaines: culture (Granada) -\> antibio si +
- ATB per-partum péni-G/amox
- note: l'antibioprophylaxie marche chez les nouveau-né mais
seulement pour les infections avant 7 jours)
### Strepto. pneumoniae
Gram+ diplocoque encapsulé à multiplication extracullaire.
Classification selon la capsule (vaccins)
1. Habitat
Voie respiratoire supérieure Transmission goutelette, interhumaine
2. Pathogénicité
- adhérence cellules épithélium rhinopharynx
- facteurs de virulence non capsulaire
- évasion à la phagocytose
- actionation complément, cytokien inflammatoire
3. Résistance
- β-lactamine: Selon les PLP (!inutile d'ulitiser les inhibiteurs
de betalactamase)
- sensibilité possiblement dimunée aux fluoroquinolones
- Gènes mosaïque avec PLP chimérique
- 25% résistance acquise β-lactamine (pneumocoque sensibilité
diminué pénicilline)
4. Clinique
- Infection neuroméningée
- Infection voies respiratoire: pneumonie franche lobaire aigüe,
bronchopneumonie, otite, mastoïdite, sinusite, exacerbation BPCO
- Rare : purpura fulminas, endocardite
- Bactérimié, souvent à partir d'un foyer pulmonaire
## Entérobactéries
### Résistances et groupe
Groupe selon la résistance **naturelle** β-lactamine
1. aucune : E. coli, Proteus mirabilis, Salmonella
2. Pénicillinase à bas niveau : Klebsiella (pneumonia, oxytoca),
Citrobacer koseri, Shigella (!)
3. Céphalosporinase à bas niveau : Enterobacter, Serratia, Morganella,
Providencia, Citrobacter freundii, *Klebsiella aerogenes*
4. Pénicillinase + céphalosporinase : Yersinia enterolitica
5. β-lactamase à spectre étendu (BLSE): Kluyvera
Résistance acquises
### Escherichia coli
- Bacille gram négatif, mobile, oxydase négative, nitrase-réductase
positive
- Urine : rose sur milieu chromogène (β-glucoronidase positive)
- Sensbilité naturelles aux antibiotiques actif sur BGN
- Groupe 1 :
- céphalosporinase chromosomique de très bas niveau.
- Résistance acquise enzymatique : pénicillinase, β-lactamase à
spectre étendues, céphalosporinase de haut niveau, carbapénémase
### KES = Klebsiella, ENterobacter, Serratia
Vert (β-glucosidase +)
### Salmonelle, Shigelle
- Bacille gram négatif, non sporulé, aéro-anaérobie facultatif
- non exigeat
- catalase, nitrate réductase
- pas dans le microbite digestf normal de l\'homme
- porte d\'entrée digestive
- responsible de
- maladie du péril fécal (pays en voie de développement :
Salmonelle typique et non typqiue, Shigelle)
- TIAC : salmonelle non typhique \>\> shigelle
- rappel: TIAC\>= 2 cas, déclaration opligatoire
1. Pouvoir pathègene
- salmonelle :
- strictement humain = sér. Typhi, paratyphi =\> fièvre
(para)typhoïde
- animale = non typhique: gastroentérite
- shigelle : dysenteria+++ strictement humain =\> dysentérie
bacillaire, gastroentérite sanglante
2. Physiopath
**Entéro-invasif**
- shigelle : envahissement + destruction cellules épithéliales
(syndrome dysentérique)
- salmonelle : envahissement sans destruction de la muqueuse (sd
gastroentéritiques) +/- production de toxique
Clinique:
- salmonelle typhique: 1-2semaine incubation, fièvre continue
élevée 40\`, bactériémie, tuphos, diarrhée/constipation\`
- salmonelle non typhique: incubation 12-36h, diarrhée fébrile,
vomissement
- shigelle: incubation 1-3j, fièvre élevée, selle avec sang,
glaire, pus, douleurs abdominales violentes
3. Diagnostic
- selles +/- sang pour salmonelle (para)typhique
- diag moléculaire
- culture:
- \"SS\" (salmonelle/shigelle): salmonelle = lactose - et SH2+
- Hektoen, Drigalski (BG-) : lactos-, h2s+
- pour salmonelle : bouillon d\'enrichissement
- identification: **salmonelle non différencie d\'e. coli**
- shigelle = immobile
- shigelle = fermentation manitol ( sauf s. dysenteria )
- BG-
4. Traitement
- diarrhée infectieuse aigue = symptom
- antipyrétique,
- maintien hydro-élecrique
- régime sans résidu
- ! contre-indication ralentisseur du transite (lopéramique)
- +/- antibio si forme grave \> 3 ours, ID+++ :
FQ/azithromycique
- bactériémie : FQ/azithromycine,/ceftriaxone
Déclaration obligatoire : TIAC, fièvre (para)typhoïde Vaccination en
prévention salmonelle typfique
## Entérocoques
Cocci gram+ , anaérobie facultative, ressemblantà des streptocoques
Espèce majoritaire: E. faecalis = 80-90=, faecium = 5-10%
### Habitat {#habitat-3}
Ubiquitaire. Surtout tube digestif (homme, animaux), milieu extérieur
Home sain : tube digestif, périnée, parfois vagin, oropharynx
Pulpart des infections = à partir de la flère du patient. Mais exogène
possible.
