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#+title: Biochimie
[[id:0026928a-33af-432c-9bfe-3ec2d8f87a38][Pré-analytique en biochimie]]
* Examens
Gaz du sang
- [[id:8b651cd6-01a9-48d2-bc89-c9340affe2d9][Coxymétrie]]
- [[id:0286b98f-eb1f-41f0-80c5-ecfe06e243da][Créatine kinase]]
- [[id:02953d37-3891-43b1-9e07-cb4681e5e44c][Bilirubine]]
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- [[id:0aebd019-c8f1-4f88-8a6b-94e06eb14f64][Acides aminés]]
- [[id:0cd6155a-54ba-4718-a639-67944c6b1c47][Acide urique]]
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- [[id:20192370-bbe2-476b-beab-9eedb5bf243c][Immunoglobuline M]]
- [[id:257d79ff-411a-4ba7-83ed-459856b5d7fa][Phosphatase alcalines]]
- [[id:291d08be-d64c-49b2-b61a-1edd34b3d7ab][Préalbumine (transthyrétine)]]
- [[id:3093198d-a9d2-4464-a453-9b6bffb03841][Cholestérole LDL]]
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- [[id:92e0d3e0-ed8f-4285-8629-ec7160adedcc][CRP]]
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- [[id:d73e6583-b430-4ae0-9f82-dba175a91a9b][Immunoglobuline A]]
- [[id:d9c7eb89-3d73-4fa9-a734-9dd71515cc91][Haptoglobine]]
- [[id:e5519b58-b8fd-4ae1-9585-aa5223d72431][Cholestérol HDL]]
- [[id:f7fa1113-bc2f-4ca2-b99f-eb4a7f4ed346][Triglycérides]]
- [[id:b13e043b-bf21-422a-98e7-efb3c5efd5a5][β2-microglobuline]]
- [[id:7bb9024e-649c-4382-abf6-9db0be217d4d][CA 15-3]]
- [[id:d83dec28-0537-46a0-beb0-8f6e09c78f1e][CA 19-9]]
- [[id:d59e007e-2d26-42ef-b349-cade464c37f9][CA 125]]
- [[id:44fc26b7-6245-4e58-8d1e-6cb376fecd3a][estradiol]]
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- [[id:e618c88d-3a3a-483a-bb75-30dde2738c01][Calcium]]
- [[id:f7fa1113-bc2f-4ca2-b99f-eb4a7f4ed346][Triglycérides]]
- [[id:b86a1b39-27b0-43e3-8630-7840234e9c71][Acides biliaires]]
- [[id:bab652dd-fa28-4dba-941d-7e4b32902525][Phosphore inorganique]]
- [[id:bec091db-6da1-46ad-8c31-c55e551fbc36][Magnésium]]
- [[id:c691319f-47cc-4586-86c6-121dae677abf][Lipase]]
- [[id:d3c7d1e8-2219-4be5-86e1-34c6dbc77a70][LDH]]
- [[id:d70072d4-776f-4b80-8df7-0d2526ca269d][α-Amylase]]
[[id:6de5833a-cec5-4560-8e3d-36fde81cb1a7][Méthodes de dosage]]
[[id:2b3074d7-0afc-4429-8086-f51e0f85e291][Examens de biologie médicale délocalisé]]
* Maladies
[[id:b5b5ce7f-33f6-4561-9c81-d7de9d871c29][Diabète]]
[[id:e8a1e9bd-aa5a-4783-a5a8-7be278a8e924][Dysnatrémie]]
* Paramètres
#+title: Gentoo
* Astuces
** Wiki
[[https://wiki.gentoo.org/index.php?title=User:Alexdarcy/Buku][Créer une
page sur son espace personnal]] puis "move" pour la publier
** Police
Inspiration:
http://kev009.com/wp/2009/12/getting-beautiful-fonts-in-gentoo-linux/
J'ai juste utilisé eselect fontconfig + la configuration recommandée
** Portage avec git
/etc/portage/repos.conf/gentoo.conf [DEFAULT] main-repo = gentoo
[gentoo] location = /var/db/repos/gentoo sync-type = git sync-uri =
https://github.com/gentoo-mirror/gentoo auto-sync = yes sync-depth = 1
* Haskell
Pour débloquer un paquet, "marteau-piqueur"
#+begin_src sh
emerge -1u haskell-updater && haskell-updater --world -- -N --with-bdeps=y && emerge --depclean && haskell-updater -- @preserved-rebuild
#+end_src
Pour avoir les dernières versions, changer l'URL dans /etc/portage/repos.conf/eselect-repos.conf
[haskell]
sync-uri = https://github.com/gentoo-haskell/gentoo-haskell.git
* Guru
Tester avec =pkgcheck scan= Commiter avec =git commit -S -m "lol"=
* Packaging
[[denote:20240110T194143][Ebuild Gentoo pour Haskell]]
[[denote:20240608T163003][Ebuild Gentoo pour Julia]]
#+title: Diarrhées
#+filetags: bacterio viro
* Bactéries
** Clostridium difficile
- Bacille gram positif à bout carré, spores subterminales
- Anaérobie strict
- 1re cause diarrhées associées aux soins