Commensal gastrointestinal + génital chez les femmes Augmentation des
infections avec les années
### Facteurs de virulence {#facteurs-de-virulence-1}
- Pas d'exotoxine, ni de superantigène
- Protéine de surface -\> adhère à l'endocarde et l'urothelium -\>
endocardite et infections urinaire
### Résistance {#résistance-3}
- Naturelle : **céphalosporine**
- faecalis = résistance oxacilline, C3G, ertapénème, lincomycine,
acide fusidique
- **E. faecalis = sensible amox**. E. faecium = résistant 80-90%\*
- multi-résistance chez E. faecium
- aminoside (bas niveau)
- β-lactamine/glycopeptide seul = seulement effect bactériostatique
sur \> 90%. Mais aminoside + inhibiteur de la paroi (β-lactamine,
glycopepited, lipopetide) = synergie
- glycopeptide
- MLSK (Macrolides-Lincosamide-Streptogramine-Kétolide): modification
cible++, efflux, protection ribosomale
- en cas de résistance surajoutée, les aminosides sont inefficaces.
- attention aux entérococques résistant vancomycine (surtout E.
faecium): *vancA* *vancB*
### Clinique {#clinique-3}
- Infection urinaire
- Infection de la peau et des parties molles
- Endocardite
- Bactériémie
- Infection abdopelvienne
## Neisseria meningitidis
- Diplococque Gram - aérobie.
- Très gragile. Hautement variable
- Épidémio :
- 2 pics : nourisson \< 1 an (système immunitaire immature),
ado/jeune adulte (socialisation)
- ceinture de la méningite (Afrique sahel + subusaharienne)
### Habitat {#habitat-4}
réservoir 100% humaine. Transmission directement uniquement par
goutelettes Portage pharyngé, avec rarement invasion (sang +/- LCS) -\>
seulement souches
## Listeria monocytègene
Résiste à 4° ! \^
### Clinique {#clinique-4}
- non invasive = gastro
- invasive: **bactériémie**, neurolistériose, infection
materno-foetale avec forme néonatale précoce ou \> 7j
### Diagnostic {#diagnostic-5}
- hémoc, PL
- non exigeant
### Résistance {#résistance-4}
- résistance naturelle **C3G**, fosfomycine, quinolone
### Traitement {#traitement-2}
- amox + genta
## Haemophilus influenza
Résistance : regarder penicilline G
- suspicion beta lactamase, tester par cefinase
- PLP3 : faire CMI
# Classification
## Gram
- positif si paroi épaisse de peptidoglycane-\> coloration persiste
- négative si paroi plus fine qui permet à l\'éthanol de laver la
coloration
Aérobies
![](../../images/microbiologie/aerobies.png)
![](../../images/microbiologie/anaerobies.png)
![](../../images/microbiologie/autres.png)
## Catalase
oxydoréductase qui intervient dans la résistance à la bactéricidie par
le peroxyde d'oxygène
| |Catalase + |Catalase -
|----------------|-------------------|---------------
| |aérobies strictes |
|Cocci gram+ |staph |strepto
|Bacille Gram + |Listeria |Lactobacillus
| |Corynebacterium |
| |Propionobacterium |
## Oxydase
détecte les cytochrome de type c (pigments hémo-protéiques dans la
plupart des cellules vivante)
|Oxydase + |Oxydase -
|---------------|-----------
|Aeromonas |
|Bordetella |
|Branhamella |
|Brucella |
|Burkholderia |
|Campylobacter |
|Flavobacterium |
|Moraxella |
|Neisseria |staph
|Pasteurella |
|Plesiomonas |
|Pseudomonas |
|Vibrio |
## Mobile :
- Monotriche = 1 cil (triche = poil) -\> va dans une direction à
l'examen direct **pseudomonas**
- Céphalotriches: un cil à chaque extrémités
- Lophotriches: un cil à chaque extrémités
- Péritriches : cils tout autour -\> mouvement désordonné
- cocci gram + : non (sauf Enterococcus casseliflavus, gallinarum;
Vagococcus, Planococcus)
- Bacille gram+ : Listeria (tournoyante) , Bacillus (ondulante)
- Bacille gram- :
- Vibrio, Aeromonas
- Legionella
- **Entérobactéries** : sauf Shigella, Klebsiella
## Fermentant
BGN:
- non fermentant = environnement (pyo)
- fermenant le lactose = entéro (commensal)
# Culture
- Gélose au sang = non sélectif. Pouvoir hémolytique
- Bouilon Schaedler = bactéries anaérobie et exigeantes (incubation
10-14jours en anaérobie) → prélèvement profonds, IO
- Chromogène urinaire = non sélectif
- rose = activité β-galactosidase
- bleue = activité β-glucotosidase
- violet = les 2
- brun = tryptophane désaminase
## Autres
- BCSA : inhibe gram+ → Burkholderia
- BCYE : Legionnella
- CAP (colistine + aztreonam) = inhibe Gram - → streptocoque+++,
listeria, corynebacterie, uropathogène émergents NB: aztreonam
inhibe pousse proteus, pseudomonas
- Cétrimide (ammonium) → P. aeruginosa (production pycyanine)
- Chapman : NaCL, mannitol
- jaune = fermente mannitol → S. aureus
- Chocolat enrichi : bactéries exigeantes (prélèvement profond)
- Drigalski : inhibe Gram+, lactose →
- jaunes = BGN fermentant lactose = escherichia, citrobacter,
enterobacter, klebsiella
- bleu = BGN ne fermentant pas le lactose = serratia, salmonella,
shigella, proteus, yersinia, pseudomonas
- Granada (MTX) : inhibe Gram - → S. agalactiae
- HAE2 : inhibe bactéries gram + → Haemophilus spp. Prélèvements
respiratoires et génitaux
- Haja-Kligler : lactose en haut, glucose en bas une bactérie va
d'abord fermenter le glucose (en bas) puis le lactose (en haut).