*** Préanaytique
- seulement si diarrhée et >= 3 ans
*** Pathologies associée
- diarrhées : 10% nosocomiale, 10-25% post-antibio
- colite pseudo-membraneuse 95%
- complications: mégacôlin toxiuqe, perforation, choc toxique
- portage *asymptomatique*: 20-70% *nourrissons jusque 3 ans*, adulte <
3%
*** Facteur de virulence
- *toxines* A, B, adhésien, enzymes, spores
*** Diagnostic
- diarrhée + toxine selles ou souche toxinogène ou colite pseudo-membraneuse
- référence (fastidieux) = culture toxigénique, test de toxicité en
culture
- glutamate déshydogénase (GDF) par immuno-enzymatique = très bonne VPN => souche toxigène ou non
- recherche des toxine A et B: PCR (sensible mais peu spécifique) ou immunoenzymatique (spécifique)
=> *(GDH + ou PCR+) et toxine immuno + = diag*
*** Post-analytique
- pas de contrôle
- 6 jours redondance
*** Traitement
- arrêt antibio si possible, éviter ralentisseur transit, correction hydroélectrique
- *pas d'antibiogramme* = sensible métronidazole + vanco
- hygène = *contact*, isolement, lavage *mécanique* des mains, *Javel*.
Isolement levé 48h après arrêt des diarrhées
* Virale
GEA Adulte : norovirus > rotavirus > adénovirus > astrovirus
*** Rotavirus
- 1ere cause de gastroentérite aigüe chez l'*enfant* < 5 ans. Touche également adulte (ID, voyageur, contact enfant)
- Épidémies hivernales 6-24mois
- pas de vaccin
*** Norovirus
:PROPERTIES:
:CUSTOM_ID: norovirus-1
:END:
- 1ere cause de diarréhes virale chez l'*adulte*, 2e cause enfant < 5 ans
- Clinique:
- début brutal, asympto 1/3, durée 12-60h, incubation courte (1-2 jours)
- immunodéprimé : risque diarrhée chronique
- épidémies++ (collectivités)
- critères de Kaplan = vomissement > 50% sujet, incubation moyenne 1-2 j, durée 12-60h, pas de bactéries à la coproculture
- diagnostic selle : RT-PCR, 3 à 5 échantillonls. 50% positifs pour conclure
- précaution contact (gants, SHA, javel), arrêt maladie 48-72H après symptômes
- vaccin: 6semaine-6mois de vie
*** Autre
- Astrovirus : GEA modérée, tous les âges
- Adénovirus (40-41) : test rapide/RT-pcr, ttt sympto
- [[id:a54652d5-68c8-4668-aed9-50c9d719c207][Maladies infectieuses]]
- [[id:86fb6c69-d3dc-4ec1-a40f-9031d8ba5faf][Antibiotiques]]
- TODO [[id:49cb0f96-854c-4a00-b072-4d98a06d6dda][Bactéries]]
- [[denote:20240601T183312][Maladies infectieuses]]
- [[denote:20240515T224550][Antibiotiques]]
- TODO [[denote:20240612T233431][Bactéries]]
#+title: Biochimie
[[denote:20240627T181848][Pré-analytique en biochimie]]
* Examens
Gaz du sang
- [[denote:20240627T185229][Coxymétrie]]
[[denote:20240630T190452][Méthodes de dosage]]
[[denote:20240706T233035][Examens de biologie médicale délocalisé]]
* Maladies
[[denote:20240706T234445][Diabète]]
[[denote:20240707T214944][Dysnatrémie]]
* Paramètres
- [[denote:20240702T232402][Créatine kinase]]
- [[denote:20240630T235911][Bilirubine]]
- [[denote:20240702T230347][γGT (gammaglutamyl-transférase)]]
- [[denote:20240523T191349][Acides aminés]]
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- [[denote:20240630T185807][Transferrine]]
- [[denote:20240702T225415][Fer]]
- [[denote:20240630T232614][Immunoglobuline M]]
- [[denote:20240702T230230][Phosphatase alcalines]]
- [[denote:20240630T185207][Préalbumine (transthyrétine)]]
- [[denote:20240702T233233][Cholestérole LDL]]
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- [[denote:20240703T234403][CA 15-3]]
- [[denote:20240703T234423][CA 19-9]]
- [[denote:20240703T234443][CA 125]]
- [[denote:20240703T234502][estradiol]]
- [[denote:20240703T234522][FSH]]
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* TODO org-roam -> denote
SCHEDULED: <2024-07-18 Thu>
/Entered on/ [2024-07-17 Wed 19:09]