Donc lactose+ et glucose- n'est pas possible. Passe au jaune si
acide. Exemple:
| |Bas |Haut
|------------|-------------------|------------------
|Shigella |glucose+ (jaune ) |lactose- (rouge)
|Pyo |glucose-(rouge) |lactose-
|Salmonelle |noir (H2S) |noir
|E.col |glucose+ |glucose+
- VCAT : Neisseria (Vancomycine, Colistine, Amphotéricine,
Triméthoprime)
### Coproculture = Salmonelle, Shigelles, Campylobacter
- Gélose Hektoen : inhibiteur de gram+, sucres (lactose, saccharose)
- centre noir = formation de H2S →~Salmonelle~
- vert/bleu = pas de fermetation → Salmonelle/Shigelle
- jaune/orange = fermetation
- Bouillon sélénite (inhibe coliforme + entérocoqu, enrichi pour
Salmonelle)
- Gélose Salmonelle-Shigelle : inhibiteur gram+, _lactose_
- centre noir = H2S → Salmonelle
- jaune = pas de fermentation → Salmonelle/Shigelle
- rose/rouge = fermentation lactose
- Gélose sélective Campylobacter (inhibe Gram+, Gram-, champignon)
- Yersinia: mannitol, inhibiteur GRam+ (dont Proteus), Gram- (dont
Pseudomonas aeruginosa)
- rouge = fermente mannitol → Yersinia
# Hémocultures
## Contamination ?
Probable si
- positivé lente, cathé (50% réa),
- espèce = staph épi, stap coagulase négative (sauf lugdu !), coryne,
strepto α-hémolytique, cutibacte, bacillus
Règle :
- 1 positif parmi 3 paires \[prélèvement unique/multiple\] = probable
faux positif
- \>= 2 positifs parmi 3 paires \[prélèvement multiple\] = vrai
positif si clinique non expliquée par autre infection, matériel
- \>= 4 positifs parmi 3 paires \[prélèvement unique\] = idem
- autre = difficile
## Négative
- volume insuffisant, antibiothérapie
- non cultivae : mycobactérie, candida, filmanteux, intracellulaire
(rickettsia, coxiella)
## Bacille gram négatif
penser
- bacillus
- corynebacterie
- listeria
- si ana: campylo
## Résultat intermédiaire
- pyo = ceftazidime
- polymicrobine = revoir antibio
- entérobacter groupe 3 = céfépime car risque élevé de
céphalosporinase hyperproduite
# Maladies infectieuses
## Physiopathologie
- Inhalation d\'aérosole depuis source hydrotellurique
- Homme = hôte accidentel avec multiplication intracellulaire
- Facteurs de risque:
- eau contaminée Légionella + aérosol (sanitaire+++)
- eau chaude insuffisament chaude ou froide mais pas assez
## Importance
- peu fréquente
- risque épidémique
- β-lactamine insuffisante
## Clinique {#clinique-5}
Non spécifique mais y penser si
- hyponatrémie + insuffisance rénale +cytolyse hépatique +
rhabdomyolyse + CRP élèvée
- extra-pulmonaire : neuro (confusion), diarrhée, insuf rénale
- pas d\'amélioration sous β-lactamine
## Diagnostique
1. antigénurie
- si positive = confirmé : culture échantillon respiratoire
(épidémio)
- sinon : PCR échantillion respiratoir (immunodéprimé++)
Attention: Antigénurie =
- seulement type 1 (85%) -\> PCR si négatif/suspicion
- persiste (parfois 1 an !)
Culture = croissance lente (3-5 jours), sur BCYE
## Antibiotique {#antibiotique-1}
- macrolide (azithromycine) si peu sévère 7-14 jours
- sinon FQ ou assoication 2 parmi macrolide, FQ, rifampicine
- pas de résistance décrite !
## Déclaration obligatoire !
## IST
### Chlamydia trachomatis
- 19 génovars
Trachome oculaire Infection urogénitale sexuellement transmissilbse
**1ere cause d'IST**
1. Clinique
- Infection urogénitale basse/haut: **urétrite** (homme),
**cervicite** (asympto souvent), endométrie, salpingite
- lymphogranulomatose vénérienne : régions tropicale, ulcération
génitale, adénite inguinale; anorectite HSH
- opportuniste : rare (grossesse, immunodépression)
2. Résistances
- naturelle = amonisode, glycopeptitde
3. Traitement
- Doxycycline (ou azithromycine pour IST non compliqué)
- infection génitale haute : doxycycline + autre
- **dépister IST**, traiter partener, rapport protégé
4. Diagnostic
- **Direct** = PCR, Transcription-Mediation-Amplification
- remboursé, sensbilité \> 95%
- Sérologie : biland infertilité, LGV (immunofluorescence, ELISA)
- culture peu sensible, antigène non recommandé, pas de test de
sensibilité antibio en routine
### Mycoplasmes urogénitaux
4 espèce
- *ureaplasma* spp = commensal tracture urogénital
- *mycoplasma genitalium* = IST, non commensal
1. Clinique
- Infection urogénitale basse/haut: **urétrite** (homme),
**cervicite** (asympto souvent), endométrie, salpingite
- lymphogranulomatose vénérienne : régions tropicale, ulcération
génitale, adénite inguinale; anorectite HSH
- opportuniste : rare (uértrire masculine, salpingite, grossesse,
immunodépression)
2. Diagnostic
Myc. genitalium
- **direct** non inscrit à la nomenclature : PCR, TMA
- test de résistance macrolie moléculaire : gène codant ARNr23s
- pas de culture (fastidien)
Myc. hominis, Ureaplasma spp
- **direct**: culture milieu spécifique liqui/gélosé (! pas de
gram car pas de paroi)
- TAAN : infection génitale haute/extra-génitale
Prélèvement:
- pas de prélèvement cervico-vaginal pour Ureaplasma et m. hominis
! (commensal)
- site stérile; homme=urètre, sperme, urine (1er jet); NN =
endotrachéal, liquide gastrique
3. Résistances
- naturelle : β-lactamine, glycopeptitde, fosformycine,
rifampicine
- Ureaplasma : lincosamide
- homiis : certains macrolife
- acquise :
- M. hominis, Ureaplasma: tétracycline (gène *tet*) surtout
+/- fluoroquinolones (3%)
- M. genitalium : macrolides++ !traitement de première
intention!, fluoroquinolones
4. Traitement
Myc. genitalium
- non compliqué : azithromycine
- sinon : moxifloxacine
- **dépister IST**, traiter partener, rapport protégé
Myc. hominis, Ureaplasma
- infection urogénitale: tétracycline
- néonat/grosses : macrolide
- immunodépression: tétra + fluoroquinolones
## Angines
- Virale 60-80%
- Bactérie: S. pyogenes surtout (strepto β-hémolytique)
- Test rapide : positif = en faveur strepto
- Possible de faire un prélèvement de gorge
- culture milieu enrichi 48h: β-hémolyse + MALDI TOF
- antibiogramme: sensible β-lactamines
- Cause rare :
- angine ulcéro-nécrotique : ED = fusiofrme + bactéries spiralées
- pseudomembraneuse (Corynebacteium diphteria: culture gélose
enrichie + CNR)
## Meningite
Étiologie
- virale = 90%, entérovirus 70-90%, bénigne, arrêt des traitements
antibactériens
- bactérienne : 1300cas/an, selon âge/terrain, grave, diagnostic et
traitement **urgent**
### Bactérienne
- Envahissement LCR par bactéries
- Virale sans encéphalite = habituellement bénin, guérit spontanément
- Bactérien = pronostic vital engagé à court term +/- séquelle neuro
- Ttt = ATB IV forte dose
1. Physiopathologie
- passage dans le sang : depuis
- oropharynx (enfant, adulte)
- tube digestif (E. coli, strepot agalactiae) (néonat \> 72h)
-ou via placenta si bactériémie par la mère \[Listeria\]
(néonat)
- autres : brèche ostéoméningée, complication infection systémique
(borréliose..)
2. Clinique
- Communautaire = \> 39° + syndrome méningé (céphalé, raideur
nuque, vomissement, photophobie)
- Néonat : non spécifique =\> PL si fièvre sans cause évidente
- Méningoencéphalitue : +signe neuro/psy
3. Épidémiologie
- enfant, adulte : **Neisseria, Strepto pneumo** +/-- H.
influenza, strepto pyogenes, agalactiae, listeria
- néonat : **Strepto agalactia**, E.coli,
- Autres : Lyme, leptospirose, syphilis, immunodéprimé
### Virale
Diag différentiel =
- bactériennes~~+~~, parasitaire, fongique
- néoplasique, inflammatoire, dysimmunitaire, toxique
1. Détection génomique spécifique
2. Étiologies
- **Entérovirus= 90% des cas**
- été, automne
- 70% sont des enfants
- tous les types peuvent être respnsable de méningite mais
certains types peuvent être associés à des formes sévère
- bénignes mais formes graves possible (nouveau-né,
immunodéprimé)
- diag = RT-PCR entérovirus dans LCS. Si négatif : gorge,
selles, aspiration (attention à l\'excrétion prolongée..)
- parechovirus : enfant \< 2ans
- RT-PCR LCS, sang
- traitement sympto
- HSV2: éruption génitale, ATCD
- PCR spécifique CLS
- traitement : immunodéprimé +/- immunocompétent
- VZV : zona, paralysie faciale
- PCR spécifique
- traitement : immunodéprimé +/- immunocompétent
- autres:
- oreillons (parotidite, vaccins): RT-PCR dans LCS, ttt
symptomatique
- primo infection VIH (prise de risque): 10% primo-ifection.
Diag = séro +/- charge virale
- LCMV (rongeur), arbovirus (voyage - West nile)
3. Herpétique
- **mortelle dans 70%** =\> urgence thérapeutique
- la plus fréquente des encéphalite sporadiques Diagnostic = PCR
sur lCS
1. Physiopath
- muqueuses de la fac -\> lance ganglion trijumeau. Rarement
accès SNC (via muqueuse nasale ?)
- lésions cérébrales : focales (temporales, uni -\>
bilatérales)
- éncéphalite pure -\> méningo-encéphalite
2. Clinique
- Début progressif, fière \> 48h
- Céphalées, nausées vomissement
- Aphasie, désorientation, conscience
- Crises convulsives focale -\> génralisé
- Déficit neuro focalisé. **Cherche signe HTIC =
contre-indication PL**
3. Biologique
- PL: 5-5000 élément, majoritairement lymphocytaire;
glycorachie normale, protéinorache modérément élevée
(\<1.5g/L)
- **PCR HSV** si encéphalite + méningite lymphocytaire. La PCR
doit pouvoir différencier HSV1 et 2 (2 = exceptionnel sauf
nouveau-né)
- **PCR peut être négative initialement** : répétér à
48/72h
- Sérologive : utile chez l'enfant (sang + LCS)
4. Autre
- EEG = focal (temporal), imagerie = focal (temporal),
nécroto-hémorragique
5. Traitement
- **Après la PL, sans attendre**: aciclovir IV 15 jours
- contrôle par PL : seulement si non amélioration clinique :
si PCR positiv, poursuite 7j
### Examens
- Cytologie :
- bactérienne \> 500/mm^3^ (rares cas sans pléiocytose en début
d\'infection)
- virale = pléiocytose modérée (500 en moyenne)
- MGG après centri :
- bactérie = majorité de PNN
- virus, mycobactérie = majorité mononuclé/lympho
- virus, listeria, brucella = mixte (panaché)
- Biochimie :
- bactérie: CRP, PCT élevé, protéinorachie \> 1G/L,
glycorachie/glycémie \< 0.5
- virale : protéinorachie normale/modérément éleée,
glycorachie/glcyémie normale \> 0.6 (attention: **absence de
pléocytose parfois**)
- Gélose sang cuit + vitamine sous CO~2~ +/- anaérobie, bouillon
d\'enirchissement
- Gram:
- Cocci G+ diplocoque/chainette : strepto pneumonia, agalactiae
- Cocci G- diplococque : Neisseria meningitidis
- Bacille G+ : listeria monocytogenes
- Bacille G- : Haemophilus, E.coli, Brucella, salmonella Attention
: culture peut être négative si ne pousse pas sur milieu usules
(Tuberculose) ou décapité ATB
1. Neisseria meningitidis
- Sensibilité diminués pénicilline (PLP) 25 =\> **CMI péni G,
amox, céfotaxime**
- Aérobie strict. Fragile. Commensal oropharynx. Humain
- C3G IV, **déclaration obligatoire**, **rifampicine cas contact**
+/- vaccins
- Prévention : vaccin sérogorupe C mais pas pour le B+++. Voyage :
A,C,Y,W
2. Streptococcus pneumoniae
- Aéro/anaérobie, fragile, commensal oropharynx
- Sensibilité diminués pénicilline (PLP) 30-60% =\> **CMI péni G,
amox, céfotaxime**
- C3G IV + cortico. Pas de prophylaxie.
- Vaccin 13 sérotype
3. Néonatal
- maternofoetal ou transmission tardive (\>72h) par
IU/translocation digestive
- Amox si strepto agalactia, céfotaxime si E.coli (50%
pénicillinase), amox si listéria (résistance céphalo)
## Infections urinaires
- Tractus urinaire stérile, extrémité distale de l'urètre colonisé
- Pénétration des bactéries : à partir de l'urètre (ascendant), plus
rarement sur sonde, endoscopie, chirurgie
- Facteurs prédisposants : calcul (obstactle), hypertrophie prostate,
malformation voie urinaire, grossesse, diabète+++
### Démarche
- autre : risque de complication, PNA; dépistage pour grossesse, chir
; échec traitement; \> 4 épisodes par an -\> EBCU (bactérie +
antibiogramme)
- cystite simple : bandelette urinaire : leucocyte, nitrite. VPN chez
la famme, VPP chez l'homme
1. ECBU: préanalytique
- Prélèvement
- Naturel : lavage main + toilette, urine 2eme jet
- jeune enfant : collecteur d'urine +\*/ cathéter/ponctio
sus-pubienne
- Sonde: jamais dans le sac prélevere, recueiller après
désinfections sur site dédié. Ne pas envoyer sonde
- Conservation:
- tube stérile 2h à température ambiante, 12h cyto, 24h à 4° pour
culture
- tube borate: 48h si _bien rempli_
2. Analytique
- cytologie : manuel/automatique
- Gram : non obligatoire, peu sensible mais permet d'identifier
une contamination, d'orienter les milieux d'ensemencement
- ensemencement : chromogène +/- sélectif pour Gram positif,
levures+++. 16-24h à 35°, 48h si croissance lente, discordante.
### Groupes
_Groupe 1_ : **Seuil = 10^3^**. Critères majeurs de
pathogénicité (e.g adhésion à l'épithelium urinaire) -\> responsable si
urine non contaminé, même en petite quantité
- **E. coli** (75%-80% des cystites simples)
- **S. saprophyticus** (cystites aigües communautaires chez femme de
15-30ans)
- Salmonella spp.
- mycobactéries
- leptospire
_Groupe 2_ = **Seuil = 10^3^ homme, 10^4^ femme**. Plutôt IU
associées aux soins si facteurs anatomiques/iatrogènes
- entérobactéries (Proteus, Klebsiella, Enterobacter, Citrobacter,
Morganella, Providencia)
- Pseudomonas aeruginosa
- Enterococcus
- Aerococcus urinae
- Staphylococus aureus
- Corynebacterium urealyticum
_Groupe 3_: **Seuil 10^5^**. Implication discutée. Nécessite
bactériurie élevée + 2 échantillons + critères clinique + inflammation
- Gram + : Streptococcus agalactiae, staph à coagulase négative autre
de S. saprophyticus
- entérocoque avec E. coli
- Gram - : Acinetobacter, Oligella urethralis, Stenotrophomonas
maltophilia, Burkholderia cepacia
- Candida
_Groupe 4_ : **Seuil: non**. Contaminant
- lactobacillus (sauf L. delbrueckii)
- streptococques alpha-hémolytique
- Gardnerella vaginalis
- bacilles corynéforme (sauf C. urealyticum et C. seminale)
### Étiologie
- E. coli = 50 à 95% (communautaire ou associé au soin)
- S. saphrophycitus : 5-20% IU communtaire, surtout chez la femme
jeune
### Virulence
- Capacité de colonisation + invasion des cellules urothéliale
- Biofilm
### Interprération
|Dispositif |Clinique|Leucotyurie|Bactéurie |IU |Antibiogramme
|-----------|--------|-----------|-----------|---------------------|---------------
|Non |oui |oui |cf seuils |oui |oui
| |non |oui/non |\>= 10^3^ |colonisation |non
| |oui |non |cf tableau |débutant/neutropénie |oui
|Oui |oui |NC |\>= 10^5^ |oui |oui
| |non |NC |\>= 10^3^ |colonisation |non
- **colonisation** femme **enceinte** avec bactérurie \>= 10^5^
groupes 1 à 3\* : antibiogramme !!
- si invasif : significatif si \> seuil
Clinique \> biologique (décapité par antibio, croissance lente)
### Uropathogènes emergents
- (Gram+): Aerococcus spp, Actinotignum shaalii, A. omnicolens et L.
delbrueckii
- chez \> 65 ans, \< 3 ans et patho urologie (sauf cancer vessie et
prostate) -\> à chercher dans ce contexte
## Gastro-entérites
Principale complication = déshydratation
### Virale
- Transmission : féco-orale direct (interhumaine) ou indirecte
(aliments, eaux, environnement)
- Faible nombre de particules ingéres pour entraîner une GEA
- Virus non enveloppé résistant à l'acadidé gastrique
- toutes tranches d'aĝe mais le plus souvent enfant en bas âge
- multiplication dans les entérocytes de l'intesting grêle
- infections le plus souvent courte avec diarrhé, douleur abdo,
vomissement
- greffés/transplanté: peut devenir presistant/chronique
- incubation courte, excrétion virale prolongee
- Immonoenzymatique, trousses commerciales (ELISA, tests unitaire),
PCR temps réel
- immunoenzymatique: très spécifique, sensible pour rota, adéno et
astrovirus mais pas pour la détection des norovirus -\>
technique plus sensible
1. Rotavirus
- Réservoir humain (animaux pour rotavirus spécifiques)
- Transmission : féco-orale, interhumaine, par les mains ou objets
contaminés par des feces/vomissure. NB: perte de son
infectiosité en milieu humide
1. Structure
Capside icosahédrique, non enveloppé, ARN double brin
2. Épidémiologie
- groupe A:
- France, enfant \< 5 ans 140 000 consultations, 18 000
hospitalisaiton, décès exceptionnel
- **1ere cause de diarrhée aigùe de l'enfant \< 5 ans**
- 1ere cause d'infection nosocomiale en pédiatrie, 27-32%
nosocomiales selon les pays
- monde = 29-45% hospitalisation pour diarrhées sévères,
600 000 morts/an (pays bas/moyens revenus)
- adulte/enfant plus gế : réinfetion commune mais clinique
très modérée. Surtout un vecteur de transmission
3. Physiopathologie
Lésions des entérocytes matures de l'intesting grêle
(multiplication du virus) : dérégulation puis destruction.
Mécanismes :
1. sécrétion eau, électrolytique -\> diarhée sécrétoire
2. lyse cellulaire , perturbation des fonctions enzymatique -\>
diarrhée de malabsorption et osmotique (résidus glucidique
dans l'intestin)
4. Clinique
- variable : asymptomatique - diarrhées
malabsorption/sécrétoire
- incubation \< 48h
- symptomes de 1 à 4 jours. NB: excrétion du virus peut
précèder de quelques jours et persister 8-10 jours
- infections asymptomatique habituelle de 1 à 3 mois
(immunité maternelle) (NB : immunité secondaire chez
adulte)
- diarrhée
- aqueuse non glairo-sanglante (parfois explosive),
vomissement, douleur abdo, hyperthermie modérée 38°
- intensité = variable
- consistance variable (molle - liquide)
5. Diagnostic
- Test immo-chromatographique
- Test immuno-enzymatique (ELISA) = détection antigène dans
les selles (anticorps monoclonaux)
- RT-PCR, RT-qPCR
2. Norovirus
1. Structure
Capside, non enveloppé, **simple brin** (≈ ARN messager)s
2. Transmission
- Féco-orale, vomissure, persone-personne (EHPAD+++),
souillures, projection, aérosol (eau++)
- Très infectieux
- Contagion possible par sujet asymptomatique.
3. Épidémiologie
- Souvent sous forme d\'épidémie.
- Surtout en hiver
- **\> 85% des épidémies de GEA non bactériennes quelque soit
l'âge**
- Problème de santé publique : infections nosocomiale, EHPAD
- **Le virus le plus fréquemment responsable de TIAC** (eau
souillée, personne porteuse) : 10-26% des cas
Attention: persistance excrétion virale semaine après la
guérison
4. Physiopathologie
- Probablement réplication jejunum : atrophie villositaire -\>
malabsorption transitoire (altération système enzymatique
des entérocyte)
- invasion épithélium par lymphocytes T CD8+
5. Clinique
- Bénin chez adulte/enfant bonne santé (très rarement
déshydratation)
- Plus problématiques dans certains pays (= aussi sévère que
rotavirus)
- Incubation 4-77heures
- Nausée, vomissement, diarrhée, fièvre modérée douleur
abdominale
- Diarrée liquide sans mucus/sang/leucocyte
- mortel chez les personnes fragiles (nouveau-né, greffé,
immunodéprimé)
- Infections chroniques parfois sévère chez l\'immundodéprimé
(perte de poids, déshydrataition+++)
6. Diagnostic
- test immuno-chromatographique: spécifique, peu sensible
- standard = RT-PCR, RT-PCR en temps réels
7. Traitement, vaccination
- Pas de traitement antiviral
- Prévention = lavage des mains, désinfection surface, hygiène
du voyage, hôpital = idem
- Pas de vaccin
3. Adénovirus
- Transmission féco-orale, **respiratoire**
- Plutôt communautés, possiblement nosocomiale
- Endémie avec pics (hivers, printemps)
1. Structure
Capside, non enveloppé, double brin
2. Épidémio
- toute l'année (épidémique ou sporadique)
- **3-6% GEA infectieuses du nourrisson**
3. Physiopatho
- Largement répandu dans la population mais pas d'immunité
- Lyse cellule
4. Clinique
- Immunocompétent : **oculaire** (conjonctivite,
kérato-conjoctivite), **respiratoire** (ppharyngite,
bronchite, pneumotahie), **digestif** (gastro)
- Immunodéprimé : dissiméniation (pneumonie,
méningoencéphalite, héptatie) ! potentiellement mortel !
5. Diagnostic
- Formes graves chez l'immunocompétent, dépistage chez
immunodéprimé
- PCR quantitative/qualitative, test rapide antigénique
6. Traitement
Cifodovir = IV, nombreux effets indésirable
7. Prophylaxie
4. Astrovirus
1. Épidémio
- épidémies en hiver, surtout nourrisson
- 1-4% GEA enfant et adulte
2. Physiopatho
Entérocytes matures , sommets des villosités
3. Diagnostic
ELISA RT-qPCR
5. Modalités du diagnostic virologique des GEA virales
- forme sévère de l'enfant: recherche rotavirus
- porteur asymptomatique en pédiatrie
- enfant/personne âgée avec symptômes en hospitalisation +
symptôme (prévenir infection nosocomiale)
6. Stratégie des examens microbiologiques face à des cas groupés de GEA
- immunodétection ou PCR temps réel -\> noro, rota, adéno,
sapovirus, adénovirus
- Origine alimentaire/hydrique = norovirus le plus souvent -\>
recherche norovirus
7. Principales mesures d'hygiène permettant de lutter contre une
épidémie de GEA
Port de gant, lavage des mains, décontamination des surface
- Désinfection des surfaces contaminées (rotavirus)
- norovirus :
- règle d'hygiène en voyage
- lavage main savon + hydroalcoolique, nettoyage des locaus,
prélèvement régulé, isolement des patients à risque
## Diarrhées
### Clostridium difficile
- Bacille gram positif à bout carré, spores subterminales
- Anaérobie strict
- 1re cause diarrhées associées aux soins
### Préanaytique
- seulement si diarrhée et \>= 3 ans
### Pathologies associée
- diarrhées : 10% nosocomiale, 10-25% post-antibio
- colite pseudo-membraneuse 95%
- complications: mégacôlin toxiuqe, perforation, choc toxique
- portage **asymptomatique**: 20-70% **nourrissons jusque 3 ans**,
adulte \< 3%
### Facteur de virulence
- **toxines** A, B, adhésien, enzymes, spores
### Diagnostic {#diagnostic-12}
- diarrhée + toxine selles ou souche toxinogène
- ou colite pseudo-membraneuse
- référence (fastidieux) = culture toxigénique, test de toxicité en
culture
- glutamate déshydogénase (GDF) par immuno-enzymatique = très bonne
VPN =\> souche toxigène ou non
- recherche des toxine A et B: PCR (sensible mais peu spécifique) ou
immunoenzymatique (spécifique)
=\> (GDH + ou PCR+) et toxine immuno + = diag
### Post-analytique
- pas de contrôle
- 6 jours redondance
### Traitement {#traitement-7}
- arrêt antibio si possible, éviter ralentisseur transit, correction
hydroélectrique
- **pas d'antibiogramme** = sensible métronidazole + vanco
- hygène = **contact**, isolement, lavage **mécanique** des mains,
**Javel**. Isolement levé 48h après arrêt des diarrhées
### Virale
GEA Adulte : norovirus \> rotavirus \> adénovirus \> astrovirus
### Rotavirus {#rotavirus-1}
- 1ere cause de gastroentérite aigüe chez l\'**enfant** \< 5 ans.
Touche également adulte (ID, voyageur, contact enfant)
- Épidémies hivernales 6-24mois
- pas de vaccin
### Norovirus {#norovirus-1}
- 1ere cause de diarréhes virale chez l\'**adulte**, 2e cause enfant
\< 5 ans
- Clinique:
- début brutal, asympto 1/3, durée 12-60h, incubation courte (1-2
jours)
- immunodéprimé : risque diarrhée chronique
- épidémies++ (collectivités)
- critères de Kaplan = vomissement \> 50% sujet, incubation moyenne
1-2 j, durée 12-60h, pas de bactéries à la coproculture
- diagnostic selle : RT-PCR, 3 à 5 échantillonls. 50% positifs pour
conclure
- précaution contact (gants, SHA, javel), arrêt maladie 48-72H après
symptômes
- vaccin: 6semaine-6mois de vie
### Autre {#autre-1}
- Astrovirus : GEA modérée, tous les âges
- Adénovirus (40-41) : test rapide/RT-pcr, ttt sympto
## Endocardite infectieuse
- Rare (5cas/million), grave (20% décès)
- Souvent iatrogène
- Traitement difficile (biofilm)
- **Gram positif**
- staph aureus/coag négative : cutané, cathéter, toxico IV
- strepto : bucco-dentaire, digestif
- entérocoque = digestif, urinaire
- HACCEK = bucco-dentaire \[Bacille gram neg croissance lente +
physio = Haemophilus, Actinobacillus actinomyc, cardiobacterium
hominis, capnocytophaga, Kingella kingae\]
- candida = cathéter, toxico
- Diag: critère de duke pour hémoculture : 2 positive à germe typique
ou \>2 à germe atypique
- négative dans 5-10% E
I
## Infections cutanées
Localisation
- Épiderme = impétigo
- derme = furoncle/anthrax (racine du follicule), abcès, phlegmon,
dermohypedermite, érysipèle
- fasciite nécrosante
Primaire -\> secondaire
- folliculite/furoncle -\> 0
- abcès cutané primaire -\> secondaire (panaris)
- impetigo primaire -\> impétigination
Germes = **Staph aureus**, **Strepto. pyogenes**
### Érysipèle
- strepto β-hémolytique (A,C,G), surtour **S. pogenes**
- adulte obèse, porte d\'entrée = ulcère, plaie
- membre inférieure, placard inflammatoire, **sans nécroise**
- complication = récidive
- Prélèvement: local = inutile, hémoc si forme grave, résistante
- traitement **oui**, amox orale ambulatoire, pas d\'AINS ni cortico
### Furoncle, anthra, furonculose
- Follicute profonde et nécrosante de tout le follicule pilo-sébacé
- **S. aureus producteur de LPV**
- diag clinique = nodlle inflammatoire avec nécrose au centre
- cemplication = abcès secondaire, **staphyloccice maligne de la
face** (thrombophlébite septique cérébrae = urgence)
- Prélèvement si lésion multiple, recherche LPV **inutile**
- traitement: pas d\'antibio forme simple, ne pas manipuler. Amox -AC
si fièvre, \> 5cm+++
### Panaris, onyxis, péri-onyxis staphyloccoqiue
- INfection aigǜe de la main la plus fréquence (pule doig,
sousungéulaire+++)
- **S. Aureus**
- Complication: lymphangite, phlegmon des gaines
- Prélèvement pendant drainage abcès
- traitement: pas d\'antibio si inflammation local, **chirurgie** si
abcès (douleur intense, pulsatile)
### Impétigo
- Dermo-épidermite superficielle
- **S. aureus** pays développés, **S. pyogènes** pays à faible
ressources
- **contagieux**, enfant
- adulte alcool, diabète = impétigo creusant nécrotique (S. pygenes)
- prélvement : dépistage SARM
- traitement : nettoyage eau savon surgras +
- local si peu étendu et crouteux : antiseptique, aicde fusidique
- systémique si bulleux, étendu : β-lactamine
#biochimie #nephro
Physiopathologie
- Sténose de l\'artère rénale : rein hypoperfusé =\> activation du système rénine angiotensine =\> augmentation rénine et par conséquent aldostérone, hypokaliémie
- Coarctaion de l\'aorte : hypoperfusion =\> activation du système rénine angiotensine
- Phéochromocytome : tumeur de la médullosurrénale =\> produit (nor)adrénaline
- Adénome de Conn : tumeur des surrénale =\> produit aldostérone =\> hypokaliémie et diminution rénine en réaction
- Syndrome de Cushing : compliqué mais augmentation résistance vasculaire et du débit cardiaque =\> aldostérone, rénine basse
- Acromégalie : rétention de sodium, expansion volémique
- Hyperthyroïdie : augmentation volume sanguin, débit cardiaque
- Correction PR dragmap. Resoumission car "mass ping". nixpkgs-review ne compile toujours pas..
## Dragmap :
Correction PR
- compliation ne fonctionne plus avec glibc : explique nixpkgs review. Mise àjour glibc
https://github.com/bminor/glibc/commit/64b1a44183a3094672ed304532bedb9acc707554
fait le 16 mai donc il faut <= glibc-2.37.9000.
On patche simplement la ligne fautive, en supprimant le pclose -> OK
- test fonctionnel
1. il faut générer hash du génome qui doit être décompressé
```sh
cd ~/code/human_genome_assets/sequence/GRCH38
gunzip GRCH38_full_analysis_set.fna.gz
```
On extrait à la main seulement le chr1 et renomme en chr1.fna
```nu
dragen-os --build-hash-table true --ht-reference chr1.fna
dragen-os -r sequence/GRCH38/ -1 SRR1518158_1.fastq.gz -2 SRR1518158_2.fastq.gz | save test.sam
```
Après tri du bam correspondant, ok